MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8 chromosome

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010482	TTTAA	2	10	2466	2475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010482	ACTCA	2	10	9276	9285	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010482	AGATG	2	10	10632	10641	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010482	AACTG	2	10	13981	13990	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010482	AGCTC	2	10	16853	16862	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_010482	TGAGG	2	10	42296	42305	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010482	ATTTA	2	10	47690	47699	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010482	TCCCC	2	10	64169	64178	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_010482	CCGGG	2	10	74890	74899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_010482	ACCTC	2	10	79122	79131	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_010482	GAGGG	2	10	79444	79453	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010482	TAAAA	2	10	82079	82088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010482	TCCGG	2	10	88700	88709	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_010482	AATTT	2	10	91757	91766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010482	TGGTG	2	10	93945	93954	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010482	TAACA	2	10	106544	106553	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010482	CATAC	2	10	124652	124661	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_010482	ATAAA	2	10	137277	137286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010482	TTTTG	2	10	174592	174601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010482	GTCAG	2	10	177354	177363	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010482	ATCCA	2	10	177438	177447	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_010482	TCACT	2	10	184710	184719	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010482	ATAAA	2	10	217139	217148	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010482	TAGGA	2	10	217955	217964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010482	GATAT	2	10	219980	219989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010482	CATAA	2	10	234192	234201	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010482	GTAGC	2	10	250627	250636	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010482	TTTTA	2	10	261454	261463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010482	TTTAA	2	10	283857	283866	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010482	TCATA	2	10	283917	283926	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010482	CCGCT	2	10	286025	286034	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_010482	GAGCT	2	10	290414	290423	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010482	ATGAG	2	10	302904	302913	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010482	ATAAA	2	10	318166	318175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010482	AGCGG	2	10	322912	322921	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010482	GAGGG	2	10	325983	325992	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010482	AGTTA	2	10	330540	330549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010482	CCCTT	2	10	346813	346822	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_010482	GTTAT	2	10	348807	348816	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010482	GAGCG	2	10	357642	357651	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010482	AACCC	2	10	357925	357934	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_010482	TTAAG	2	10	374901	374910	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010482	AAAGT	2	10	374924	374933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010482	CGTCC	2	10	410365	410374	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_010482	TAAAA	2	10	430104	430113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010482	TTAAT	2	10	431901	431910	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010482	GGGGA	2	10	431924	431933	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010482	AGCTT	2	10	444125	444134	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010482	TCCCT	2	10	445087	445096	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_010482	CTATC	2	10	446227	446236	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010482	ACTTT	2	10	488704	488713	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010482	ATATA	2	10	540500	540509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010482	TAAAT	2	10	564377	564386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010482	CTTAA	2	10	578908	578917	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010482	TTAGC	2	10	595621	595630	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010482	TGAAG	2	10	595682	595691	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010482	AGATC	2	10	614345	614354	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010482	TTAAC	2	10	626116	626125	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010482	CTATG	2	10	628425	628434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010482	AGGGA	2	10	628535	628544	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010482	GGAGA	2	10	628660	628669	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010482	ATCCA	2	10	631932	631941	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_010482	GAGCT	2	10	632395	632404	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010482	GGAAG	2	10	670389	670398	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010482	TTTAA	2	10	680854	680863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010482	CTGCA	2	10	682037	682046	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_010482	TCCCT	2	10	686200	686209	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_010482	TCCCC	2	10	686405	686414	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
69	NC_010482	GGCAT	2	10	689702	689711	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010482	ACAGC	2	10	699133	699142	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_010482	TCCCT	2	10	704854	704863	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_010482	GCTTT	2	10	729140	729149	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010482	AACAG	2	10	731880	731889	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010482	TAACA	2	10	732247	732256	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010482	CTTAA	2	10	734009	734018	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010482	ATCCA	2	10	739849	739858	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_010482	AAAGT	2	10	741813	741822	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010482	TTTTA	2	10	742345	742354	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010482	AGTTA	2	10	745385	745394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010482	TCGAG	2	10	754469	754478	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010482	TTATA	2	10	768042	768051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010482	GGACC	2	10	768087	768096	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_010482	CTCAG	2	10	768513	768522	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_010482	ATATG	2	10	844639	844648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010482	CTCCG	2	10	844660	844669	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_010482	ATGGG	2	10	845624	845633	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010482	ATTTG	2	10	878060	878069	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010482	ATTTT	2	10	900408	900417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010482	TGAAG	2	10	913624	913633	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010482	AATAA	2	10	918801	918810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010482	TTGAG	2	10	930180	930189	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010482	ACTTC	2	10	973463	973472	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010482	AGAGA	2	10	1013294	1013303	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010482	CCCCT	2	10	1016278	1016287	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
95	NC_010482	GAAAT	2	10	1016301	1016310	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010482	AGTAG	2	10	1029539	1029548	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010482	GTGAG	2	10	1029657	1029666	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010482	AGAAA	2	10	1045608	1045617	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010482	ACCTC	2	10	1052435	1052444	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_010482	TGAAA	2	10	1062947	1062956	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010482	ATTTT	2	10	1095749	1095758	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010482	TGAGG	2	10	1103224	1103233	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010482	ATAGC	2	10	1117824	1117833	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010482	GGCCC	2	10	1161839	1161848	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_010482	CGATT	2	10	1224114	1224123	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010482	CTTCT	2	10	1243790	1243799	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_010482	ATGTA	2	10	1248019	1248028	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010482	AACGA	2	10	1270665	1270674	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010482	GGGTG	2	10	1276887	1276896	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010482	TAAAA	2	10	1301019	1301028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010482	CGAAG	2	10	1327382	1327391	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010482	GGCTC	2	10	1328219	1328228	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_010482	CGGTC	2	10	1328568	1328577	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_010482	CCGCC	2	10	1329186	1329195	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
115	NC_010482	TCCCA	2	10	1339050	1339059	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_010482	GGGAT	2	10	1342453	1342462	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010482	CTCAG	2	10	1346260	1346269	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_010482	ATTAA	2	10	1362660	1362669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010482	AACTT	2	10	1398120	1398129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010482	ATAGA	2	10	1405568	1405577	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010482	CTTTA	2	10	1405859	1405868	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010482	GATAA	2	10	1416646	1416655	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010482	GAGCG	2	10	1417581	1417590	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010482	ACTTA	2	10	1418122	1418131	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010482	ATAAA	2	10	1447332	1447341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010482	TTTTA	2	10	1449952	1449961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010482	AAATT	2	10	1482294	1482303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010482	CCGCT	2	10	1507977	1507986	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_010482	GGAAT	2	10	1526083	1526092	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010482	CTAAC	2	10	1537653	1537662	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_010482	AGCCA	2	10	1559601	1559610	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_010482	AGCTC	2	10	1588795	1588804	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.