MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 11376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010520	GGA	2	6	1	6	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010520	TAA	2	6	1372	1377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010520	TTG	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010520	ATT	2	6	1468	1473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010520	TTA	2	6	1513	1518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010520	CTA	6	18	1534	1551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010520	TAT	2	6	1555	1560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010520	TAA	2	6	1594	1599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010520	AGG	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010520	AAT	2	6	2962	2967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010520	TAT	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010520	AGG	2	6	4396	4401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010520	ATA	2	6	8843	8848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010520	TTA	2	6	8878	8883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010520	AGA	2	6	8956	8961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010520	ATT	2	6	8965	8970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010520	TAT	2	6	8995	9000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010520	ATA	2	6	9005	9010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010520	GGC	2	6	9288	9293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010520	GCG	2	6	9346	9351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010520	ATA	2	6	9424	9429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010520	GCA	2	6	9598	9603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010520	GCA	2	6	9638	9643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010520	CGC	2	6	9645	9650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010520	TGA	2	6	9656	9661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010520	AGG	2	6	9714	9719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010520	CAG	2	6	9741	9746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010520	GAA	2	6	9933	9938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010520	GGC	2	6	9952	9957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010520	AGC	2	6	10161	10166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010520	GAA	2	6	10196	10201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010520	GGT	2	6	10269	10274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010520	GTC	2	6	10283	10288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010520	TTA	2	6	10340	10345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010520	AGG	2	6	10393	10398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010520	ATC	2	6	10418	10423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010520	CCT	2	6	10755	10760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010520	GAA	3	9	10776	10784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010520	GAA	2	6	11028	11033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010520	TAT	2	6	11127	11132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010520	GGA	2	6	11191	11196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010520	GCG	2	6	11225	11230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010520	AGA	2	6	11291	11296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010520	ACC	2	6	11427	11432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010520	TAC	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010520	GGA	2	6	11741	11746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010520	CGT	2	6	11854	11859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010520	TAG	2	6	11904	11909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010520	AGC	2	6	12086	12091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010520	ACC	2	6	12165	12170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010520	GAG	2	6	12637	12642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010520	GAA	2	6	12661	12666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010520	CGG	2	6	12884	12889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010520	ACC	2	6	13155	13160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_010520	CGG	2	6	13183	13188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010520	CCT	2	6	13243	13248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010520	GGT	2	6	13379	13384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010520	TCG	2	6	13494	13499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010520	CGT	2	6	13574	13579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010520	GAG	2	6	13623	13628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010520	GAA	2	6	13798	13803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010520	TAA	2	6	13860	13865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010520	CCA	2	6	14172	14177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010520	CCA	2	6	14251	14256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010520	TAA	2	6	14337	14342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010520	ATT	2	6	14349	14354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010520	TAA	2	6	14369	14374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010520	GGT	2	6	14877	14882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010520	ATA	2	6	19267	19272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010520	ATA	2	6	19357	19362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010520	AGG	2	6	21600	21605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010520	TTA	2	6	22024	22029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010520	AAC	2	6	22118	22123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010520	AGG	2	6	22295	22300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010520	ATT	2	6	23623	23628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010520	TAT	2	6	23710	23715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010520	TAA	3	9	23763	23771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010520	AAT	2	6	23863	23868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010520	TTA	2	6	24162	24167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010520	AAT	2	6	24240	24245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010520	AAT	2	6	24316	24321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010520	TTA	2	6	24364	24369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010520	TAT	2	6	24633	24638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010520	ATT	3	9	25722	25730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010520	ATT	2	6	25733	25738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010520	CAA	2	6	25748	25753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010520	TAA	2	6	25756	25761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010520	ATA	2	6	25764	25769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010520	ATA	2	6	25773	25778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010520	CCT	2	6	27800	27805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010520	TAC	2	6	27822	27827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010520	ATT	2	6	27855	27860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010520	ATT	2	6	27880	27885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010520	AAT	2	6	27929	27934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010520	TAA	2	6	27944	27949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010520	AGC	2	6	27999	28004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010520	ATA	3	9	28099	28107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010520	ATA	2	6	28144	28149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010520	TAT	2	6	28152	28157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010520	TAT	2	6	29845	29850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010520	TAA	2	6	29857	29862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010520	ATA	2	6	31177	31182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010520	TAA	2	6	31683	31688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010520	TAA	2	6	31714	31719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010520	TTA	2	6	31763	31768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010520	CAG	2	6	31973	31978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010520	TTC	2	6	31986	31991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010520	GTG	2	6	32028	32033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010520	ATA	2	6	32238	32243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010520	ATT	2	6	32277	32282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010520	AAG	2	6	32289	32294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010520	ATA	2	6	33954	33959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010520	ATT	2	6	33968	33973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010520	AGG	2	6	33981	33986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010520	TAT	2	6	34999	35004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010520	TAA	2	6	35295	35300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010520	ATT	2	6	35338	35343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010520	CAA	2	6	35729	35734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010520	GAG	2	6	35808	35813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010520	TTA	2	6	36577	36582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010520	AAG	2	6	37113	37118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010520	AAG	2	6	37130	37135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010520	TAA	2	6	37141	37146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010520	AGG	2	6	37188	37193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010520	TTA	2	6	37998	38003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010520	TAT	2	6	38850	38855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010520	ATA	2	6	39100	39105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010520	AAT	2	6	39131	39136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010520	AAT	2	6	39347	39352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010520	TAT	2	6	39359	39364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010520	TAG	2	6	39369	39374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010520	AGG	2	6	39391	39396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010520	TTA	2	6	40126	40131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010520	TTG	3	9	40166	40174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010520	ATA	2	6	42395	42400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010520	GTT	2	6	42443	42448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010520	ACA	2	6	42469	42474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010520	AAC	2	6	42506	42511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010520	GGC	2	6	42689	42694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010520	GCG	2	6	42747	42752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010520	ATA	2	6	42825	42830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010520	GCA	2	6	42999	43004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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