MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 12772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010407	CCCCG	2	10	1522514	1522523	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6002	NC_010407	CCG	2	6	1522526	1522531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_010407	CAG	2	6	1522600	1522605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_010407	CCGC	2	8	1523981	1523988	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6005	NC_010407	TCGG	2	8	1526740	1526747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_010407	CGT	2	6	1527540	1527545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_010407	CGG	2	6	1527558	1527563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_010407	TGCGG	2	10	1527568	1527577	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6009	NC_010407	CGT	2	6	1527579	1527584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_010407	CGG	2	6	1527591	1527596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_010407	ACC	2	6	1527647	1527652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_010407	CGC	2	6	1528544	1528549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_010407	CGT	3	9	1528576	1528584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_010407	GGCG	2	8	1529191	1529198	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_010407	GCTG	2	8	1529200	1529207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6016	NC_010407	GAT	2	6	1529225	1529230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_010407	GGGA	2	8	1529248	1529255	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_010407	GGCA	2	8	1529269	1529276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6019	NC_010407	CG	3	6	1529282	1529287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_010407	GAC	3	9	1529288	1529296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_010407	GCG	2	6	1529317	1529322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_010407	CGT	2	6	1529325	1529330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_010407	GTT	2	6	1530024	1530029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_010407	TGC	2	6	1530087	1530092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_010407	TCG	2	6	1530111	1530116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_010407	TCG	2	6	1530147	1530152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_010407	CTC	2	6	1532248	1532253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_010407	CGT	2	6	1532254	1532259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_010407	GTGC	2	8	1532265	1532272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_010407	TCCA	2	8	1532273	1532280	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_010407	GTGC	2	8	1532295	1532302	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6032	NC_010407	CG	3	6	1532324	1532329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_010407	GCGG	2	8	1532745	1532752	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6034	NC_010407	GCCGGC	2	12	1532788	1532799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_010407	GC	3	6	1532804	1532809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_010407	CGC	2	6	1532836	1532841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_010407	GGT	2	6	1533115	1533120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_010407	CTC	2	6	1533121	1533126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_010407	GCC	2	6	1533144	1533149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_010407	GCG	2	6	1533158	1533163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_010407	CGG	2	6	1533164	1533169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_010407	CGG	2	6	1533260	1533265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_010407	CGG	2	6	1533268	1533273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_010407	TCG	2	6	1533277	1533282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_010407	CG	3	6	1533307	1533312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_010407	TCC	2	6	1533378	1533383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_010407	GGCC	2	8	1533443	1533450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_010407	GCG	2	6	1533520	1533525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_010407	GC	4	8	1533561	1533568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_010407	CG	3	6	1535247	1535252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_010407	GGC	2	6	1535255	1535260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_010407	GCC	2	6	1535330	1535335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_010407	CGG	2	6	1535362	1535367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_010407	GGA	2	6	1535413	1535418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_010407	AC	3	6	1535426	1535431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_010407	GCG	2	6	1535432	1535437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_010407	CGC	2	6	1535463	1535468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_010407	GTG	2	6	1535469	1535474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_010407	CGG	2	6	1535523	1535528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_010407	GAC	2	6	1535529	1535534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_010407	CGC	2	6	1535537	1535542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_010407	GTG	2	6	1535562	1535567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_010407	CGA	2	6	1535594	1535599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_010407	CCCGG	2	10	1535610	1535619	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6065	NC_010407	CGC	2	6	1535653	1535658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_010407	CGGT	2	8	1535686	1535693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6067	NC_010407	CGC	2	6	1535705	1535710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6069	NC_010407	CG	3	6	1536438	1536443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_010407	CCCGGC	2	12	1537257	1537268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6072	NC_010407	CGG	2	6	1542285	1542290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_010407	GAG	2	6	1542347	1542352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_010407	G	9	9	1543403	1543411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_010407	CGGG	2	8	1543417	1543424	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6076	NC_010407	GC	3	6	1544921	1544926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_010407	GC	3	6	1544944	1544949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6080	NC_010407	CG	3	6	1545045	1545050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6081	NC_010407	CGCC	2	8	1545070	1545077	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6082	NC_010407	GATC	2	8	1545083	1545090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6083	NC_010407	CGG	2	6	1547618	1547623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6087	NC_010407	TGAAC	2	10	1553618	1553627	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6090	NC_010407	GC	3	6	1553725	1553730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_010407	CGGG	2	8	1553742	1553749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6092	NC_010407	CACG	2	8	1553793	1553800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_010407	GGT	2	6	1553821	1553826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_010407	CAC	2	6	1553834	1553839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6095	NC_010407	GTC	2	6	1553849	1553854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6098	NC_010407	CCG	2	6	1553911	1553916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_010407	AC	3	6	1553928	1553933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_010407	CTC	2	6	1553944	1553949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_010407	CCG	2	6	1553965	1553970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_010407	CG	3	6	1557635	1557640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_010407	GC	3	6	1558543	1558548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_010407	GGCGT	2	10	1559243	1559252	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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6107	NC_010407	GTTCA	2	10	1562106	1562115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6109	NC_010407	GC	3	6	1563112	1563117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_010407	CGC	3	9	1563141	1563149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_010407	GAG	2	6	1564914	1564919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_010407	CGG	2	6	1564946	1564951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_010407	GGCC	2	8	1564959	1564966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_010407	GTCC	2	8	1564971	1564978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_010407	CGA	2	6	1564996	1565001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_010407	GGTG	2	8	1567613	1567620	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_010407	CGTG	2	8	1567624	1567631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6118	NC_010407	CG	3	6	1567643	1567648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_010407	GCG	2	6	1567690	1567695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_010407	CG	5	10	1568382	1568391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_010407	CCGC	2	8	1568434	1568441	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6122	NC_010407	ACG	2	6	1568451	1568456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6124	NC_010407	GGCGA	2	10	1569972	1569981	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6125	NC_010407	GAT	2	6	1570014	1570019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6127	NC_010407	CGG	2	6	1570079	1570084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_010407	TC	3	6	1570577	1570582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_010407	GCC	2	6	1570620	1570625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_010407	CGC	3	9	1570640	1570648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6132	NC_010407	CGCATC	3	18	1575698	1575715	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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6143	NC_010407	GCA	2	6	1576057	1576062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6150	NC_010407	CG	3	6	1576498	1576503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6164	NC_010407	GGA	2	6	1580917	1580922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6262	NC_010407	GCG	2	6	1613033	1613038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6263	NC_010407	GCC	2	6	1613058	1613063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6301	NC_010407	TCG	2	6	1618931	1618936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6302	NC_010407	GCCGA	2	10	1618938	1618947	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6305	NC_010407	GGTGG	2	10	1619446	1619455	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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6383	NC_010407	GCT	2	6	1637434	1637439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6384	NC_010407	GT	3	6	1637447	1637452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6385	NC_010407	GCACA	2	10	1637463	1637472	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6386	NC_010407	CCT	2	6	1639221	1639226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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