MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010280	AG	3	6	5331	5336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010280	AG	3	6	16350	16355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010280	GC	3	6	16666	16671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010280	GA	3	6	17037	17042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010280	AG	3	6	24911	24916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010280	TC	3	6	32520	32525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010280	GC	3	6	34671	34676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010280	GT	3	6	38072	38077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010280	CT	3	6	38143	38148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010280	AG	3	6	38315	38320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010280	GA	3	6	38370	38375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010280	GT	3	6	39470	39475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010280	AG	3	6	39776	39781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010280	AG	3	6	43376	43381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010280	AG	3	6	48658	48663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010280	GA	3	6	58295	58300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010280	GC	3	6	58408	58413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010280	AG	3	6	58492	58497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010280	CT	3	6	59852	59857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010280	AG	3	6	60090	60095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010280	CT	4	8	64777	64784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010280	GA	3	6	64911	64916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010280	AG	3	6	69716	69721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010280	AT	5	10	72557	72566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010280	CT	3	6	74585	74590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010280	TG	3	6	81837	81842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010280	AG	4	8	82838	82845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010280	TC	3	6	84199	84204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010280	GA	3	6	84334	84339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010280	AG	3	6	84414	84419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010280	AG	3	6	87413	87418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010280	TG	3	6	92775	92780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010280	TC	3	6	105806	105811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010280	TC	3	6	109937	109942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010280	AG	3	6	114347	114352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010280	AG	3	6	114464	114469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010280	CT	3	6	114486	114491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010280	AG	3	6	114543	114548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010280	GA	3	6	114566	114571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010280	TG	3	6	126374	126379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010280	GA	3	6	126472	126477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010280	AG	3	6	126551	126556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010280	AG	3	6	126560	126565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010280	CT	4	8	133198	133205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010280	AG	3	6	133615	133620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010280	GT	3	6	133691	133696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010280	TA	3	6	133966	133971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010280	GA	3	6	134278	134283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010280	GT	3	6	134385	134390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010280	AC	3	6	135206	135211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010280	AC	3	6	135375	135380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010280	GA	3	6	135438	135443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010280	GA	3	6	136156	136161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010280	TC	3	6	136638	136643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010280	GT	3	6	136987	136992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010280	GC	3	6	137465	137470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010280	AG	3	6	138757	138762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010280	GA	3	6	138843	138848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010280	TC	3	6	139037	139042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010280	AG	3	6	155659	155664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010280	GT	3	6	155735	155740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010280	TA	3	6	156010	156015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010280	GA	3	6	156322	156327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010280	GT	3	6	156429	156434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010280	AC	3	6	157250	157255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010280	AC	3	6	157419	157424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010280	GA	3	6	157482	157487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010280	GA	3	6	158200	158205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010280	TC	3	6	158682	158687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010280	GT	3	6	159031	159036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010280	GC	3	6	159509	159514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010280	AG	3	6	160801	160806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010280	GA	3	6	160887	160892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010280	TC	3	6	161081	161086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010280	GA	3	6	177223	177228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010280	TC	3	6	183364	183369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010280	CT	3	6	186217	186222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010280	AG	3	6	188574	188579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010280	AG	3	6	195200	195205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010280	AG	3	6	195315	195320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010280	CG	3	6	195825	195830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010280	CT	4	8	195940	195947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010280	AG	3	6	199240	199245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010280	AG	3	6	201304	201309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010280	AG	3	6	202972	202977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010280	CA	3	6	208147	208152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010280	TC	3	6	210580	210585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010280	AG	3	6	214361	214366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010280	GA	3	6	214462	214467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010280	AG	3	6	214513	214518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010280	GA	3	6	217020	217025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010280	TG	3	6	220699	220704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010280	CT	3	6	222278	222283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010280	AC	3	6	226297	226302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010280	CT	3	6	240186	240191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010280	CT	3	6	240252	240257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010280	GA	3	6	245790	245795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010280	TG	3	6	248401	248406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010280	AG	3	6	253813	253818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010280	TA	3	6	253964	253969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010280	CT	4	8	254066	254073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010280	TA	3	6	261627	261632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010280	AT	3	6	269741	269746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010280	GA	3	6	272552	272557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010280	CT	3	6	272573	272578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010280	GT	3	6	272586	272591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010280	TA	3	6	275854	275859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010280	TC	3	6	278501	278506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010280	GA	3	6	278582	278587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010280	TA	3	6	282343	282348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010280	CA	3	6	282401	282406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010280	AG	3	6	284324	284329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010280	TC	3	6	284563	284568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010280	GT	3	6	285638	285643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010280	AG	3	6	287575	287580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010280	CT	3	6	287589	287594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010280	TA	3	6	288157	288162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010280	AT	3	6	297638	297643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010280	GT	3	6	298011	298016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010280	AG	3	6	298302	298307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010280	TC	3	6	303962	303967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010280	TC	3	6	311543	311548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010280	TG	3	6	311555	311560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010280	CT	3	6	317786	317791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010280	AG	3	6	317800	317805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010280	TC	3	6	323873	323878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010280	TC	3	6	323945	323950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010280	GA	3	6	329273	329278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010280	AG	3	6	331628	331633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010280	TA	3	6	333526	333531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010280	TA	3	6	335617	335622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010280	TA	4	8	335841	335848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010280	AG	3	6	339793	339798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010280	GA	3	6	339806	339811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010280	CT	3	6	340728	340733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010280	AG	3	6	342794	342799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010280	GA	3	6	342952	342957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010280	AG	3	6	343469	343474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010280	CT	3	6	343538	343543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010280	GA	3	6	348790	348795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010280	CT	3	6	348797	348802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010280	TC	3	6	350165	350170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010280	AG	3	6	350248	350253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010280	GA	3	6	358662	358667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010280	AT	3	6	358763	358768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010280	CT	3	6	361030	361035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010280	CT	3	6	362400	362405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010280	AG	3	6	364526	364531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010280	CT	3	6	364592	364597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_010280	AG	3	6	364922	364927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010280	TC	3	6	366014	366019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_010280	AG	3	6	370248	370253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010280	TG	4	8	373597	373604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010280	GA	3	6	377867	377872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_010280	AG	4	8	387090	387097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.