MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 21485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010175	AT	3	6	115352	115357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010175	T	7	7	115372	115378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010175	T	7	7	115381	115387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010175	CCT	2	6	115409	115414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_010175	ACT	2	6	115443	115448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_010175	CAC	2	6	115534	115539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_010175	TAT	2	6	119822	119827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010175	ACA	2	6	119828	119833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010175	TGT	2	6	119871	119876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010175	GGA	2	6	119890	119895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010175	CAC	2	6	119924	119929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_010175	CACC	2	8	120038	120045	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
513	NC_010175	CAC	2	6	120117	120122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_010175	TGC	2	6	120223	120228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010175	CAC	2	6	120235	120240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_010175	GGCG	2	8	120250	120257	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
517	NC_010175	CAC	2	6	120310	120315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_010175	TGC	2	6	120416	120421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_010175	CAC	2	6	120428	120433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_010175	GCGT	2	8	120444	120451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
521	NC_010175	CAC	2	6	120503	120508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_010175	GCCA	2	8	120601	120608	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
523	NC_010175	TGC	2	6	120609	120614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_010175	CAC	2	6	120621	120626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_010175	GGCG	2	8	120636	120643	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
526	NC_010175	CAC	2	6	120696	120701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_010175	GCCA	2	8	120794	120801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
528	NC_010175	TGC	2	6	120802	120807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_010175	CAC	2	6	120814	120819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_010175	GGCG	2	8	120829	120836	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
531	NC_010175	CAC	2	6	120889	120894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_010175	TGC	2	6	120996	121001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_010175	CCA	2	6	121007	121012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_010175	CAC	2	6	121083	121088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_010175	GCCA	2	8	121181	121188	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
536	NC_010175	TGC	2	6	121189	121194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_010175	CAC	2	6	121201	121206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_010175	GGCG	2	8	121216	121223	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
539	NC_010175	CAC	2	6	121276	121281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_010175	TGC	2	6	121382	121387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_010175	CAC	2	6	121394	121399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_010175	GT	3	6	121412	121417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_010175	CAC	2	6	121469	121474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_010175	A	6	6	121493	121498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010175	CCA	2	6	121537	121542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_010175	CCAG	2	8	121564	121571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
547	NC_010175	CCA	2	6	122116	122121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_010175	GA	3	6	122136	122141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010175	CCG	2	6	122204	122209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_010175	ATC	2	6	122261	122266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_010175	GTA	2	6	122289	122294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010175	TCCC	2	8	122351	122358	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
553	NC_010175	TGC	2	6	122362	122367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_010175	ATC	2	6	122384	122389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_010175	CCCA	2	8	122425	122432	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
556	NC_010175	TGG	2	6	122455	122460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010175	ATC	2	6	122485	122490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_010175	CG	3	6	122510	122515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_010175	CCCA	2	8	122527	122534	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
560	NC_010175	CAC	2	6	122558	122563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_010175	CA	3	6	122576	122581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_010175	TGC	2	6	122671	122676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_010175	ATG	2	6	122722	122727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010175	GTG	2	6	122810	122815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010175	ACC	2	6	122847	122852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_010175	ATT	2	6	122873	122878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010175	AC	3	6	123747	123752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_010175	CACCCC	2	12	123768	123779	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
569	NC_010175	CTC	2	6	123789	123794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_010175	C	6	6	123794	123799	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
571	NC_010175	A	6	6	123814	123819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010175	CTC	2	6	123827	123832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_010175	C	6	6	123832	123837	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
574	NC_010175	CTC	2	6	123862	123867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_010175	C	6	6	123867	123872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
576	NC_010175	G	6	6	123876	123881	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
577	NC_010175	G	6	6	123891	123896	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
578	NC_010175	CTC	2	6	123948	123953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_010175	C	6	6	123953	123958	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
580	NC_010175	G	6	6	123962	123967	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010175	G	6	6	123977	123982	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010175	CTC	2	6	124029	124034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_010175	CGG	2	6	124038	124043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_010175	GAG	2	6	124048	124053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_010175	G	6	6	124062	124067	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010175	TGAGG	2	10	124068	124077	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
587	NC_010175	TCCCC	2	10	124115	124124	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
588	NC_010175	CTC	2	6	124128	124133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_010175	C	6	6	124133	124138	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
590	NC_010175	G	6	6	124142	124147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
591	NC_010175	G	6	6	124157	124162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010175	CCA	2	6	124181	124186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_010175	GACC	2	8	125128	125135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
594	NC_010175	GCT	2	6	125209	125214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010175	ATG	2	6	125277	125282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010175	GCT	2	6	125384	125389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010175	ATG	2	6	125452	125457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010175	GCTGC	2	10	125493	125502	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
599	NC_010175	GCT	2	6	125559	125564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_010175	CGT	2	6	127115	127120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_010175	AGC	2	6	127141	127146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_010175	CAC	2	6	127153	127158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_010175	CAC	2	6	127175	127180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_010175	CAG	2	6	127190	127195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_010175	CTT	2	6	127209	127214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_010175	TCA	2	6	127215	127220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_010175	ACCA	2	8	127277	127284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_010175	CGA	2	6	127330	127335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010175	TGC	2	6	127420	127425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_010175	CTG	2	6	127471	127476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010175	CAT	2	6	127500	127505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_010175	CGA	2	6	127513	127518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_010175	TGC	2	6	127665	127670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010175	CTG	2	6	127716	127721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010175	CAT	2	6	127745	127750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010175	CGA	2	6	127758	127763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_010175	CCG	2	6	127844	127849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_010175	CAC	2	6	127887	127892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_010175	GCA	2	6	127948	127953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010175	CTG	2	6	128006	128011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010175	CAT	2	6	128035	128040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010175	CGA	2	6	128048	128053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_010175	CCG	2	6	128134	128139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_010175	CAC	2	6	128177	128182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_010175	GCA	2	6	128238	128243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_010175	CTG	2	6	128296	128301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_010175	CAT	2	6	128325	128330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_010175	CGA	2	6	128338	128343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010175	CAC	2	6	128431	128436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_010175	CAC	2	6	128476	128481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_010175	TGC	2	6	128544	128549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_010175	CTG	2	6	128595	128600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_010175	CAT	2	6	128624	128629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_010175	CGA	2	6	128637	128642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_010175	CAC	2	6	128721	128726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_010175	TGC	2	6	128789	128794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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641	NC_010175	TGC	2	6	129088	129093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_010175	GCA	2	6	129616	129621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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764	NC_010175	GAG	2	6	157501	157506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
765	NC_010175	TACA	2	8	157507	157514	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
766	NC_010175	GCA	2	6	157725	157730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
767	NC_010175	AGC	2	6	157737	157742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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769	NC_010175	GATT	2	8	159844	159851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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