MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Phytoplasma australiense

Total Repeats: 557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010544	TTTGA	2	10	4349	4358	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010544	TAATA	2	10	4448	4457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010544	AATAT	2	10	4570	4579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010544	AAATT	2	10	4701	4710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010544	TTTAG	2	10	4826	4835	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010544	AAATA	2	10	6830	6839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010544	ATTTT	2	10	7208	7217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010544	TTAAA	2	10	7535	7544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010544	TAATA	2	10	7646	7655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010544	TAAAT	2	10	7876	7885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010544	TTTTA	2	10	8213	8222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010544	AATTT	2	10	8224	8233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010544	TAGCT	2	10	11573	11582	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010544	AAATT	2	10	11815	11824	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010544	CTATT	2	10	13073	13082	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010544	TATAA	2	10	13154	13163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010544	AAGAA	2	10	15905	15914	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010544	AAAAT	2	10	15988	15997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010544	ATTTT	2	10	16140	16149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010544	TAATA	2	10	16552	16561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010544	TAATA	2	10	16569	16578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010544	GGAAT	2	10	17007	17016	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010544	GAAAA	2	10	17265	17274	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010544	TATAA	2	10	18502	18511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010544	TAAAT	2	10	18527	18536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010544	TTGTT	2	10	19150	19159	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010544	TAAAA	2	10	19214	19223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010544	TAAAA	2	10	20493	20502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010544	TAAGT	2	10	21011	21020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010544	TATAT	2	10	31195	31204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010544	TATTT	2	10	31273	31282	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010544	AAAAC	2	10	33829	33838	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010544	TTTAA	2	10	35900	35909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010544	TTTTG	2	10	36613	36622	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010544	TGAAG	2	10	36626	36635	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010544	TATGA	2	10	36685	36694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010544	TTTTG	2	10	37502	37511	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010544	CCAGT	2	10	37776	37785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010544	TATTC	2	10	38301	38310	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010544	ATGTA	2	10	38449	38458	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010544	TTTAA	2	10	39950	39959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010544	TTTAA	2	10	40423	40432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010544	AAACC	2	10	45586	45595	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010544	AAAAT	2	10	49323	49332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010544	AATCA	2	10	49543	49552	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010544	TTATT	2	10	49569	49578	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010544	AGATT	2	10	52815	52824	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010544	ATTAA	2	10	52996	53005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010544	GAAAA	2	10	53840	53849	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010544	CTTCA	2	10	53858	53867	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010544	TTAAA	2	10	54099	54108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010544	TAATA	2	10	56240	56249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010544	TAATT	2	10	56841	56850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010544	TTTGT	2	10	56853	56862	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010544	AACAA	2	10	59840	59849	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010544	AATTT	2	10	60232	60241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010544	AATTA	2	10	62069	62078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010544	AATTC	2	10	63922	63931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010544	TAATC	2	10	72000	72009	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010544	AAATT	2	10	73119	73128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010544	TTGAT	2	10	75277	75286	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010544	ATTTT	2	10	75433	75442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010544	CTTTT	2	10	78249	78258	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010544	AATTA	2	10	79793	79802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010544	TAAAA	2	10	82446	82455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010544	TAAAT	2	10	83695	83704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010544	AAATA	2	10	83705	83714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010544	ACCCA	2	10	84017	84026	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_010544	CAAAG	2	10	84388	84397	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010544	AATTA	2	10	84453	84462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010544	TAAAT	2	10	87152	87161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010544	TAATA	2	10	88271	88280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010544	TTTAA	2	10	88616	88625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010544	CAATA	2	10	88923	88932	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010544	TTAAA	2	10	89005	89014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010544	GTTTT	2	10	90057	90066	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010544	CCAAA	2	10	92020	92029	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_010544	TTCTT	2	10	92104	92113	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010544	TTTTA	2	10	100817	100826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010544	CAAAA	2	10	101595	101604	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010544	AAATT	2	10	101875	101884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010544	ATTAA	2	10	103172	103181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010544	TTAAT	2	10	103187	103196	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010544	AGAAA	2	10	103331	103340	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010544	AAGTT	2	10	103446	103455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010544	ATATA	2	10	103526	103535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010544	TCAAA	2	10	103734	103743	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010544	TTTTG	2	10	103987	103996	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010544	AAAAC	2	10	104057	104066	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010544	AATTT	2	10	106058	106067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010544	TTTTG	2	10	109642	109651	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010544	CCAGT	2	10	109916	109925	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010544	TATTC	2	10	110512	110521	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010544	ATGTA	2	10	110660	110669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010544	TTAAT	2	10	112136	112145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010544	TTTCA	2	10	118325	118334	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010544	ATCAT	2	10	118509	118518	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010544	TTAAA	2	10	121502	121511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010544	TTTAT	2	10	123315	123324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010544	AAGTT	2	10	128108	128117	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010544	ATTTT	2	10	128528	128537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010544	ATTTT	2	10	128657	128666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010544	AATAA	2	10	129566	129575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010544	TATAA	2	10	130642	130651	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010544	ATTTT	2	10	130793	130802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010544	TGAAT	2	10	131137	131146	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010544	TATAA	2	10	132309	132318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010544	TATAA	2	10	132370	132379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010544	ACCAA	2	10	133434	133443	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_010544	ATTAA	2	10	133512	133521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010544	TTAAA	2	10	134567	134576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010544	TAAAA	2	10	134684	134693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010544	AATTT	2	10	136268	136277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010544	TAAAT	2	10	136534	136543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010544	TTTTA	2	10	136890	136899	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010544	TTTTG	2	10	140791	140800	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010544	ATTAT	2	10	142574	142583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010544	ATTAT	2	10	144047	144056	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010544	GAAAA	2	10	145614	145623	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010544	TTTAA	2	10	148212	148221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010544	AAAAT	2	10	150278	150287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010544	TTTCA	2	10	150296	150305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010544	GTTTT	2	10	150431	150440	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010544	GTTTT	2	10	151037	151046	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010544	AAAAC	2	10	151554	151563	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010544	GAAAA	3	15	151714	151728	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010544	ATTGA	2	10	152152	152161	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010544	TATTT	2	10	160831	160840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010544	ATATT	2	10	164170	164179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010544	CTTTT	2	10	164753	164762	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010544	TTGTT	2	10	167774	167783	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010544	TTTAA	2	10	168465	168474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010544	CAAAT	2	10	168564	168573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010544	TTTTG	2	10	171977	171986	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010544	CAAAA	2	10	173451	173460	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_010544	AAAAT	2	10	173797	173806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010544	TAAAT	2	10	173980	173989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010544	ATTTC	2	10	181387	181396	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010544	TGGTT	2	10	182141	182150	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010544	AAAAT	2	10	182675	182684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010544	TCAAA	2	10	184105	184114	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010544	ATTAA	2	10	184224	184233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010544	TTGTT	2	10	184618	184627	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010544	CTTTT	2	10	184798	184807	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_010544	TAAAT	2	10	188496	188505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010544	AAAAC	2	10	190134	190143	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_010544	TGTGT	2	10	190706	190715	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010544	GACAG	2	10	193220	193229	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_010544	CAAAA	2	10	193380	193389	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_010544	TTGCA	2	10	194396	194405	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_010544	ATTCA	2	10	194668	194677	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_010544	AAAAT	2	10	194721	194730	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010544	TATTT	2	10	195796	195805	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010544	TAATT	2	10	195888	195897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010544	GTTTT	2	10	196150	196159	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010544	AAAGA	2	10	196883	196892	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010544	AATTT	2	10	199968	199977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_010544	TGGAT	2	10	201110	201119	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010544	TGTTT	2	10	205346	205355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010544	ATATT	2	10	205649	205658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010544	ATAAA	2	10	207534	207543	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010544	AAATA	2	10	207860	207869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_010544	TTATT	2	10	210339	210348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010544	TAAAA	2	10	216201	216210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010544	CTTAA	2	10	216709	216718	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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170	NC_010544	CTTTT	2	10	218452	218461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_010544	ATTTA	2	10	218700	218709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010544	AAATA	2	10	218852	218861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010544	TTATT	2	10	219196	219205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010544	TTTGT	2	10	220130	220139	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_010544	TTTGT	2	10	228319	228328	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_010544	TTTTG	2	10	228473	228482	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_010544	TTTTG	2	10	230888	230897	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_010544	ATATT	2	10	249957	249966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_010544	TATTT	2	10	255057	255066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_010544	TTATA	2	10	255768	255777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_010544	TTTAA	2	10	256213	256222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_010544	TGGGT	2	10	335785	335794	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_010544	GTTTT	2	10	335844	335853	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
278	NC_010544	TTTTG	2	10	336487	336496	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_010544	CTTTT	2	10	343210	343219	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_010544	TGCAG	2	10	349806	349815	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_010544	ATTCA	2	10	350506	350515	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_010544	GAAAT	2	10	354227	354236	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_010544	ATTGT	2	10	358919	358928	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
293	NC_010544	TAAAA	2	10	365842	365851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_010544	TTTTC	2	10	367782	367791	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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486	NC_010544	CAAAA	2	10	755704	755713	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_010544	TTTTC	2	10	792587	792596	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

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