MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 24199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010520	GA	3	6	504750	504755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010520	CCA	2	6	504902	504907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_010520	CCA	2	6	504984	504989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_010520	GAA	2	6	505110	505115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010520	TAT	2	6	505209	505214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010520	GGA	2	6	505273	505278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010520	AGAA	2	8	505281	505288	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_010520	GCG	2	6	505307	505312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_010520	AGA	2	6	505373	505378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010520	ACC	2	6	505509	505514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_010520	TAC	2	6	505528	505533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_010520	GGA	2	6	505823	505828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_010520	CGT	2	6	505936	505941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_010520	TAG	2	6	505986	505991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010520	TAAGT	2	10	506112	506121	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_010520	AGC	2	6	506168	506173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_010520	ACC	2	6	506247	506252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_010520	AGGT	2	8	506711	506718	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010520	GAG	2	6	506719	506724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010520	GAA	2	6	506743	506748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_010520	CGG	2	6	506966	506971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_010520	TGCT	2	8	507098	507105	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_010520	ACC	2	6	507237	507242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_010520	CGG	2	6	507265	507270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_010520	CCT	2	6	507325	507330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_010520	CG	3	6	507378	507383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_010520	GGT	2	6	507461	507466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_010520	TCG	2	6	507576	507581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_010520	CGT	2	6	507656	507661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_010520	GAG	2	6	507705	507710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_010520	GAA	2	6	507880	507885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_010520	TAA	2	6	507942	507947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010520	AAAAT	2	10	507963	507972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_010520	A	6	6	508004	508009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_010520	ACTC	2	8	508032	508039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_010520	GAG	2	6	508049	508054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_010520	ATTTTT	2	12	508295	508306	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_010520	ATA	2	6	508315	508320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_010520	AT	4	8	508324	508331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_010520	AATA	2	8	508357	508364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_010520	ATC	2	6	508428	508433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_010520	AT	3	6	508487	508492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_010520	A	7	7	508529	508535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010520	TAG	2	6	508563	508568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_010520	GAG	2	6	508616	508621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010520	AGT	2	6	508624	508629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010520	AT	3	6	508714	508719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_010520	T	6	6	508719	508724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_010520	TGTTA	2	10	509635	509644	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_010520	ATT	2	6	509657	509662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_010520	T	7	7	509697	509703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010520	AT	4	8	509704	509711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010520	ATA	2	6	509734	509739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_010520	GA	3	6	509744	509749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_010520	AAAT	2	8	510494	510501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_010520	TCT	2	6	510519	510524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_010520	TAT	2	6	510530	510535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_010520	AAT	2	6	510570	510575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_010520	ATT	2	6	510595	510600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_010520	T	6	6	510607	510612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_010520	TTA	2	6	510628	510633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010520	ATT	2	6	510652	510657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_010520	A	6	6	510665	510670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010520	TTTA	2	8	510672	510679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_010520	GTA	3	9	510685	510693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3067	NC_010520	GAAA	2	8	510845	510852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_010520	A	9	9	510901	510909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_010520	AAAGCA	2	12	510929	510940	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3070	NC_010520	AT	3	6	510951	510956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_010520	TTA	2	6	511003	511008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010520	TAA	2	6	511075	511080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_010520	CTT	2	6	511093	511098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_010520	ATG	2	6	511109	511114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_010520	A	7	7	511146	511152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_010520	ATA	2	6	511164	511169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_010520	AATA	2	8	511201	511208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_010520	ATAAA	2	10	512604	512613	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_010520	A	7	7	512611	512617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_010520	TAAA	2	8	512622	512629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_010520	TAAA	2	8	512636	512643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_010520	AG	3	6	512650	512655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_010520	TAAA	2	8	512658	512665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_010520	A	6	6	512663	512668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_010520	AGTA	2	8	512671	512678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_010520	A	6	6	512678	512683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_010520	ATTG	2	8	512708	512715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_010520	TAAT	2	8	514685	514692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_010520	ATA	2	6	514708	514713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_010520	TTA	2	6	514731	514736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_010520	TAAA	2	8	514744	514751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_010520	TA	5	10	514769	514778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_010520	ATA	3	9	514776	514784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_010520	AT	3	6	514799	514804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_010520	ATTACT	2	12	515887	515898	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3098	NC_010520	GAA	2	6	515997	516002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_010520	T	7	7	516102	516108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_010520	AAG	2	6	516137	516142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_010520	ATA	2	6	516151	516156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_010520	TTA	2	6	516171	516176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_010520	AT	3	6	516220	516225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010520	TTA	2	6	517049	517054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_010520	TAA	2	6	517083	517088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_010520	T	6	6	517099	517104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_010520	AGA	2	6	517107	517112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_010520	TA	3	6	517163	517168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010520	ATAA	2	8	517173	517180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_010520	AGTA	2	8	517202	517209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010520	AAAGG	2	10	517263	517272	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_010520	ATTT	2	8	517351	517358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_010520	TTTA	2	8	517393	517400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_010520	T	6	6	517447	517452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_010520	TGA	2	6	517458	517463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3117	NC_010520	AGG	2	6	517526	517531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_010520	TTA	2	6	519562	519567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_010520	TAA	2	6	519624	519629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010520	TATT	2	8	520070	520077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_010520	TAA	2	6	520080	520085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_010520	ACC	2	6	520118	520123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_010520	CAT	2	6	520138	520143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_010520	CCCT	2	8	521101	521108	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3125	NC_010520	TTA	2	6	521138	521143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_010520	ATTT	2	8	521151	521158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_010520	T	6	6	521156	521161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_010520	T	8	8	521178	521185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_010520	TA	3	6	521196	521201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010520	TA	3	6	521223	521228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010520	TA	3	6	521235	521240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_010520	TA	3	6	521249	521254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_010520	CCT	2	6	522109	522114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3134	NC_010520	ATATTA	2	12	522118	522129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_010520	AAT	2	6	522137	522142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_010520	GGAT	2	8	522159	522166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_010520	TA	3	6	522248	522253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_010520	T	6	6	522297	522302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3274	NC_010520	TAAA	2	8	539986	539993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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