MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C chromosome

Total Repeats: 7166

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010424	AAAG	2	8	165237	165244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010424	TGG	2	6	170411	170416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010424	GC	3	6	170434	170439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_010424	CGC	2	6	170444	170449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_010424	GCG	2	6	170454	170459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_010424	ACG	2	6	170472	170477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_010424	GTT	2	6	170482	170487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010424	CGG	2	6	170539	170544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010424	GC	4	8	170594	170601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_010424	GC	3	6	170610	170615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_010424	CTGG	2	8	170618	170625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
512	NC_010424	AGT	2	6	170644	170649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010424	GCT	2	6	172324	172329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010424	G	6	6	172340	172345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
515	NC_010424	AAAGA	2	10	172378	172387	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010424	GCG	2	6	172400	172405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_010424	CT	3	6	172921	172926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_010424	CAA	2	6	172953	172958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_010424	A	7	7	172957	172963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010424	CCG	2	6	173029	173034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_010424	GGC	2	6	173036	173041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010424	GCC	2	6	173047	173052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_010424	TGT	2	6	173087	173092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010424	A	6	6	173114	173119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010424	ATG	2	6	173132	173137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010424	AT	3	6	173160	173165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010424	CCT	2	6	174953	174958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_010424	CAT	2	6	174971	174976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_010424	GC	3	6	175075	175080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_010424	TCC	2	6	175103	175108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_010424	CCG	2	6	175146	175151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_010424	CAG	2	6	175172	175177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_010424	CAC	2	6	175188	175193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_010424	TCG	2	6	175199	175204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_010424	CCT	2	6	175282	175287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_010424	AGT	2	6	175338	175343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010424	CCG	2	6	175399	175404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_010424	CGC	2	6	175433	175438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_010424	TGC	2	6	175475	175480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_010424	CGC	2	6	175504	175509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_010424	TGACG	2	10	175588	175597	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
542	NC_010424	CCA	2	6	175618	175623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_010424	TAC	2	6	175652	175657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_010424	CCT	2	6	175660	175665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_010424	CGC	2	6	175762	175767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_010424	GCCCCG	2	12	175785	175796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_010424	TCA	2	6	175815	175820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_010424	TCC	2	6	175827	175832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_010424	TCCC	2	8	175852	175859	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
550	NC_010424	ATC	2	6	175865	175870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_010424	ACG	2	6	175895	175900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_010424	CGT	2	6	175905	175910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010424	GTT	2	6	175924	175929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010424	CGC	2	6	175963	175968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_010424	CGG	2	6	176016	176021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_010424	CCGG	2	8	176026	176033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_010424	CTG	2	6	176074	176079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_010424	AGG	2	6	176157	176162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010424	TCCT	2	8	176212	176219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_010424	CGG	2	6	176235	176240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_010424	CAC	2	6	176371	176376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_010424	CGC	2	6	176440	176445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_010424	GCG	2	6	176511	176516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_010424	CA	3	6	176582	176587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_010424	GCAG	2	8	176598	176605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
566	NC_010424	CAACC	2	10	176683	176692	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
567	NC_010424	GAT	2	6	176769	176774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010424	GCG	2	6	176800	176805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_010424	GGC	2	6	176806	176811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_010424	GC	3	6	176810	176815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_010424	CAC	2	6	176836	176841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_010424	GCA	2	6	176873	176878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_010424	CT	3	6	176881	176886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_010424	CCA	2	6	176901	176906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_010424	CA	3	6	176905	176910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_010424	CCCG	2	8	176972	176979	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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578	NC_010424	AACA	2	8	177071	177078	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_010424	CGA	2	6	177103	177108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_010424	CAC	2	6	177191	177196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_010424	CGC	2	6	177239	177244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_010424	CGC	2	6	177254	177259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_010424	CTT	2	6	177265	177270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_010424	GCC	2	6	177294	177299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_010424	CCA	2	6	177415	177420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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587	NC_010424	GTCCGC	2	12	177494	177505	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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589	NC_010424	CCGCTC	2	12	177611	177622	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_010424	CCG	2	6	177662	177667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_010424	CAA	2	6	177746	177751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_010424	TCC	2	6	177778	177783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_010424	AAT	2	6	177887	177892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010424	TAC	2	6	178099	178104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010424	ATA	2	6	178158	178163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010424	CTG	2	6	178166	178171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010424	T	8	8	178195	178202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010424	ACAA	2	8	178247	178254	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_010424	TAT	2	6	178269	178274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010424	TAAT	2	8	178278	178285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010424	T	6	6	178342	178347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010424	GGA	2	6	178413	178418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010424	TGCC	2	8	178995	179002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
604	NC_010424	AAGG	2	8	179089	179096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010424	A	7	7	180694	180700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010424	TGCA	2	8	180756	180763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
607	NC_010424	GGGA	2	8	180865	180872	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010424	AAG	2	6	180898	180903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010424	TA	3	6	181032	181037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010424	CCT	2	6	182466	182471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_010424	T	6	6	182481	182486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010424	GGT	2	6	182487	182492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010424	CTT	2	6	182526	182531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010424	T	6	6	182649	182654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010424	CTT	2	6	182706	182711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010424	CGT	2	6	182847	182852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_010424	CGGG	2	8	182907	182914	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
618	NC_010424	GCC	2	6	182928	182933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_010424	TG	3	6	182938	182943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010424	GGC	2	6	183067	183072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010424	GCG	2	6	183214	183219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010424	TACACC	2	12	183223	183234	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_010424	CGG	2	6	183258	183263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_010424	GGT	2	6	184545	184550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010424	GGT	2	6	184679	184684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_010424	GTT	2	6	184796	184801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010424	GCTTC	2	10	184815	184824	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
628	NC_010424	T	6	6	184947	184952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010424	AGGG	2	8	184953	184960	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010424	AGG	2	6	186703	186708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_010424	GTGG	2	8	188651	188658	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010424	CAA	2	6	191072	191077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_010424	A	6	6	191595	191600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_010424	AGC	2	6	191741	191746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_010424	CGC	2	6	191747	191752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_010424	GCG	2	6	191760	191765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_010424	CGGC	2	8	191794	191801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
639	NC_010424	GGC	2	6	191807	191812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_010424	GGA	2	6	191855	191860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_010424	GCA	2	6	191880	191885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_010424	GC	3	6	191892	191897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
643	NC_010424	GTCT	2	8	191924	191931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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651	NC_010424	CGA	2	6	194218	194223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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654	NC_010424	T	6	6	194271	194276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
655	NC_010424	GTC	2	6	194282	194287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
656	NC_010424	TTG	2	6	194302	194307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
657	NC_010424	GCC	2	6	194328	194333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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777	NC_010424	GCG	2	6	223813	223818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
778	NC_010424	ACC	2	6	223847	223852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
779	NC_010424	GGC	2	6	223881	223886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
780	NC_010424	CAA	2	6	223903	223908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
781	NC_010424	GCAT	2	8	223921	223928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
782	NC_010424	CGCAC	2	10	223929	223938	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
783	NC_010424	CGC	2	6	223962	223967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
784	NC_010424	CATC	2	8	224016	224023	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
785	NC_010424	AGT	2	6	224071	224076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
786	NC_010424	GA	3	6	224078	224083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
787	NC_010424	GAT	2	6	224113	224118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
788	NC_010424	TCCAG	2	10	224124	224133	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
789	NC_010424	G	6	6	224151	224156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
790	NC_010424	GCGCTT	2	12	224259	224270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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792	NC_010424	TTC	2	6	224410	224415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
793	NC_010424	AGA	2	6	224441	224446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
794	NC_010424	ATT	2	6	224511	224516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
795	NC_010424	ACC	2	6	224635	224640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
796	NC_010424	AAT	2	6	225656	225661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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801	NC_010424	GGT	2	6	225961	225966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
802	NC_010424	TCC	2	6	226004	226009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
803	NC_010424	CCG	3	9	226072	226080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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811	NC_010424	AAG	2	6	226791	226796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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813	NC_010424	GGC	2	6	226901	226906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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817	NC_010424	GA	3	6	227078	227083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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824	NC_010424	TTTC	2	8	235289	235296	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
825	NC_010424	TGG	2	6	235345	235350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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859	NC_010424	CAA	2	6	243606	243611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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909	NC_010424	A	6	6	273878	273883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
910	NC_010424	AGG	2	6	273893	273898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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912	NC_010424	CAC	2	6	275500	275505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
913	NC_010424	GAGC	2	8	275569	275576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
914	NC_010424	GCT	2	6	275645	275650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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