MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Caulobacter sp. K31 plasmid pCAUL01

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010335	TGCGT	2	10	94	103	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010335	CGGCG	2	10	6131	6140	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010335	GTCCC	2	10	6207	6216	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_010335	GCGCG	2	10	11095	11104	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010335	GCCCT	2	10	14893	14902	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_010335	ATCCG	2	10	20679	20688	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010335	CGGCC	2	10	25627	25636	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_010335	CATTG	2	10	27863	27872	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010335	CGGCG	2	10	30290	30299	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_010335	TATTC	2	10	33173	33182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010335	CGGCG	2	10	52258	52267	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010335	CCCCT	2	10	77870	77879	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
13	NC_010335	GTCAC	2	10	80030	80039	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_010335	AGGAT	2	10	81159	81168	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010335	CCCCG	2	10	81369	81378	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16	NC_010335	GGCCG	2	10	82013	82022	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010335	TTATG	2	10	83512	83521	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010335	CGGTG	2	10	83635	83644	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010335	GCCCT	2	10	85161	85170	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_010335	CGCCA	2	10	86836	86845	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_010335	GGGAG	2	10	87146	87155	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010335	CCCGC	2	10	87776	87785	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
23	NC_010335	CAAGG	2	10	87914	87923	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010335	AGCGC	2	10	89381	89390	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_010335	GGCGG	2	10	93034	93043	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010335	GCGCC	2	10	104949	104958	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_010335	GGCCC	2	10	116645	116654	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_010335	GAGGG	2	10	125095	125104	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010335	AGGGG	2	10	147507	147516	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010335	GCGCC	2	10	167243	167252	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_010335	GAGCA	2	10	173050	173059	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010335	GCGCC	2	10	181897	181906	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_010335	CCAGC	2	10	182625	182634	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_010335	GCGCC	2	10	189354	189363	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_010335	TCCCC	2	10	194744	194753	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
36	NC_010335	CCTCA	2	10	194780	194789	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_010335	TCGCC	2	10	199025	199034	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.