MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid D

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010543	AT	3	6	1195	1200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010543	AT	3	6	1216	1221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010543	TAA	2	6	1288	1293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010543	TAA	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010543	TAT	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010543	CATTA	2	10	1417	1426	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010543	A	7	7	1429	1435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010543	TTAA	2	8	1456	1463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010543	TA	3	6	2138	2143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010543	AGC	2	6	2191	2196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010543	CCA	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_010543	G	6	6	2203	2208	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010543	GAA	2	6	2229	2234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010543	CGA	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010543	CTTG	2	8	2260	2267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010543	AAT	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010543	A	7	7	3504	3510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010543	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010543	A	7	7	3544	3550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010543	TTAAA	2	10	3551	3560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010543	ATG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010543	CTG	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010543	TAA	2	6	6522	6527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010543	TTTG	2	8	6650	6657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010543	TAG	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010543	TTA	2	6	6684	6689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010543	AG	3	6	6729	6734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010543	TTA	2	6	6985	6990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010543	TAAAT	2	10	7008	7017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010543	TAA	2	6	7021	7026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010543	AGTTT	2	10	7056	7065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010543	TAT	2	6	7108	7113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010543	ATA	2	6	7123	7128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010543	A	6	6	7183	7188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010543	GTG	2	6	7191	7196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010543	T	6	6	7197	7202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010543	GTTA	2	8	7511	7518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010543	ATT	2	6	8294	8299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010543	TTGTA	2	10	8305	8314	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010543	TAAC	2	8	8382	8389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010543	TAT	2	6	8443	8448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010543	TAAG	2	8	8478	8485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010543	TAA	2	6	8507	8512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010543	GTGTT	2	10	8531	8540	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010543	AT	3	6	8546	8551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010543	TTAT	2	8	8582	8589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010543	TAA	2	6	8642	8647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010543	ATTA	2	8	8648	8655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010543	TAT	2	6	8659	8664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010543	TAA	2	6	8667	8672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010543	TAA	2	6	8685	8690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010543	ACTGTA	2	12	8718	8729	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010543	AGT	2	6	8735	8740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010543	TGTTAT	2	12	8746	8757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010543	AAT	2	6	8784	8789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010543	ACT	2	6	8824	8829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010543	ATA	2	6	9379	9384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010543	ACG	2	6	9992	9997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010543	T	6	6	10021	10026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010543	TTAC	2	8	10047	10054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010543	T	6	6	10155	10160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010543	CTT	2	6	10162	10167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010543	CGA	2	6	10219	10224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.