MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010418	AT	3	6	5867	5872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010418	TA	3	6	7034	7039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010418	AT	3	6	9880	9885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010418	TA	4	8	12590	12597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010418	TA	3	6	12612	12617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010418	AT	3	6	13136	13141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010418	AT	3	6	13528	13533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010418	AT	3	6	13543	13548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010418	AT	3	6	18206	18211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010418	TA	3	6	18274	18279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010418	AT	3	6	21410	21415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010418	TA	3	6	26574	26579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010418	AT	3	6	26615	26620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010418	AT	3	6	27323	27328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010418	TA	4	8	27802	27809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010418	TA	3	6	27958	27963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010418	AT	3	6	28075	28080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010418	TA	3	6	29135	29140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010418	TA	3	6	29459	29464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010418	AT	3	6	29674	29679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010418	AT	3	6	33091	33096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010418	TA	3	6	33540	33545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010418	AT	3	6	37137	37142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010418	AT	3	6	39294	39299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010418	TA	3	6	40881	40886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010418	AT	3	6	41678	41683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010418	TC	3	6	41973	41978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010418	AT	5	10	41994	42003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010418	TA	3	6	42086	42091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010418	TA	3	6	43250	43255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010418	AT	3	6	44123	44128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010418	TA	3	6	44894	44899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010418	AT	3	6	47548	47553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010418	AT	3	6	47616	47621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010418	AT	3	6	47657	47662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010418	AT	3	6	47750	47755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010418	AT	4	8	49275	49282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010418	AT	3	6	49612	49617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010418	TA	3	6	49757	49762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010418	TA	3	6	51627	51632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010418	AG	3	6	55950	55955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010418	TA	3	6	56248	56253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010418	TA	5	10	57018	57027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010418	TA	3	6	57697	57702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010418	TA	3	6	57764	57769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010418	TA	3	6	68447	68452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010418	AT	3	6	68473	68478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010418	TA	3	6	68508	68513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010418	AT	3	6	68924	68929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010418	AT	4	8	69129	69136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010418	CT	3	6	69217	69222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010418	AT	3	6	69533	69538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010418	TA	3	6	76358	76363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010418	AT	3	6	76455	76460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010418	TA	3	6	78026	78031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010418	AT	3	6	79945	79950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010418	TA	3	6	82505	82510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010418	TA	3	6	82560	82565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010418	AT	3	6	82575	82580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010418	AT	4	8	85995	86002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010418	AC	3	6	86032	86037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010418	AT	3	6	86279	86284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010418	TA	3	6	86399	86404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010418	AT	3	6	86487	86492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010418	TA	3	6	88519	88524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010418	TA	3	6	88792	88797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010418	TA	3	6	88877	88882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010418	AT	3	6	90051	90056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010418	TA	3	6	90802	90807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010418	TA	3	6	92101	92106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010418	TA	3	6	92139	92144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010418	TA	4	8	92147	92154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010418	TA	3	6	92230	92235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010418	TA	3	6	92373	92378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010418	AT	3	6	92382	92387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010418	TA	3	6	99803	99808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010418	TA	3	6	103795	103800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010418	AT	3	6	103833	103838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010418	TA	4	8	103840	103847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010418	AT	3	6	104947	104952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010418	TA	3	6	105075	105080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010418	AT	3	6	107091	107096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010418	TA	3	6	107877	107882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010418	TA	3	6	107958	107963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010418	TA	3	6	108075	108080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010418	TA	4	8	111361	111368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010418	TA	4	8	111370	111377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010418	AT	3	6	112019	112024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010418	TA	4	8	112026	112033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010418	AT	3	6	112200	112205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010418	AT	3	6	115775	115780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010418	TA	3	6	115781	115786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010418	TA	4	8	115824	115831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010418	TA	3	6	115993	115998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010418	AT	3	6	116024	116029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010418	TA	3	6	118126	118131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010418	TA	3	6	121903	121908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010418	TA	4	8	123710	123717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010418	TA	3	6	124068	124073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010418	TA	3	6	124076	124081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010418	AT	3	6	125075	125080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010418	AG	3	6	128727	128732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010418	GA	3	6	128733	128738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010418	TA	3	6	129627	129632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010418	TA	3	6	129761	129766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010418	AT	3	6	130043	130048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010418	AG	3	6	130327	130332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010418	TC	3	6	130653	130658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010418	TA	3	6	131233	131238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010418	AT	3	6	131310	131315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010418	GT	3	6	131391	131396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010418	GT	4	8	132066	132073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010418	TA	3	6	132608	132613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010418	CT	3	6	132622	132627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010418	TA	3	6	132758	132763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010418	TA	3	6	132825	132830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010418	TA	3	6	132844	132849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010418	TA	3	6	132915	132920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010418	CT	3	6	133030	133035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010418	TA	3	6	133085	133090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010418	CT	3	6	133443	133448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010418	AT	3	6	133449	133454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010418	TA	4	8	133464	133471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010418	TA	4	8	134991	134998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010418	AT	3	6	136105	136110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010418	TA	3	6	136956	136961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010418	TA	4	8	137560	137567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010418	AT	3	6	139779	139784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010418	TA	4	8	141927	141934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010418	TA	4	8	142280	142287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010418	TA	3	6	142654	142659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010418	TA	3	6	144562	144567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010418	TA	4	8	145850	145857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010418	TC	3	6	147374	147379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010418	TA	3	6	149278	149283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010418	AT	3	6	149292	149297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010418	TA	3	6	149368	149373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010418	AT	3	6	150634	150639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010418	TA	4	8	150747	150754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010418	TA	3	6	150874	150879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010418	TA	3	6	154038	154043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010418	TA	3	6	154889	154894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010418	TA	3	6	155365	155370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010418	AT	3	6	156199	156204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010418	TA	3	6	156992	156997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010418	TA	3	6	157074	157079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010418	AT	3	6	157337	157342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010418	TA	4	8	157405	157412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010418	TA	4	8	158658	158665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010418	TA	3	6	160288	160293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010418	TA	3	6	160330	160335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010418	AT	3	6	160355	160360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010418	TA	3	6	160376	160381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010418	TA	3	6	161076	161081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010418	AT	3	6	162912	162917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_010418	AT	3	6	163521	163526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.