MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra chromosome

Total Repeats: 517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010516	TCTATT	2	12	1589	1600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010516	ATATAA	2	12	30521	30532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010516	TAAAAG	2	12	33839	33850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010516	AATATA	2	12	41277	41288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010516	TAAAAA	2	12	84341	84352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010516	AATAAA	2	12	95195	95206	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010516	TTTCAA	2	12	100297	100308	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010516	TATTAA	2	12	120266	120277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010516	ACATTA	2	12	165539	165550	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010516	TAAAAA	2	12	165722	165733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010516	AAGGAA	2	12	168296	168307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010516	AAACTT	2	12	169354	169365	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010516	TTTATT	2	12	171876	171887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010516	ATATTT	2	12	185546	185557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010516	TTTTTA	2	12	196172	196183	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010516	TTTAAT	2	12	196381	196392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010516	AATATT	2	12	215523	215534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010516	ATTAAT	2	12	215575	215586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010516	ATTAAT	2	12	216692	216703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010516	ATTATA	2	12	223204	223215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010516	AATTAT	2	12	223226	223237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010516	AACAGA	2	12	236509	236520	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010516	ATTTTA	2	12	241407	241418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010516	TTTAAT	2	12	259415	259426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010516	AATAAA	2	12	267192	267203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010516	ATTTAA	2	12	269834	269845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010516	ATTAAA	2	12	282344	282355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010516	TTTATA	2	12	286010	286021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010516	TTGTAA	2	12	310434	310445	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010516	TTTATA	2	12	312877	312888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010516	AAAATA	2	12	326675	326686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010516	TTAAAA	2	12	337240	337251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010516	TAATTT	2	12	353265	353276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010516	TTTTTA	2	12	353378	353389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010516	TAATTT	2	12	364210	364221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010516	TAAAAG	2	12	367062	367073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010516	AAAATA	2	12	377082	377093	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010516	TAAATA	2	12	377112	377123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010516	TTTAAT	2	12	398016	398027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010516	ATTAAA	2	12	407047	407058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010516	TAATAT	2	12	410061	410072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010516	GAGATC	2	12	412122	412133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010516	TATAAA	2	12	418671	418682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010516	TGTGAG	2	12	418903	418914	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010516	TAATAT	2	12	425955	425966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010516	ATTTTA	2	12	428682	428693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010516	TATTTT	2	12	432695	432706	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010516	TAAATA	2	12	438935	438946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010516	TATTTT	2	12	439166	439177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010516	TTAAAA	2	12	449156	449167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010516	AAAATA	2	12	464930	464941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010516	ATTGTA	2	12	472406	472417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010516	AGAATA	2	12	472451	472462	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010516	TTTATT	2	12	483001	483012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010516	AATAGC	2	12	486431	486442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010516	TTTATT	2	12	489804	489815	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010516	ATATAA	2	12	494055	494066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010516	TTAATA	2	12	494670	494681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010516	TAGGTA	2	12	508669	508680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010516	ATTAAT	2	12	516519	516530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010516	ATTAAA	2	12	517869	517880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010516	TTCAAT	2	12	525715	525726	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010516	AAAGCA	2	12	528151	528162	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010516	ATATTA	2	12	538999	539010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010516	GTATTA	2	12	539196	539207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010516	TTTAAT	2	12	544032	544043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010516	CTAAAT	2	12	545773	545784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010516	TTTTTA	2	12	547490	547501	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010516	TTAAAA	2	12	549866	549877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010516	TAAAAT	2	12	555162	555173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010516	AAAACA	2	12	559972	559983	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010516	TGTAAA	2	12	560134	560145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010516	GTTAAT	2	12	565670	565681	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010516	ATTAAA	2	12	567404	567415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010516	TAAATA	2	12	570813	570824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010516	TTAATT	2	12	578788	578799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010516	ATTAAA	2	12	579020	579031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010516	TTTATT	2	12	586299	586310	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010516	AAAATA	2	12	592329	592340	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010516	TTATAT	2	12	596629	596640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010516	TATAAA	2	12	601812	601823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010516	AATTTT	2	12	611407	611418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010516	ATTAAA	2	12	611452	611463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010516	ATATTT	2	12	611511	611522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010516	TTATTT	2	12	611530	611541	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010516	TAAAAA	2	12	634295	634306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010516	TTTAAT	2	12	634311	634322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010516	TTAAAA	2	12	634431	634442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010516	TTTTAA	2	12	641016	641027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010516	TTTAAA	2	12	643876	643887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010516	TTTAAG	2	12	647070	647081	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010516	ATTAAA	2	12	650863	650874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010516	TAAAAA	2	12	659543	659554	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010516	GTATTA	2	12	665134	665145	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010516	TTTTAC	2	12	669860	669871	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010516	TTTAAT	2	12	670914	670925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010516	AATATT	2	12	671043	671054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010516	ATTTTT	2	12	675205	675216	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010516	TTTAAT	2	12	677493	677504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010516	TAAAAA	2	12	683371	683382	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010516	ATTTTA	2	12	695647	695658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010516	AAATTA	2	12	697223	697234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010516	TATTGT	2	12	700801	700812	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010516	ATGGAA	2	12	723711	723722	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010516	TTTTTA	2	12	731973	731984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010516	TTATAA	2	12	736223	736234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010516	TTTAAT	2	12	738514	738525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010516	TAAATA	2	12	740199	740210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010516	TAAATA	2	12	747960	747971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010516	TTTGAA	2	12	756169	756180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010516	AATATA	2	12	764089	764100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010516	AAAATA	2	12	767272	767283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010516	TAAATA	2	12	767302	767313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010516	TTAAAC	2	12	767580	767591	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010516	GAATAA	2	12	771876	771887	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010516	TTATAA	2	12	776058	776069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010516	AAATAA	2	12	790203	790214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010516	TTAAAT	2	12	799841	799852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010516	ATAACA	2	12	802475	802486	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010516	AATTAA	2	12	823922	823933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010516	ATTATA	2	12	833167	833178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010516	AATATA	2	12	841382	841393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010516	TAATGA	2	12	864358	864369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010516	AAAACA	2	12	871938	871949	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010516	TATTAA	2	12	878135	878146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010516	ATTAAT	2	12	880670	880681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010516	ATTTTT	2	12	891430	891441	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010516	ATTAAT	2	12	893931	893942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010516	GAAAAA	2	12	894257	894268	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010516	ATTAAA	2	12	903326	903337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010516	ATTAAA	2	12	911451	911462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010516	TTTAAT	2	12	913209	913220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010516	AATTAA	2	12	913440	913451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010516	TAAAAT	2	12	921951	921962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_010516	AATATA	2	12	1638624	1638635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_010516	TAAAGT	2	12	1645296	1645307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_010516	ATCTTA	2	12	1667677	1667688	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
265	NC_010516	TTTAAT	2	12	1679247	1679258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_010516	ATTTAT	2	12	1686029	1686040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_010516	AACAAA	2	12	1687666	1687677	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
268	NC_010516	GAGTAC	2	12	1692574	1692585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
269	NC_010516	AATATA	2	12	1708441	1708452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_010516	TATTAA	2	12	1722723	1722734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_010516	TAACAG	2	12	1724914	1724925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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280	NC_010516	AGTTAT	2	12	1777284	1777295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_010516	TAAATT	2	12	1808174	1808185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_010516	ATTTAA	2	12	1820634	1820645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_010516	ATTTAA	2	12	1826279	1826290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_010516	TTAAAT	2	12	1826516	1826527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_010516	TTTAAA	2	12	1878896	1878907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_010516	ATATAA	2	12	1878958	1878969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_010516	TATAAA	2	12	1906606	1906617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_010516	ATTTAA	2	12	1940240	1940251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_010516	TAAAAT	2	12	2672331	2672342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_010516	AATTAT	2	12	2674027	2674038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_010516	TATTTT	2	12	2678918	2678929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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393	NC_010516	TATCTT	2	12	2713140	2713151	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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