MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Caulobacter sp. K31 chromosome

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010338	CGCCAG	2	12	18078	18089	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010338	ATCTCC	2	12	50566	50577	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010338	CAAGGG	2	12	50908	50919	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010338	CGAATG	2	12	61956	61967	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010338	CGGTGA	2	12	107698	107709	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010338	TCAGGA	2	12	126887	126898	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010338	CGTCCT	2	12	139751	139762	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010338	CCGCGC	2	12	169070	169081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_010338	CGCCGG	2	12	226117	226128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010338	CCGTCG	2	12	240524	240535	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010338	GGTCGC	2	12	275877	275888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010338	CAAGGC	2	12	362834	362845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010338	CGAACC	3	18	367783	367800	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010338	CCAGGG	2	12	384288	384299	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010338	GAGGGC	2	12	414445	414456	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010338	GCGCCC	2	12	448500	448511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_010338	AAGCCC	2	12	450427	450438	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010338	CGGCGC	2	12	451243	451254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010338	CGTCGC	2	12	454155	454166	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010338	CCGCGC	2	12	472225	472236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010338	GGCCGG	2	12	492083	492094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010338	GAGAGG	2	12	520044	520055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010338	GGCGCG	2	12	570546	570557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010338	GGCCAG	2	12	577507	577518	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010338	GAACCG	2	12	596947	596958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010338	CTCTAC	2	12	600998	601009	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010338	AGAGGG	2	12	693508	693519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010338	CGGGGA	2	12	703441	703452	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010338	CGTCCT	2	12	734536	734547	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010338	TCGTTC	2	12	742097	742108	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010338	GGATCG	2	12	775318	775329	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010338	ATCGTG	2	12	787998	788009	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010338	CGTCGG	2	12	788201	788212	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010338	CCTGCG	2	12	788740	788751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010338	GCCAAG	2	12	788822	788833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010338	TCATCC	2	12	801523	801534	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010338	TCCCTC	2	12	833105	833116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010338	TCCCGC	2	12	835070	835081	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010338	TCCCGC	2	12	835095	835106	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010338	CACGCC	2	12	836373	836384	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010338	GGCCCC	2	12	838375	838386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010338	ACGCGC	2	12	838508	838519	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010338	CCGGTC	2	12	838592	838603	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010338	CGCGTG	2	12	868580	868591	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010338	GGCCGG	2	12	875097	875108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010338	CGTCCT	2	12	932319	932330	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010338	AGGACG	2	12	945292	945303	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010338	ACCTGC	2	12	953807	953818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010338	GGGCTG	2	12	1014650	1014661	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010338	AGGACG	2	12	1033494	1033505	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010338	ACGGCC	2	12	1053434	1053445	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010338	CCGAAA	2	12	1099643	1099654	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010338	GGATCG	2	12	1103002	1103013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010338	CGTAAG	2	12	1109073	1109084	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010338	CGAGGG	2	12	1114813	1114824	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010338	GCGCTG	2	12	1117150	1117161	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010338	GATCCA	2	12	1126834	1126845	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010338	GTTGCT	2	12	1155796	1155807	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_010338	GCGCCT	2	12	1189695	1189706	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010338	CGTCAG	2	12	1211841	1211852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010338	GCGGTG	2	12	1229848	1229859	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010338	GCGCCC	2	12	1246146	1246157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010338	AGGACG	2	12	1263464	1263475	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010338	CGACAG	2	12	1285882	1285893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010338	ATCGTC	2	12	1297868	1297879	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010338	GAAAGG	2	12	1298608	1298619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010338	CTTGGG	2	12	1316544	1316555	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010338	GGGCGC	2	12	1393969	1393980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010338	GCTGCC	2	12	1406890	1406901	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010338	CGGGAA	2	12	1408069	1408080	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010338	TGAGCG	2	12	1442195	1442206	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010338	GTCTGA	2	12	1444034	1444045	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010338	GCTCCG	2	12	1475424	1475435	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010338	CGTCCT	2	12	1494569	1494580	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010338	GGATGA	2	12	1494774	1494785	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010338	ACGCCG	2	12	1513278	1513289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010338	TTGTCG	2	12	1539679	1539690	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010338	AGGACG	2	12	1560245	1560256	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010338	CTTCGC	2	12	1582067	1582078	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010338	TCTTTT	2	12	1583268	1583279	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010338	GGGGGA	2	12	1683636	1683647	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010338	GTGTTC	2	12	1686696	1686707	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010338	CCGCGC	2	12	1687179	1687190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010338	GTTCCT	2	12	1687572	1687583	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010338	GCGGAC	2	12	1717264	1717275	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010338	CGGGGG	2	12	1780712	1780723	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010338	CGCCGA	2	12	1793219	1793230	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010338	AGGGCG	2	12	1825110	1825121	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010338	GATCCA	2	12	1879878	1879889	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010338	AGGATG	2	12	1901048	1901059	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010338	GAATTC	2	12	1906401	1906412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010338	GCTCGC	2	12	1937471	1937482	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010338	GGTACC	2	12	1960125	1960136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010338	GAGAAT	2	12	2005423	2005434	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010338	GACCGT	2	12	2118618	2118629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010338	TCGCCG	2	12	2131067	2131078	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010338	CGCGAG	2	12	2163626	2163637	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010338	CGCCGG	2	12	2163819	2163830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010338	CGAATG	2	12	2222760	2222771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010338	CGCGCC	2	12	2324756	2324767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010338	ATCGGC	2	12	2373273	2373284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010338	CCGAGC	2	12	2422160	2422171	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010338	GCGAGG	2	12	2422511	2422522	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010338	GAGACG	2	12	2491980	2491991	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010338	CCGGCC	2	12	2504126	2504137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010338	CCAAGG	2	12	2546317	2546328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010338	GTAAAA	2	12	2553339	2553350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010338	CGCCGG	2	12	2563132	2563143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010338	GGCGCC	2	12	2599340	2599351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010338	TCGCCT	2	12	2614236	2614247	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010338	CCCGGA	2	12	2614686	2614697	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010338	CTGGAC	2	12	2631741	2631752	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010338	GATCAA	2	12	2669750	2669761	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010338	CAAGAT	2	12	2683881	2683892	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010338	GAAGGC	2	12	2705420	2705431	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_010338	CCTGGC	2	12	2706805	2706816	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010338	GGATGG	2	12	2726065	2726076	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010338	GGGGAG	2	12	2818100	2818111	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010338	GCAACC	2	12	2839622	2839633	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010338	GCGAGG	2	12	2841215	2841226	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010338	CGCGAC	2	12	2919781	2919792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010338	ACCCGC	2	12	2925659	2925670	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_010338	AGGACG	2	12	2942729	2942740	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_010338	TGCACC	2	12	2946790	2946801	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010338	CGCTGG	2	12	2946935	2946946	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010338	GCCCTG	2	12	2976749	2976760	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010338	TCGCCC	2	12	2994864	2994875	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_010338	GCTTTT	2	12	2999839	2999850	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010338	TCGATC	2	12	3005151	3005162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010338	GGACCG	2	12	3045942	3045953	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010338	GCCGAA	2	12	3086936	3086947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.