MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 1234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010520	GGTAA	2	10	9501	9510	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010520	TCGTG	2	10	10292	10301	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010520	TAAGT	2	10	12030	12039	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010520	AAAAT	2	10	13881	13890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010520	TTTAA	2	10	23651	23660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010520	ATTAA	2	10	23671	23680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010520	TATTT	2	10	23743	23752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010520	ATAAG	2	10	25709	25718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010520	TAAAT	2	10	27844	27853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010520	ATATA	2	10	28132	28141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010520	ATATT	2	10	31741	31750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010520	AATAA	2	10	31799	31808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010520	TAATA	2	10	35351	35360	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010520	ATAAA	2	10	35833	35842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010520	GGTAA	2	10	42902	42911	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010520	TCGTG	2	10	43693	43702	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010520	TAAGT	2	10	45431	45440	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010520	AAAAT	2	10	47282	47291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010520	TAATT	2	10	48517	48526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010520	GGTAA	2	10	49441	49450	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010520	TCGTG	2	10	50232	50241	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010520	TAAGT	2	10	51970	51979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010520	AAAAT	2	10	53821	53830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010520	TTATA	2	10	54332	54341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010520	GGTAA	2	10	57318	57327	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010520	TCGTG	2	10	58109	58118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010520	TAAGT	2	10	59847	59856	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010520	AAAAT	2	10	61698	61707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010520	TGATT	2	10	62034	62043	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010520	TTATA	2	10	63427	63436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010520	GGTAA	2	10	64322	64331	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010520	TCGTG	2	10	65113	65122	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010520	TAAGT	2	10	66851	66860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010520	AAAAT	2	10	68702	68711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010520	ATTAT	2	10	69950	69959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010520	GGTAA	2	10	70602	70611	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010520	TCGTG	2	10	71393	71402	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010520	TAAGT	2	10	73131	73140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010520	AAAAT	2	10	74982	74991	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010520	TTGAA	2	10	76334	76343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010520	GAATA	2	10	80421	80430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010520	AAATT	2	10	87512	87521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010520	ATTTA	2	10	89162	89171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010520	TACAA	2	10	89420	89429	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010520	TTTAA	2	10	89827	89836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010520	AAGTT	2	10	90721	90730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010520	TAAAT	2	10	92182	92191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010520	TATAA	2	10	93277	93286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010520	TAATA	2	10	94819	94828	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010520	GTTAT	2	10	113615	113624	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010520	TAAAA	2	10	116468	116477	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010520	TTCTA	2	10	119642	119651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010520	ATTTT	2	10	135256	135265	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010520	TCTAT	2	10	136721	136730	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010520	ATTAT	2	10	136778	136787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010520	ACTTA	2	10	148110	148119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_010520	TAATA	2	10	167242	167251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010520	ATATA	2	10	169760	169769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010520	AAATA	2	10	178305	178314	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010520	ATAAA	2	10	178318	178327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010520	ATTAT	2	10	178341	178350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010520	TAATT	2	10	180139	180148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010520	GTCTA	2	10	189056	189065	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010520	TATTT	2	10	189176	189185	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010520	AAATA	2	10	193091	193100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010520	TAAAG	2	10	193685	193694	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010520	TAATT	2	10	205996	206005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010520	TAAAA	2	10	220403	220412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010520	TAAAA	2	10	220475	220484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010520	AAATT	2	10	223309	223318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010520	ATTAT	2	10	225828	225837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010520	ATTTA	2	10	226270	226279	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010520	TAATT	2	10	230906	230915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010520	TTTTG	2	10	235003	235012	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010520	ATTAT	2	10	235079	235088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010520	ATTAT	2	10	237389	237398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010520	TAAAT	2	10	242149	242158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010520	GCAGA	2	10	243501	243510	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010520	AACAA	2	10	244279	244288	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010520	ATTTT	2	10	252888	252897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010520	AATTT	2	10	254384	254393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010520	TAGTA	2	10	263209	263218	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010520	TAATT	2	10	266164	266173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010520	GGTTT	2	10	267315	267324	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010520	AATTT	2	10	275445	275454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010520	ATTTT	2	10	278615	278624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010520	TATAT	2	10	279077	279086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010520	GAAAT	2	10	279835	279844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010520	ATATT	2	10	280797	280806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010520	TTTTA	2	10	281113	281122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010520	ATGGA	2	10	281180	281189	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010520	ATAGT	2	10	281209	281218	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010520	TTTTA	2	10	289762	289771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010520	AACTA	2	10	294592	294601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010520	AAAAT	2	10	294705	294714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010520	TGTTT	2	10	299043	299052	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010520	CTTAT	2	10	304396	304405	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010520	ACTTT	2	10	304660	304669	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010520	AAGAT	2	10	305566	305575	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010520	AATTT	2	10	315783	315792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010520	TTTTA	2	10	319988	319997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010520	TAATA	2	10	320247	320256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010520	AATAA	2	10	326863	326872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010520	ATTAT	2	10	332347	332356	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010520	TAAAA	2	10	333640	333649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010520	TAACT	2	10	335759	335768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010520	AAAAT	2	10	336016	336025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010520	GTAAA	2	10	337496	337505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010520	ATATA	2	10	338272	338281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010520	TTTTC	2	10	348747	348756	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010520	ATATA	2	10	357509	357518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010520	ATTAG	2	10	359538	359547	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010520	GTAAA	2	10	359668	359677	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010520	ATAAA	2	10	366183	366192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010520	ATATA	2	10	366202	366211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010520	TTATT	2	10	367409	367418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010520	TATTT	2	10	381733	381742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010520	AATAG	2	10	381867	381876	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010520	TTATT	2	10	387877	387886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010520	TTTTA	2	10	387996	388005	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010520	TTTTA	2	10	389159	389168	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010520	TCAAT	2	10	389298	389307	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010520	ATATA	2	10	389387	389396	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010520	AATAA	2	10	391454	391463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010520	ATTTA	2	10	393227	393236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010520	AATTA	2	10	393273	393282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010520	AAACA	2	10	398022	398031	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010520	AATTT	2	10	404079	404088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010520	AAATA	2	10	408961	408970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010520	AATAT	2	10	412042	412051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010520	ATTAA	2	10	412390	412399	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010520	AATTA	2	10	414115	414124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010520	TTAAT	2	10	419215	419224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010520	AAAAT	2	10	422095	422104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010520	TTTAG	2	10	422125	422134	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010520	TAAAA	2	10	424979	424988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010520	TATAA	2	10	436081	436090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010520	ATTTT	2	10	438400	438409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010520	TAAAA	2	10	438503	438512	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010520	TTTGA	2	10	445351	445360	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010520	AAAAT	2	10	446343	446352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010520	TCATA	2	10	452475	452484	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010520	TTGTA	2	10	452531	452540	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010520	ATTTA	2	10	455144	455153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010520	AAAAT	2	10	455223	455232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010520	ATAAA	2	10	466190	466199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010520	ATTTT	2	10	467939	467948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010520	AAATA	2	10	468003	468012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010520	AAAGT	2	10	472671	472680	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_010520	TAAAA	2	10	583440	583449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_010520	AAATT	2	10	672216	672225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_010520	AGTTA	2	10	756377	756386	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
273	NC_010520	TTGTA	2	10	756584	756593	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_010520	GTTTA	2	10	760855	760864	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
275	NC_010520	AACAG	2	10	762337	762346	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
276	NC_010520	ATATA	2	10	767688	767697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_010520	ATAAA	2	10	777554	777563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_010520	ATTTG	2	10	793666	793675	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_010520	AAAAT	2	10	812232	812241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_010520	ATATA	2	10	817996	818005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_010520	TAACA	2	10	819098	819107	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_010520	AATTA	2	10	821921	821930	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_010520	AAATA	2	10	832738	832747	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_010520	AGTAT	2	10	834267	834276	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
292	NC_010520	TAAAA	2	10	841897	841906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_010520	AGTAG	2	10	1411528	1411537	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

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