MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 2953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010280	GCA	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010280	TAA	3	9	2920	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010280	T	6	6	2940	2945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010280	T	6	6	2963	2968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010280	CAA	2	6	5196	5201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010280	TTG	2	6	5207	5212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010280	GAA	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010280	ACA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010280	A	7	7	5301	5307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010280	AGC	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010280	AG	3	6	5331	5336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010280	T	6	6	16262	16267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010280	TGA	2	6	16296	16301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010280	AG	3	6	16350	16355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010280	GCAG	2	8	16435	16442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010280	TTC	2	6	16522	16527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010280	CGG	2	6	16541	16546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010280	GAA	2	6	16630	16635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010280	GC	3	6	16666	16671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010280	TTC	2	6	16672	16677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010280	GAAGA	2	10	16687	16696	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010280	TCA	2	6	16707	16712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010280	GAAA	2	8	16838	16845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010280	TTC	2	6	16851	16856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010280	TGC	2	6	16865	16870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010280	GAA	2	6	16897	16902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010280	T	6	6	16909	16914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010280	A	6	6	16915	16920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010280	T	9	9	17010	17018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010280	A	8	8	17019	17026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010280	GA	3	6	17037	17042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010280	A	6	6	20955	20960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010280	TAAT	3	12	20970	20981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010280	T	6	6	21007	21012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010280	CTCC	2	8	24842	24849	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_010280	TCTGCA	2	12	24855	24866	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010280	T	8	8	24870	24877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010280	A	6	6	24879	24884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010280	AG	3	6	24911	24916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010280	A	7	7	24934	24940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010280	T	7	7	24949	24955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010280	TGT	2	6	24974	24979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010280	TCT	2	6	25048	25053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010280	CAA	2	6	25062	25067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010280	AAG	2	6	26170	26175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010280	TCT	2	6	26180	26185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010280	TTTCT	2	10	26198	26207	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010280	TGT	2	6	26218	26223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010280	T	6	6	26298	26303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010280	CTT	2	6	26335	26340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010280	CGAG	2	8	26406	26413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010280	ATGA	2	8	29769	29776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010280	AGAA	2	8	29781	29788	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010280	T	7	7	30008	30014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010280	TAT	2	6	30022	30027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010280	T	6	6	32116	32121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010280	TCT	2	6	32159	32164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010280	GAA	2	6	32233	32238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010280	T	6	6	32242	32247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010280	CGG	2	6	32293	32298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010280	AGA	2	6	32330	32335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010280	CTT	2	6	32492	32497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010280	TC	3	6	32520	32525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010280	AGG	2	6	33274	33279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010280	T	6	6	34294	34299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010280	AAG	2	6	34304	34309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010280	TATTTT	2	12	34332	34343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010280	A	6	6	34360	34365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010280	GC	3	6	34671	34676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010280	TCT	2	6	34697	34702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010280	GT	3	6	38072	38077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010280	CT	3	6	38143	38148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010280	AAT	2	6	38156	38161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010280	GTA	2	6	38169	38174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010280	TCT	2	6	38185	38190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010280	T	6	6	38253	38258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010280	T	6	6	38294	38299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010280	AG	3	6	38315	38320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010280	GA	3	6	38370	38375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010280	ATG	2	6	38408	38413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010280	AGA	2	6	38434	38439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010280	GT	3	6	39470	39475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010280	AGAAT	2	10	39496	39505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010280	ATTT	2	8	39628	39635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010280	ATG	2	6	39697	39702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010280	AGGGG	2	10	39727	39736	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010280	GAA	2	6	39767	39772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010280	AG	3	6	39776	39781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010280	ATAC	2	8	39808	39815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010280	GCT	2	6	39880	39885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010280	TCGT	2	8	39953	39960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010280	T	7	7	39967	39973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010280	AGGG	2	8	40118	40125	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010280	TTTA	2	8	43079	43086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010280	TTC	2	6	43088	43093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010280	AG	3	6	43376	43381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010280	TAG	2	6	46140	46145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010280	AG	3	6	48658	48663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010280	TTGC	2	8	48691	48698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010280	G	6	6	53082	53087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010280	GTC	2	6	53192	53197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010280	AGG	2	6	53294	53299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010280	A	7	7	54954	54960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010280	AGGA	2	8	54964	54971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010280	TGA	2	6	54980	54985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010280	AGAA	2	8	55004	55011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010280	T	7	7	55206	55212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010280	ATTT	2	8	55239	55246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010280	GA	3	6	58295	58300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010280	A	6	6	58336	58341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010280	GC	3	6	58408	58413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010280	TCT	2	6	58458	58463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010280	TTG	2	6	58483	58488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010280	AG	3	6	58492	58497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010280	AGG	2	6	58500	58505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010280	A	8	8	58536	58543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010280	CCGA	2	8	58550	58557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010280	TTA	2	6	58584	58589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010280	TTA	2	6	58593	58598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010280	CT	3	6	59852	59857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010280	GGC	2	6	59879	59884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010280	AGC	2	6	59957	59962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010280	GAA	2	6	60051	60056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010280	CCT	2	6	60068	60073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010280	AG	3	6	60090	60095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010280	A	7	7	60142	60148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010280	TTG	2	6	60193	60198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010280	GTT	2	6	60247	60252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010280	AAAAG	2	10	60310	60319	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010280	TAC	2	6	60374	60379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010280	AAAG	2	8	60380	60387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010280	AGGTA	2	10	63709	63718	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010280	TTG	2	6	64761	64766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010280	CT	4	8	64777	64784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010280	T	6	6	64798	64803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010280	T	6	6	64806	64811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010280	TTTG	2	8	64813	64820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010280	TGT	2	6	64821	64826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010280	T	8	8	64839	64846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010280	CAA	2	6	64859	64864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010280	T	7	7	64866	64872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010280	TCCTT	2	10	64892	64901	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_010280	GA	3	6	64911	64916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010280	TCTT	2	8	64937	64944	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010280	T	8	8	64943	64950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010280	A	7	7	64965	64971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010280	T	6	6	65005	65010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010280	ATA	2	6	65023	65028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010280	CTCCA	2	10	65046	65055	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
150	NC_010280	TGA	2	6	65071	65076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_010280	A	6	6	72521	72526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_010280	TC	3	6	84199	84204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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286	NC_010280	AAG	2	6	134476	134481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_010280	AGTT	2	8	134577	134584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_010280	GCC	2	6	134860	134865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_010280	GAG	2	6	134867	134872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_010280	TGC	2	6	135030	135035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_010280	AGG	2	6	135154	135159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
295	NC_010280	AC	3	6	135206	135211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
296	NC_010280	AC	3	6	135375	135380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
297	NC_010280	CAT	2	6	135390	135395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_010280	GCC	2	6	156904	156909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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428	NC_010280	CAT	2	6	157434	157439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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434	NC_010280	TGT	2	6	157654	157659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NC_010280	GTG	2	6	157670	157675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_010280	TAA	2	6	157826	157831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_010280	GACC	2	8	158208	158215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
445	NC_010280	ATG	2	6	158438	158443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_010280	GCC	2	6	159769	159774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
466	NC_010280	GTA	2	6	159883	159888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_010280	TCC	2	6	160125	160130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
470	NC_010280	GGA	2	6	160142	160147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
471	NC_010280	CAA	2	6	160222	160227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
472	NC_010280	CGG	2	6	160261	160266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_010280	CCA	2	6	160329	160334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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482	NC_010280	GA	3	6	160887	160892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
483	NC_010280	GTC	2	6	160976	160981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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486	NC_010280	TC	3	6	161081	161086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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