MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra chromosome

Total Repeats: 24114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010516	GGA	2	6	25	30	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010516	TAA	2	6	1396	1401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010516	TTAT	2	8	1406	1413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010516	TTG	2	6	1414	1419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010516	ATT	2	6	1492	1497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010516	TTA	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010516	CAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010516	CTA	6	18	1558	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010516	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010516	TCTATT	2	12	1589	1600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010516	TAA	2	6	1618	1623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010516	AGG	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010516	TA	3	6	2972	2977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010516	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010516	A	6	6	2998	3003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010516	TAT	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010516	TAAT	2	8	3014	3021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010516	AGG	2	6	4419	4424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010516	ATA	2	6	8956	8961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010516	TTA	2	6	8991	8996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010516	A	6	6	9011	9016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010516	A	9	9	9051	9059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010516	TTAA	2	8	9089	9096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010516	ATA	2	6	9118	9123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010516	TAA	2	6	9172	9177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010516	A	6	6	9199	9204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010516	AAC	2	6	9218	9223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010516	GGC	2	6	9401	9406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010516	CTTC	2	8	9438	9445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010516	GCG	2	6	9459	9464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010516	CATAA	2	10	9536	9545	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010516	T	7	7	9559	9565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010516	GGTAA	2	10	9614	9623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010516	GCA	2	6	9711	9716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010516	GCA	2	6	9751	9756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010516	CGC	2	6	9758	9763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010516	TGA	2	6	9769	9774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010516	AGG	2	6	9827	9832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010516	CAG	2	6	9854	9859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010516	GAA	2	6	10046	10051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010516	GGC	2	6	10065	10070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010516	AGC	2	6	10274	10279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010516	GAA	2	6	10309	10314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010516	GGT	2	6	10382	10387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010516	GTC	2	6	10396	10401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010516	TCGTG	2	10	10405	10414	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010516	TTA	2	6	10453	10458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010516	AGG	2	6	10506	10511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010516	ATC	2	6	10531	10536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010516	AC	3	6	10558	10563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010516	GGTA	2	8	10574	10581	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010516	AC	3	6	10727	10732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010516	CCT	2	6	10868	10873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010516	GAA	3	9	10889	10897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010516	TTCT	2	8	10900	10907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010516	GA	3	6	10934	10939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010516	TA	3	6	10998	11003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010516	GAA	2	6	11079	11084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010516	GGA	2	6	11242	11247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010516	AGAA	2	8	11250	11257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010516	GCG	2	6	11276	11281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010516	AGA	2	6	11342	11347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010516	ACC	2	6	11478	11483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010516	TAC	2	6	11497	11502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010516	GGA	2	6	11792	11797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010516	CGT	2	6	11905	11910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010516	TAG	2	6	11955	11960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010516	TAAGT	2	10	12081	12090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010516	AGC	2	6	12137	12142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010516	ACC	2	6	12216	12221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010516	AGGT	2	8	12680	12687	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010516	GAG	2	6	12688	12693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010516	GAA	2	6	12712	12717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010516	CGG	2	6	12935	12940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010516	TGCT	2	8	13067	13074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010516	ACC	2	6	13206	13211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010516	CGG	2	6	13234	13239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010516	CCT	2	6	13294	13299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010516	CG	3	6	13347	13352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010516	GGT	2	6	13430	13435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010516	TCG	2	6	13545	13550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010516	CGT	2	6	13625	13630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010516	GAG	2	6	13674	13679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010516	GAA	2	6	13849	13854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010516	TAA	2	6	13911	13916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010516	AAAAT	2	10	13932	13941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010516	GA	3	6	13957	13962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010516	TTG	2	6	13975	13980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010516	A	6	6	14001	14006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010516	CCA	2	6	14222	14227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010516	CCA	2	6	14301	14306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010516	T	7	7	14345	14351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010516	A	6	6	14362	14367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010516	TAA	2	6	14387	14392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010516	ATT	2	6	14399	14404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010516	TAA	2	6	14419	14424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010516	TA	3	6	14430	14435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010516	GGT	2	6	14927	14932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010516	ATA	2	6	19317	19322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010516	T	6	6	19377	19382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010516	ATA	2	6	19407	19412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010516	TA	3	6	19417	19422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010516	AATT	2	8	19426	19433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010516	GA	3	6	20229	20234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010516	TGA	2	6	20240	20245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010516	AGG	2	6	21650	21655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010516	TTA	2	6	22074	22079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010516	AG	3	6	22143	22148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010516	TAA	2	6	22167	22172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010516	AG	3	6	22238	22243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010516	T	7	7	22310	22316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010516	ATTAT	2	10	22317	22326	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010516	TATT	2	8	22354	22361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010516	AATA	2	8	22371	22378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010516	ATT	2	6	23673	23678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010516	TA	4	8	23693	23700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010516	TTTAA	2	10	23701	23710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010516	ATTAA	2	10	23721	23730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010516	TAT	2	6	23760	23765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010516	TAAA	2	8	23770	23777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010516	TATTT	2	10	23793	23802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010516	TAA	2	6	23813	23818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010516	AAT	2	6	23914	23919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010516	GA	3	6	23944	23949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010516	TC	3	6	24023	24028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_010516	T	6	6	24172	24177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010516	A	7	7	24182	24188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010516	TTA	2	6	24213	24218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010516	GAA	2	6	24276	24281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010516	AAT	2	6	24291	24296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010516	ATTT	2	8	24326	24333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010516	TAG	2	6	24337	24342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010516	TA	4	8	24359	24366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010516	AAT	2	6	24367	24372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010516	AT	3	6	24380	24385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010516	AT	3	6	24390	24395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010516	TTA	2	6	24414	24419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010516	A	8	8	24439	24446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010516	GA	3	6	24451	24456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010516	TC	3	6	24530	24535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010516	TA	3	6	24545	24550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010516	TAT	2	6	24683	24688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010516	AT	3	6	24723	24728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010516	ATAA	2	8	24812	24819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010516	A	6	6	25737	25742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010516	A	7	7	25786	25792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010516	GCA	2	6	25802	25807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_010516	TAA	2	6	25843	25848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010516	AAT	2	6	25853	25858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_010516	T	7	7	46064	46070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_010516	TTAA	2	8	48197	48204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_010516	AC	3	6	56507	56512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
437	NC_010516	CCT	2	6	56648	56653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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