MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 24199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010520	A	9	9	643013	643021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_010520	TCT	2	6	643027	643032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_010520	AT	3	6	643039	643044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_010520	AT	3	6	643046	643051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_010520	AAG	2	6	643055	643060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_010520	ATTT	2	8	643070	643077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_010520	AT	3	6	643112	643117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_010520	AT	3	6	643119	643124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_010520	AAC	2	6	643136	643141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_010520	AT	3	6	643147	643152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_010520	TA	3	6	643157	643162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_010520	TTAAC	2	10	643172	643181	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4013	NC_010520	ATA	2	6	643190	643195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_010520	TAT	2	6	643210	643215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_010520	AT	3	6	643227	643232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_010520	ATA	2	6	643238	643243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_010520	AGT	2	6	643257	643262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_010520	TTTG	2	8	643263	643270	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_010520	AGA	2	6	643340	643345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_010520	AATA	2	8	643421	643428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_010520	TTTAC	2	10	643525	643534	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4022	NC_010520	ATT	2	6	643568	643573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_010520	GTT	2	6	643627	643632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_010520	ATA	2	6	643633	643638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_010520	GAAA	2	8	643649	643656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_010520	GAT	2	6	643669	643674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_010520	AGTT	2	8	643723	643730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_010520	AT	3	6	643768	643773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_010520	A	6	6	643784	643789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_010520	TA	3	6	643836	643841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_010520	A	6	6	643841	643846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_010520	TTTAAG	2	12	643847	643858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_010520	ATT	2	6	643905	643910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_010520	AT	3	6	644010	644015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_010520	ATT	2	6	644027	644032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_010520	AT	3	6	644066	644071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_010520	A	6	6	644078	644083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_010520	GTT	2	6	644110	644115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_010520	T	6	6	644134	644139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_010520	TTAA	2	8	644675	644682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_010520	TTA	2	6	644700	644705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_010520	A	6	6	644726	644731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_010520	TTTAT	2	10	644757	644766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_010520	TAA	2	6	644767	644772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_010520	TTA	2	6	644775	644780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_010520	ATA	2	6	644786	644791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_010520	TAT	2	6	644797	644802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_010520	ATA	2	6	644807	644812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_010520	AAT	2	6	644846	644851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_010520	ACA	2	6	644879	644884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_010520	ATA	2	6	644930	644935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_010520	ATT	2	6	644979	644984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_010520	TAATA	2	10	645018	645027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_010520	TTA	2	6	645030	645035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_010520	TATAA	2	10	645057	645066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_010520	AT	3	6	645114	645119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_010520	AT	3	6	645128	645133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_010520	AAT	2	6	645134	645139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_010520	AGG	2	6	645160	645165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_010520	AC	3	6	645571	645576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_010520	GT	3	6	645599	645604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_010520	T	6	6	645604	645609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_010520	TA	3	6	645641	645646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_010520	TAT	2	6	645668	645673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_010520	TA	3	6	645741	645746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_010520	ATT	2	6	645759	645764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_010520	TAA	2	6	645783	645788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_010520	ATG	2	6	645795	645800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_010520	ATA	3	9	645802	645810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_010520	AAT	2	6	645820	645825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_010520	AGAA	2	8	645888	645895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_010520	AAAT	2	8	645902	645909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_010520	ATA	2	6	645918	645923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_010520	A	7	7	645923	645929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_010520	GTAAT	2	10	645930	645939	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_010520	TTA	2	6	645941	645946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_010520	A	8	8	645998	646005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_010520	T	6	6	646008	646013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_010520	A	7	7	646019	646025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_010520	TA	3	6	646026	646031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_010520	TA	3	6	646041	646046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_010520	T	6	6	646067	646072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_010520	AATTA	2	10	646073	646082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_010520	CTT	2	6	646131	646136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_010520	G	6	6	646155	646160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_010520	TAA	2	6	647557	647562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_010520	TAA	2	6	647566	647571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_010520	TTA	2	6	647605	647610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_010520	TA	3	6	647635	647640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_010520	TAA	2	6	647654	647659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_010520	AATAT	2	10	647688	647697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_010520	GAA	2	6	647823	647828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_010520	ATC	2	6	647851	647856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_010520	AT	3	6	647875	647880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_010520	ATTAA	2	10	647914	647923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_010520	ATA	2	6	647927	647932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_010520	ATTAAA	2	12	647933	647944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_010520	A	7	7	647942	647948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_010520	ATA	2	6	647955	647960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_010520	ATA	2	6	647990	647995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_010520	TATT	2	8	648025	648032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_010520	TAA	2	6	648039	648044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_010520	CA	3	6	648049	648054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_010520	AATA	2	8	648058	648065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_010520	AAT	2	6	648085	648090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_010520	T	6	6	648101	648106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_010520	TAATA	2	10	649517	649526	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_010520	TAA	2	6	649534	649539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_010520	AT	3	6	649549	649554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_010520	ATA	2	6	649569	649574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_010520	ATTTT	2	10	649622	649631	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_010520	ATTT	2	8	649640	649647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_010520	AT	3	6	649651	649656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_010520	AATTA	2	10	649658	649667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_010520	AGA	2	6	649687	649692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4117	NC_010520	TATT	2	8	649730	649737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_010520	T	6	6	649736	649741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_010520	TTA	2	6	649755	649760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_010520	TAA	2	6	649789	649794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_010520	GAA	2	6	649812	649817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_010520	TA	3	6	649819	649824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_010520	TAC	2	6	650376	650381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_010520	A	6	6	650382	650387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_010520	GAG	2	6	650398	650403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_010520	AT	3	6	651302	651307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_010520	A	7	7	651329	651335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_010520	AAT	2	6	651384	651389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_010520	TAT	2	6	654054	654059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_010520	TA	3	6	654074	654079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_010520	AAAT	2	8	654085	654092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_010520	TAA	2	6	654109	654114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_010520	A	6	6	654113	654118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_010520	TAAA	2	8	654139	654146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_010520	TA	3	6	654166	654171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_010520	TTA	2	6	654304	654309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_010520	TTA	2	6	654320	654325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_010520	A	7	7	655420	655426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4140	NC_010520	AAT	2	6	655474	655479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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