MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C chromosome

Total Repeats: 1120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010424	AACA	2	8	4156	4163	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010424	CCGG	2	8	6956	6963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010424	CCCG	2	8	7347	7354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_010424	CGGG	2	8	9921	9928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010424	AGGC	2	8	10040	10047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010424	GGTG	2	8	11631	11638	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010424	CCGG	2	8	11646	11653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010424	GGTC	2	8	16447	16454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010424	GCAG	2	8	21350	21357	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010424	AGTG	2	8	36848	36855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010424	TTTG	2	8	41814	41821	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010424	CCCT	2	8	47081	47088	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_010424	AGAA	2	8	47110	47117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010424	GGTG	2	8	50312	50319	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010424	AAGG	2	8	53862	53869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010424	CGAT	2	8	55435	55442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010424	TGCC	2	8	55738	55745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010424	GGGA	2	8	55885	55892	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010424	TGAC	2	8	58902	58909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010424	AATA	2	8	70190	70197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010424	AAGG	2	8	80593	80600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010424	GTTG	2	8	83555	83562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010424	GGGA	2	8	84606	84613	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010424	GAAT	2	8	95418	95425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010424	TGGT	2	8	95589	95596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010424	GCGG	2	8	95603	95610	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010424	TTTC	2	8	100210	100217	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010424	CCGC	2	8	103565	103572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_010424	TTCC	2	8	107301	107308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010424	AATG	2	8	108428	108435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010424	TTGC	2	8	115551	115558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010424	CCGA	2	8	125287	125294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010424	GAGG	2	8	125318	125325	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010424	AGGG	2	8	127548	127555	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010424	GGGT	2	8	135194	135201	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010424	CTGC	2	8	143356	143363	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010424	GGGA	2	8	144320	144327	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010424	ACCG	2	8	145360	145367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010424	GTTG	2	8	146181	146188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010424	TAAG	2	8	146239	146246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010424	GGGA	2	8	146509	146516	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010424	TCCC	2	8	148115	148122	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_010424	TGCG	2	8	148205	148212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010424	GGTT	2	8	153676	153683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010424	GCTG	2	8	157903	157910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010424	TGCA	2	8	159160	159167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010424	AAAG	2	8	165237	165244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010424	CTGG	2	8	170618	170625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010424	TCCC	2	8	175852	175859	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_010424	CCGG	2	8	176026	176033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010424	TCCT	2	8	176212	176219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010424	GCAG	2	8	176598	176605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010424	CCCG	2	8	176972	176979	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_010424	AACA	2	8	177071	177078	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010424	ACAA	2	8	178247	178254	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010424	TAAT	2	8	178278	178285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010424	TGCC	2	8	178995	179002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010424	AAGG	2	8	179089	179096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010424	TGCA	2	8	180756	180763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010424	GGGA	2	8	180865	180872	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010424	CGGG	2	8	182907	182914	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010424	AGGG	2	8	184953	184960	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010424	GTGG	2	8	188651	188658	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010424	CGGC	2	8	191794	191801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010424	GTCT	2	8	191924	191931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010424	AATT	3	12	193787	193798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010424	GACA	2	8	194261	194268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010424	GCCC	2	8	195442	195449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_010424	GGTG	2	8	195474	195481	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010424	CAGC	2	8	197702	197709	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010424	GAAG	2	8	199642	199649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010424	AGTC	2	8	204014	204021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010424	GGTA	2	8	211679	211686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010424	AAAG	2	8	212293	212300	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010424	GAGG	2	8	214625	214632	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010424	CGGG	2	8	216915	216922	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010424	TTCC	2	8	216955	216962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010424	TTAT	2	8	219208	219215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010424	GACG	2	8	220108	220115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010424	GCCG	2	8	220118	220125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010424	CAGC	2	8	220551	220558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010424	ACTT	2	8	220621	220628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010424	GCTT	2	8	220846	220853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010424	ATTG	2	8	220885	220892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010424	TATT	2	8	221363	221370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010424	TGTT	2	8	221488	221495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010424	TCAC	2	8	221530	221537	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010424	TGCT	2	8	221562	221569	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010424	GTGA	2	8	223268	223275	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010424	GCAT	2	8	223921	223928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010424	CATC	2	8	224016	224023	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010424	ATCC	2	8	226627	226634	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010424	CTTC	2	8	226987	226994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010424	GATT	2	8	232885	232892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010424	TTTC	2	8	235289	235296	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010424	TGGG	2	8	235570	235577	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010424	AATA	2	8	236804	236811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010424	CGAC	2	8	247345	247352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010424	GGGA	2	8	247362	247369	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010424	GAAA	2	8	250874	250881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010424	AGTA	2	8	262879	262886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010424	CGGG	2	8	263009	263016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010424	TTTC	2	8	273114	273121	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010424	GAGC	2	8	275569	275576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010424	CAGC	2	8	275656	275663	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010424	GGGC	2	8	281155	281162	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010424	ATTT	2	8	284028	284035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010424	GAGG	2	8	284094	284101	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010424	TAGG	2	8	284371	284378	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010424	GGCA	2	8	293576	293583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010424	AAAG	2	8	293750	293757	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010424	GCCG	2	8	297039	297046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010424	GACA	2	8	299990	299997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010424	CGTT	2	8	303830	303837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010424	CAGG	2	8	303901	303908	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010424	TGGA	2	8	304132	304139	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010424	TGTT	2	8	305327	305334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010424	CCGG	2	8	305350	305357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010424	GGAG	2	8	325808	325815	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010424	AATT	2	8	327862	327869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010424	GGAG	2	8	330018	330025	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010424	CACC	2	8	337557	337564	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_010424	AGAT	2	8	338977	338984	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010424	TTTG	2	8	340365	340372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010424	CGGG	2	8	342507	342514	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010424	GCAC	2	8	342783	342790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010424	CCCA	2	8	347789	347796	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_010424	CCCA	2	8	348374	348381	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_010424	GAAA	2	8	348405	348412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010424	GTTT	2	8	348577	348584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010424	CTTT	2	8	348654	348661	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010424	CCGG	2	8	350975	350982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010424	GCCC	2	8	351154	351161	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_010424	GCAA	2	8	356850	356857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010424	GAAA	2	8	360746	360753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010424	GTAG	2	8	360754	360761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010424	CTCC	2	8	363050	363057	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_010424	GGTT	2	8	363059	363066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010424	TGTT	2	8	370373	370380	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010424	CGGC	2	8	373023	373030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010424	GCTT	2	8	375057	375064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010424	CAAT	2	8	376260	376267	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010424	CGAC	2	8	388116	388123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010424	GTGC	2	8	390107	390114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010424	GCGG	2	8	393353	393360	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010424	CAGG	2	8	393377	393384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010424	AAAT	2	8	393661	393668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010424	TGGC	2	8	395207	395214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010424	TGGC	2	8	396585	396592	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010424	ACAA	2	8	397678	397685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010424	TGGC	2	8	398529	398536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010424	ACCG	2	8	398588	398595	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_010424	CCGG	2	8	398655	398662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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233	NC_010424	GGCA	2	8	533077	533084	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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262	NC_010424	CAAA	2	8	615756	615763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
263	NC_010424	CCGA	2	8	616910	616917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
264	NC_010424	GCCA	2	8	617395	617402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
265	NC_010424	GATT	2	8	617748	617755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_010424	GCCA	2	8	621705	621712	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
271	NC_010424	TTCT	2	8	621899	621906	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
272	NC_010424	TCCT	2	8	621908	621915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
273	NC_010424	TGCC	2	8	623767	623774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
274	NC_010424	ATTA	2	8	623785	623792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_010424	GCGG	2	8	660571	660578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
284	NC_010424	CAGC	2	8	669997	670004	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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289	NC_010424	TCGG	2	8	709826	709833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
290	NC_010424	GGGA	2	8	713783	713790	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
291	NC_010424	AAAG	2	8	717896	717903	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_010424	CAGA	2	8	728594	728601	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
296	NC_010424	AACA	2	8	728791	728798	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
297	NC_010424	CAGG	2	8	730266	730273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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484	NC_010424	TGTC	2	8	1237324	1237331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
485	NC_010424	TCCC	2	8	1240592	1240599	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
486	NC_010424	ATCT	2	8	1247274	1247281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
487	NC_010424	GGCT	2	8	1261262	1261269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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495	NC_010424	GGGA	2	8	1297233	1297240	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
496	NC_010424	GGAG	2	8	1305361	1305368	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_010424	TTGG	2	8	1307678	1307685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_010424	GACC	2	8	1314080	1314087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_010424	GGCG	2	8	1316151	1316158	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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