MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 461

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	CCT	2	6	16	21	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010379	CTA	2	6	329	334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010379	TTA	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010379	TAA	2	6	568	573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010379	TCT	2	6	1041	1046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010379	TCA	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010379	ATA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010379	TTA	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010379	ATT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010379	TTA	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010379	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010379	TAT	2	6	1518	1523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010379	TAA	3	9	1585	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010379	ATT	2	6	1624	1629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010379	ATT	2	6	3088	3093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010379	ATT	3	9	3103	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010379	TTA	2	6	3184	3189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010379	CTA	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010379	ACA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010379	TAT	2	6	4988	4993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010379	ATT	2	6	4995	5000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010379	TCC	2	6	5079	5084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010379	AGA	2	6	5094	5099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010379	ATT	2	6	7052	7057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010379	AGG	2	6	7092	7097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010379	ATT	2	6	7643	7648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010379	ATT	2	6	8289	8294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010379	ACT	2	6	8309	8314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010379	TCC	2	6	9844	9849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010379	ATT	3	9	9892	9900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010379	ATT	2	6	10328	10333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010379	AAT	2	6	11338	11343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010379	CTC	2	6	11910	11915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010379	CTT	2	6	11949	11954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010379	ATT	3	9	11959	11967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010379	TCC	2	6	12651	12656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010379	ATT	2	6	12676	12681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010379	AAT	2	6	12690	12695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010379	TAT	2	6	12696	12701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010379	CAA	2	6	12744	12749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010379	ATC	2	6	12801	12806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010379	TCC	2	6	13468	13473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010379	CTT	2	6	13705	13710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010379	ACT	2	6	13755	13760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010379	ATT	2	6	13775	13780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010379	TCC	2	6	14076	14081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_010379	TAA	2	6	14090	14095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010379	ATT	2	6	14117	14122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010379	ATA	2	6	14681	14686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010379	TAA	2	6	14728	14733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010379	TCC	2	6	15095	15100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010379	TAA	2	6	15115	15120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010379	ATT	2	6	15526	15531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010379	TTC	2	6	15932	15937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010379	TAT	2	6	15990	15995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010379	TCC	2	6	16322	16327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010379	TTA	2	6	16354	16359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010379	TTA	3	9	16369	16377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010379	TAT	2	6	16391	16396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010379	ATT	2	6	16721	16726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010379	ACA	2	6	17842	17847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010379	TAT	2	6	17886	17891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010379	TTC	2	6	19706	19711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010379	TCC	2	6	22080	22085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010379	CCT	2	6	22328	22333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010379	TCA	2	6	22341	22346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010379	ATT	3	9	22377	22385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010379	TAA	2	6	22445	22450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010379	TAA	3	9	22484	22492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010379	ATT	2	6	22577	22582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010379	TAT	2	6	22606	22611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010379	ATA	2	6	22614	22619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010379	CTT	2	6	22621	22626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010379	ACA	2	6	22634	22639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010379	ATT	3	9	22700	22708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010379	TCC	2	6	23584	23589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010379	TAT	2	6	23665	23670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010379	ATT	2	6	23876	23881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010379	TAA	2	6	23908	23913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010379	TTA	3	9	23938	23946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010379	TCC	2	6	24009	24014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010379	AAG	2	6	24029	24034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010379	CTT	2	6	24063	24068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010379	AGC	2	6	24096	24101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010379	ATC	2	6	24114	24119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010379	TAA	2	6	24128	24133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010379	ATT	2	6	24947	24952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010379	TAT	2	6	24966	24971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010379	TCA	2	6	24973	24978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010379	TAA	2	6	25013	25018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010379	TTA	2	6	26540	26545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010379	TTA	2	6	26596	26601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010379	ACA	3	9	27350	27358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010379	TAT	2	6	27435	27440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010379	ATT	2	6	27503	27508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010379	TAT	2	6	27515	27520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010379	TAA	2	6	27850	27855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010379	TAA	2	6	27866	27871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010379	GCT	2	6	27886	27891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010379	TCC	2	6	28060	28065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010379	TCC	2	6	28371	28376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010379	CTT	2	6	28419	28424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010379	TAA	3	9	28901	28909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010379	AAT	2	6	29607	29612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010379	TAT	2	6	29635	29640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010379	ATT	2	6	29948	29953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010379	TCT	2	6	29966	29971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010379	TAA	2	6	30017	30022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010379	ATT	2	6	30372	30377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010379	TCC	2	6	30378	30383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010379	TAA	2	6	30418	30423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010379	ATA	2	6	30460	30465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010379	TCT	2	6	30478	30483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010379	TAT	2	6	30524	30529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010379	ATA	2	6	30556	30561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010379	AAT	2	6	30977	30982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010379	TAT	2	6	31007	31012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010379	CTT	2	6	31097	31102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010379	ATT	2	6	31170	31175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010379	TTC	2	6	31202	31207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010379	AGA	2	6	31294	31299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010379	ACA	2	6	31658	31663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010379	CCT	2	6	31689	31694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010379	ATT	2	6	34118	34123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010379	ATC	2	6	34129	34134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010379	TCA	2	6	34136	34141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010379	TAA	3	9	34147	34155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010379	ATT	2	6	34165	34170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010379	ATA	2	6	34189	34194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010379	ATT	2	6	34229	34234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010379	ATT	2	6	35131	35136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010379	GTA	2	6	35594	35599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010379	ATC	2	6	35625	35630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010379	AAT	2	6	35634	35639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010379	TTA	2	6	36620	36625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010379	ATT	2	6	36691	36696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010379	TTG	2	6	36751	36756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010379	ACC	2	6	37019	37024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_010379	ATA	2	6	37036	37041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010379	CTA	2	6	37058	37063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010379	CTT	2	6	39057	39062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010379	AAT	2	6	39563	39568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010379	TAA	2	6	40396	40401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.