MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8 chromosome

Total Repeats: 3397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010482	ATC	2	6	300247	300252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_010482	CTTA	2	8	302710	302717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_010482	TGAA	2	8	302756	302763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010482	TCCA	2	8	302805	302812	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_010482	CTC	2	6	302866	302871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_010482	ATGAG	2	10	302904	302913	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010482	GGA	2	6	302926	302931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010482	T	6	6	308292	308297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010482	CAT	2	6	314838	314843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010482	ATAAA	2	10	318166	318175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010482	A	6	6	318173	318178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010482	CCT	2	6	321585	321590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_010482	GAA	2	6	321591	321596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010482	ATA	2	6	321649	321654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_010482	A	6	6	321656	321661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010482	AGCGG	2	10	322912	322921	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
517	NC_010482	GAG	2	6	325944	325949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010482	GAGGG	2	10	325983	325992	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010482	GAA	2	6	326016	326021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010482	ATA	2	6	326033	326038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010482	CTG	2	6	326073	326078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010482	AGG	2	6	327248	327253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010482	A	6	6	327271	327276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010482	CAC	2	6	328730	328735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_010482	A	6	6	328757	328762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010482	AGTTA	2	10	330540	330549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010482	GAT	2	6	332916	332921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010482	CCT	2	6	336888	336893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_010482	TTC	2	6	336926	336931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_010482	GAG	2	6	336940	336945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010482	AT	3	6	336973	336978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010482	TAA	2	6	337024	337029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010482	TCT	2	6	337048	337053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_010482	ATCT	2	8	337235	337242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
535	NC_010482	A	6	6	337349	337354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010482	AT	3	6	337373	337378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010482	CATA	2	8	337387	337394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
538	NC_010482	TTA	2	6	337415	337420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010482	AGC	2	6	337432	337437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_010482	CCT	2	6	339078	339083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_010482	T	6	6	339083	339088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010482	TGA	2	6	339733	339738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_010482	AAG	2	6	341800	341805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010482	ATT	2	6	341809	341814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010482	TAT	3	9	341835	341843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010482	CCT	3	9	341867	341875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_010482	TGT	2	6	341973	341978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010482	TACA	2	8	344904	344911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_010482	AT	3	6	344921	344926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010482	TTA	2	6	344966	344971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010482	AAT	2	6	344983	344988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010482	CCCTT	2	10	346813	346822	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
553	NC_010482	ATT	2	6	346827	346832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010482	ATAA	2	8	346856	346863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010482	TTA	2	6	346883	346888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010482	CCCT	2	8	348726	348733	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
557	NC_010482	ATT	2	6	348776	348781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010482	GTTAT	2	10	348807	348816	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010482	TA	3	6	348873	348878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010482	TAT	2	6	348908	348913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010482	ATA	2	6	348929	348934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010482	TA	3	6	348963	348968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_010482	GAA	2	6	348988	348993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010482	GAGG	2	8	353970	353977	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010482	A	6	6	353988	353993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010482	CCT	2	6	355034	355039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_010482	CCT	2	6	355082	355087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_010482	TCC	2	6	355099	355104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_010482	CT	3	6	355108	355113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_010482	TA	3	6	355149	355154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010482	TA	3	6	356147	356152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010482	ATT	2	6	356174	356179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010482	AGG	2	6	356349	356354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_010482	ATG	3	9	356391	356399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_010482	GAG	2	6	356417	356422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010482	TGG	3	9	356464	356472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_010482	AAG	2	6	356562	356567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_010482	AGG	2	6	356599	356604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010482	CAG	2	6	356643	356648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_010482	GAA	2	6	356657	356662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010482	GGA	2	6	356674	356679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010482	CTT	2	6	356681	356686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_010482	AGGG	2	8	356706	356713	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010482	ATC	2	6	356787	356792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_010482	CTAT	2	8	356833	356840	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_010482	GTG	2	6	356886	356891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_010482	CT	3	6	357085	357090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_010482	AAG	2	6	357109	357114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_010482	AGG	2	6	357163	357168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010482	AGG	3	9	357190	357198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_010482	AAT	2	6	357234	357239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010482	GAG	2	6	357376	357381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010482	GAGCG	2	10	357642	357651	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
594	NC_010482	GGGT	2	8	357652	357659	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010482	TGA	2	6	357686	357691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010482	GAG	2	6	357758	357763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010482	CGAT	2	8	357777	357784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_010482	GAG	2	6	357788	357793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010482	GCT	2	6	357815	357820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_010482	TCC	2	6	357880	357885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_010482	CTG	2	6	357901	357906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010482	AACCC	2	10	357925	357934	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
604	NC_010482	TCT	2	6	357960	357965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_010482	TC	3	6	358027	358032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_010482	TCA	2	6	358049	358054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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608	NC_010482	ATA	2	6	358137	358142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010482	AATT	2	8	358147	358154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010482	ATA	2	6	358227	358232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010482	AATT	2	8	358237	358244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010482	TCA	2	6	358255	358260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_010482	AAT	3	9	358287	358295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010482	ATTTTT	2	12	358338	358349	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010482	TTTTTA	2	12	360676	360687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010482	TCA	2	6	361280	361285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_010482	TAT	2	6	361286	361291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010482	GAG	2	6	363088	363093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010482	CAG	2	6	363097	363102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010482	AGT	2	6	363156	363161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010482	ATG	2	6	363173	363178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010482	CTC	2	6	363217	363222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_010482	TTC	2	6	363229	363234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_010482	TCCT	2	8	363299	363306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_010482	CAG	2	6	363379	363384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_010482	ATA	2	6	363453	363458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010482	T	6	6	363497	363502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_010482	AT	3	6	363520	363525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010482	AAT	2	6	363533	363538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010482	TTAA	2	8	363626	363633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010482	GAG	2	6	368221	368226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010482	TGA	2	6	368277	368282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010482	TAT	2	6	368680	368685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_010482	GTG	2	6	368696	368701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_010482	TAA	2	6	368981	368986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010482	C	6	6	371257	371262	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
637	NC_010482	AGG	2	6	373541	373546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_010482	T	6	6	373651	373656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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