MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Caulobacter sp. K31 plasmid pCAUL02

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010333	AGTT	2	8	108	115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010333	CGGT	2	8	262	269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010333	CGAG	2	8	2572	2579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010333	CGGT	2	8	4044	4051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010333	ATTG	2	8	4184	4191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010333	GAAC	2	8	22174	22181	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010333	GTCC	2	8	22320	22327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010333	TGCC	2	8	23235	23242	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010333	GTCC	2	8	27764	27771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010333	GATC	2	8	33239	33246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010333	CCGA	2	8	33955	33962	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010333	CCGG	2	8	34085	34092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010333	GGCT	2	8	34387	34394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010333	CGGG	2	8	34784	34791	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010333	GTTC	2	8	35935	35942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010333	CCAA	2	8	43765	43772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010333	CTTT	2	8	46086	46093	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010333	AGCC	2	8	48690	48697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010333	ACCA	2	8	49843	49850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010333	CGGG	2	8	50072	50079	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010333	TGAT	2	8	50674	50681	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010333	CAGC	2	8	50693	50700	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010333	GTCA	2	8	50949	50956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010333	GTCG	2	8	50961	50968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010333	CCCG	2	8	51052	51059	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_010333	CGGG	2	8	51066	51073	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010333	GCCT	2	8	51170	51177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010333	TTCG	2	8	51195	51202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010333	AGGG	2	8	51577	51584	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010333	CGCC	2	8	51947	51954	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_010333	CGGC	2	8	53157	53164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010333	ACTT	2	8	54113	54120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010333	TCGC	2	8	57053	57060	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010333	GGGC	2	8	57102	57109	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010333	CCTC	2	8	68923	68930	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_010333	CGCC	2	8	72026	72033	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_010333	TAAG	2	8	73645	73652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010333	GGGT	2	8	76941	76948	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010333	CGCC	2	8	87413	87420	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_010333	GCTC	2	8	87483	87490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010333	CGCC	2	8	88234	88241	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_010333	GCCA	2	8	89918	89925	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010333	CGTG	2	8	96603	96610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010333	GACC	2	8	102093	102100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010333	CTCG	2	8	103292	103299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010333	GTCC	2	8	103306	103313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010333	CGAG	2	8	106456	106463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010333	CGGT	2	8	106720	106727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010333	CAAA	2	8	106816	106823	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010333	CTTC	2	8	106851	106858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010333	ACGC	2	8	109743	109750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010333	GTTG	2	8	109848	109855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010333	CGTG	2	8	110865	110872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010333	CAGC	2	8	113001	113008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010333	GATC	2	8	113037	113044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010333	CTCG	2	8	115500	115507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010333	TCAT	2	8	115554	115561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010333	GCTC	2	8	116467	116474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010333	TGAT	2	8	116848	116855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010333	TAAC	2	8	118171	118178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010333	ATCG	2	8	118287	118294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010333	CCTC	2	8	118371	118378	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_010333	GATT	2	8	118482	118489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010333	GGTC	2	8	123502	123509	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010333	ATCG	2	8	123510	123517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010333	CTCG	2	8	127226	127233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010333	GTCG	2	8	127267	127274	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010333	CAGG	2	8	127432	127439	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010333	GCCG	2	8	140340	140347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010333	ACTG	2	8	141103	141110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010333	CCGC	2	8	141718	141725	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_010333	GGCC	2	8	141764	141771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010333	TGCG	2	8	142036	142043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010333	AACC	2	8	144656	144663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010333	GGGC	2	8	145763	145770	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010333	CTGC	2	8	146566	146573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010333	CGGC	2	8	146696	146703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010333	CAGA	2	8	146812	146819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010333	GGGC	2	8	153982	153989	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010333	AGGG	2	8	160485	160492	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010333	CGGG	2	8	160633	160640	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010333	GCTT	2	8	161846	161853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010333	CATC	2	8	161926	161933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010333	AGCC	2	8	162600	162607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010333	CGAC	2	8	166738	166745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010333	CGAG	2	8	166779	166786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010333	CCAC	2	8	169047	169054	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_010333	GCCA	2	8	169069	169076	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010333	TTCG	2	8	171887	171894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010333	TGGG	2	8	171993	172000	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.