MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 21485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010175	GC	3	6	1043840	1043845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_010175	CGGT	2	8	1043847	1043854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_010175	GCA	3	9	1043855	1043863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_010175	CCGC	2	8	1043870	1043877	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5005	NC_010175	GTT	2	6	1043964	1043969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_010175	AAC	2	6	1044365	1044370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_010175	GCTC	2	8	1044408	1044415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_010175	TGC	2	6	1044454	1044459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_010175	T	6	6	1044587	1044592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_010175	CAC	2	6	1044652	1044657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_010175	CGT	2	6	1044786	1044791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_010175	CCTGC	2	10	1044999	1045008	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5013	NC_010175	CCCG	2	8	1045038	1045045	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5014	NC_010175	TGA	2	6	1045159	1045164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_010175	AGG	2	6	1045183	1045188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_010175	TGA	3	9	1045221	1045229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_010175	CTG	2	6	1045250	1045255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_010175	CGG	2	6	1045257	1045262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_010175	ACGG	2	8	1045302	1045309	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5020	NC_010175	GGA	3	9	1045522	1045530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_010175	TC	3	6	1045589	1045594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_010175	CCG	2	6	1045705	1045710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_010175	CTG	2	6	1045728	1045733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_010175	CAA	2	6	1045756	1045761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_010175	GCAT	2	8	1045782	1045789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_010175	CGATG	2	10	1045797	1045806	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5027	NC_010175	GCA	2	6	1045890	1045895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_010175	CG	3	6	1045915	1045920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_010175	ATTC	2	8	1045948	1045955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_010175	GCG	2	6	1045978	1045983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_010175	G	6	6	1046081	1046086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_010175	G	6	6	1046096	1046101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_010175	GTGA	2	8	1046114	1046121	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_010175	TGT	2	6	1046199	1046204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_010175	GCA	2	6	1046238	1046243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_010175	ATG	2	6	1046277	1046282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_010175	CTG	2	6	1046318	1046323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_010175	AGC	2	6	1046325	1046330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_010175	G	6	6	1046444	1046449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_010175	GTGA	2	8	1046462	1046469	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_010175	GCA	2	6	1046586	1046591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_010175	ATG	2	6	1046625	1046630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_010175	CTG	2	6	1046666	1046671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_010175	AGC	2	6	1046673	1046678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_010175	G	6	6	1046777	1046782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_010175	G	6	6	1046792	1046797	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_010175	GTGA	2	8	1046810	1046817	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_010175	GCA	2	6	1046934	1046939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_010175	ATCC	2	8	1046992	1046999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_010175	TCA	2	6	1047181	1047186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_010175	CCA	2	6	1047195	1047200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_010175	CAC	2	6	1047209	1047214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_010175	CCA	2	6	1047219	1047224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_010175	CTA	2	6	1048628	1048633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_010175	CAC	2	6	1048648	1048653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_010175	TC	3	6	1048770	1048775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_010175	AG	3	6	1048856	1048861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_010175	GCCT	2	8	1048880	1048887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_010175	ATC	2	6	1048890	1048895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_010175	GTA	2	6	1051092	1051097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_010175	CTCC	2	8	1051115	1051122	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5062	NC_010175	GCC	2	6	1051135	1051140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_010175	ACACC	2	10	1052026	1052035	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5064	NC_010175	CAC	2	6	1052044	1052049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_010175	GTC	2	6	1052127	1052132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_010175	CGT	2	6	1052203	1052208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_010175	TCC	2	6	1052210	1052215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_010175	CAC	2	6	1052274	1052279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_010175	T	6	6	1052291	1052296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_010175	CAA	2	6	1052297	1052302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_010175	ATC	2	6	1055162	1055167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_010175	CGC	2	6	1055218	1055223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_010175	CAT	2	6	1055237	1055242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_010175	TCC	2	6	1056322	1056327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_010175	TGGGG	2	10	1056348	1056357	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_010175	GC	4	8	1056447	1056454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_010175	TCC	2	6	1056493	1056498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_010175	GGGC	2	8	1056511	1056518	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_010175	C	6	6	1056533	1056538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5080	NC_010175	CGTGG	2	10	1056600	1056609	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5081	NC_010175	GTGGC	2	10	1056610	1056619	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5082	NC_010175	TGGCCG	2	12	1056669	1056680	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_010175	CCTG	2	8	1056737	1056744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_010175	GAT	2	6	1056753	1056758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_010175	CCG	2	6	1056779	1056784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_010175	GCA	2	6	1056840	1056845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_010175	GCG	2	6	1056928	1056933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_010175	GGGC	2	8	1057037	1057044	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_010175	CACCC	2	10	1057060	1057069	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5090	NC_010175	AACC	2	8	1057094	1057101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_010175	CAG	2	6	1057120	1057125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_010175	GGC	2	6	1057165	1057170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_010175	ATG	2	6	1057232	1057237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_010175	ACG	2	6	1057244	1057249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_010175	ACA	2	6	1057256	1057261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_010175	TCC	2	6	1057348	1057353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_010175	GTG	2	6	1057362	1057367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_010175	C	6	6	1057443	1057448	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5099	NC_010175	TCA	2	6	1061676	1061681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_010175	CCA	2	6	1062591	1062596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_010175	CCT	2	6	1063264	1063269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_010175	AGC	2	6	1063297	1063302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_010175	ATG	2	6	1063315	1063320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_010175	ACT	2	6	1063346	1063351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_010175	CAC	2	6	1065424	1065429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_010175	AG	3	6	1065438	1065443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_010175	CGCTC	2	10	1065475	1065484	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5108	NC_010175	CGC	2	6	1065495	1065500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_010175	TCG	2	6	1065672	1065677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_010175	TGC	2	6	1065682	1065687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_010175	AGT	2	6	1065735	1065740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_010175	TCG	2	6	1065907	1065912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_010175	TGC	2	6	1065917	1065922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_010175	AGT	2	6	1065970	1065975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_010175	GCG	2	6	1066174	1066179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_010175	GCT	2	6	1066218	1066223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_010175	GC	3	6	1071099	1071104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_010175	CTG	2	6	1071141	1071146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_010175	CAT	2	6	1071165	1071170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_010175	CAC	2	6	1071207	1071212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_010175	GCC	2	6	1071251	1071256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_010175	CCGTC	2	10	1071259	1071268	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5123	NC_010175	CCTA	2	8	1071287	1071294	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_010175	AT	3	6	1071338	1071343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_010175	CAC	2	6	1071344	1071349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_010175	AG	3	6	1071358	1071363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_010175	TCA	2	6	1071395	1071400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_010175	AC	3	6	1071428	1071433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5130	NC_010175	GTG	2	6	1071547	1071552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5163	NC_010175	GCCGA	2	10	1079082	1079091	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5260	NC_010175	CGG	2	6	1095882	1095887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_010175	AC	3	6	1095911	1095916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5262	NC_010175	CGA	2	6	1095953	1095958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5263	NC_010175	CAT	2	6	1095959	1095964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_010175	ATC	2	6	1095967	1095972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5265	NC_010175	GCC	2	6	1096092	1096097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5266	NC_010175	CGA	2	6	1096098	1096103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5267	NC_010175	CAA	2	6	1096109	1096114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5268	NC_010175	CAAAAA	2	12	1096142	1096153	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5269	NC_010175	AT	3	6	1096155	1096160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_010175	ATG	2	6	1096183	1096188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5272	NC_010175	TCA	2	6	1096217	1096222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5275	NC_010175	CGAAG	2	10	1096302	1096311	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5276	NC_010175	CAGG	2	8	1096328	1096335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5280	NC_010175	GCA	2	6	1101296	1101301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5281	NC_010175	ACT	2	6	1101341	1101346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5282	NC_010175	ATT	2	6	1103229	1103234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_010175	AGCAT	2	10	1103257	1103266	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5284	NC_010175	CCAA	2	8	1103278	1103285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5285	NC_010175	GTG	2	6	1103319	1103324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5288	NC_010175	GCTGC	2	10	1105432	1105441	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5290	NC_010175	GCT	2	6	1105534	1105539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5291	NC_010175	ACCG	2	8	1105583	1105590	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5292	NC_010175	GCA	2	6	1105640	1105645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5293	NC_010175	AC	3	6	1105693	1105698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5294	NC_010175	CCT	2	6	1105732	1105737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5299	NC_010175	CTC	2	6	1105824	1105829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5303	NC_010175	TCG	2	6	1106244	1106249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5304	NC_010175	TCG	2	6	1107551	1107556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5373	NC_010175	TCAA	2	8	1121489	1121496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5374	NC_010175	A	6	6	1121495	1121500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5375	NC_010175	CT	3	6	1123762	1123767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5376	NC_010175	TGA	2	6	1123785	1123790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5377	NC_010175	ATC	2	6	1123905	1123910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5379	NC_010175	TCCCGC	2	12	1123956	1123967	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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5381	NC_010175	TGT	2	6	1124039	1124044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5382	NC_010175	TGGA	2	8	1124095	1124102	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_010175	TGC	2	6	1124156	1124161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5384	NC_010175	TGA	2	6	1124225	1124230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5385	NC_010175	GGT	2	6	1124282	1124287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5386	NC_010175	GT	3	6	1124286	1124291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5387	NC_010175	AATGG	2	10	1124403	1124412	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_010175	GTT	2	6	1124416	1124421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5391	NC_010175	TGA	2	6	1124503	1124508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5395	NC_010175	G	6	6	1124738	1124743	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5500	NC_010175	GCGCA	2	10	1137449	1137458	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

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