MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 8417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010407	GCG	2	6	1456	1461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010407	GAC	2	6	1471	1476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010407	GCA	2	6	1477	1482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010407	CCT	2	6	1572	1577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010407	CCG	2	6	1668	1673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010407	TCG	2	6	1715	1720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010407	CGC	2	6	1724	1729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010407	CCG	2	6	1734	1739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_010407	CCT	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_010407	AGG	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010407	AGG	2	6	6906	6911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010407	TAC	2	6	6921	6926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010407	GAC	2	6	6960	6965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010407	CGG	2	6	6969	6974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010407	CCG	2	6	6998	7003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010407	CCA	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_010407	CGA	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010407	CGA	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010407	GCG	2	6	9098	9103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010407	CCG	2	6	9121	9126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010407	CCA	2	6	12352	12357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010407	AGG	2	6	12478	12483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010407	TCG	2	6	12563	12568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010407	ACG	2	6	12615	12620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010407	TCG	2	6	12652	12657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010407	GAG	2	6	12672	12677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010407	ACG	2	6	13377	13382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010407	CCG	2	6	13395	13400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010407	CCG	2	6	13411	13416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010407	GCC	2	6	14854	14859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010407	GCG	2	6	14913	14918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010407	GGA	2	6	14997	15002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010407	GCG	2	6	15075	15080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010407	AGA	2	6	15177	15182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010407	GCG	2	6	15469	15474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010407	CTC	2	6	15489	15494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010407	GCC	2	6	15526	15531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010407	GGC	2	6	15535	15540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010407	CGT	2	6	17213	17218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010407	GCT	2	6	17228	17233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010407	TCG	2	6	19023	19028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010407	GGC	2	6	19080	19085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010407	CCG	2	6	19116	19121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010407	GCG	2	6	26588	26593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010407	GTC	2	6	26620	26625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010407	CGG	2	6	26787	26792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010407	CCG	2	6	26944	26949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010407	CGT	2	6	26996	27001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010407	CCG	2	6	27046	27051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_010407	GCC	2	6	27102	27107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010407	TCC	2	6	27169	27174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010407	TCG	2	6	27184	27189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010407	TCC	2	6	27222	27227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010407	CTC	3	9	27228	27236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_010407	CGC	3	9	27323	27331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010407	CGG	2	6	27388	27393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010407	GCT	2	6	27404	27409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010407	CTC	2	6	27450	27455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010407	GTC	2	6	27537	27542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010407	GCC	2	6	27543	27548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010407	TGG	2	6	27576	27581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010407	CGC	2	6	27584	27589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010407	GCT	2	6	27632	27637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010407	CTC	3	9	27690	27698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010407	GCT	3	9	27737	27745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010407	CGG	3	9	27871	27879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010407	CCG	2	6	27928	27933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010407	CCG	2	6	27943	27948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010407	GCA	2	6	28021	28026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010407	CGA	2	6	28043	28048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010407	CCG	2	6	28129	28134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010407	ACG	2	6	28135	28140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010407	CGA	2	6	28147	28152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010407	GGA	2	6	28268	28273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010407	GCC	2	6	28335	28340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_010407	GAC	2	6	28398	28403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010407	GCG	2	6	28429	28434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010407	CGA	2	6	28496	28501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010407	CTC	2	6	28518	28523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010407	CGC	2	6	28532	28537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010407	TCG	2	6	28591	28596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010407	CGC	2	6	28720	28725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010407	CGG	3	9	28894	28902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010407	CGG	2	6	28930	28935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010407	CGT	2	6	29007	29012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010407	GGC	2	6	29015	29020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010407	CCT	2	6	30032	30037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010407	AGG	2	6	30071	30076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010407	GCG	2	6	30151	30156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010407	CGG	4	12	30161	30172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010407	CGG	2	6	30179	30184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010407	GCG	2	6	32670	32675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010407	CGA	2	6	32723	32728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010407	CGG	2	6	32756	32761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010407	ACC	2	6	32943	32948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010407	GCC	2	6	35962	35967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010407	GGC	2	6	37396	37401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010407	CGA	2	6	41273	41278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010407	GCC	2	6	41295	41300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_010407	CGG	2	6	41304	41309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010407	CAT	2	6	41381	41386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010407	TAC	2	6	41390	41395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010407	AGG	2	6	41404	41409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010407	AAT	2	6	41551	41556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010407	TTA	2	6	41764	41769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010407	CGG	2	6	41822	41827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010407	CGG	2	6	41835	41840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010407	GAT	2	6	41880	41885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010407	GCT	2	6	41912	41917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010407	GAC	2	6	41952	41957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010407	GGT	2	6	42016	42021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010407	CGT	2	6	42500	42505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010407	CGG	2	6	42516	42521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010407	CCG	2	6	42556	42561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010407	CGA	2	6	42624	42629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010407	GCC	2	6	42637	42642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_010407	CCT	2	6	43713	43718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010407	AGG	2	6	43752	43757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010407	GTC	2	6	44664	44669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010407	CGG	2	6	46262	46267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010407	CCT	2	6	47061	47066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_010407	AGG	2	6	48065	48070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010407	GCC	2	6	48071	48076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010407	TCC	2	6	48101	48106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010407	GAG	2	6	48200	48205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010407	CGG	2	6	48248	48253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010407	TCT	2	6	48336	48341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010407	CTC	2	6	48387	48392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_010407	CCG	2	6	48454	48459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010407	CGC	2	6	48470	48475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_010407	TCG	2	6	48529	48534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010407	CCG	2	6	48538	48543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_010407	GCC	2	6	48567	48572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010407	GTC	2	6	48587	48592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010407	CAC	2	6	48665	48670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_010407	ACC	2	6	48729	48734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_010407	GAC	2	6	48933	48938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010407	GCC	2	6	49026	49031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_010407	GCT	2	6	49070	49075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010407	TCG	2	6	49081	49086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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