MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri GWSS

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010118	TATAA	2	10	14660	14669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010118	TTCTA	2	10	35623	35632	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010118	CCTAA	2	10	42017	42026	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010118	CCTAA	2	10	42038	42047	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010118	AGGTA	2	10	46718	46727	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010118	ATTTT	2	10	61822	61831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010118	AGAGC	2	10	63174	63183	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010118	GGAAC	2	10	63586	63595	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010118	TTTTA	2	10	73007	73016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010118	GGTAA	2	10	73483	73492	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010118	TAGTT	2	10	76240	76249	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010118	ATAGT	2	10	76513	76522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010118	GATAA	2	10	77841	77850	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010118	ATTTT	2	10	79349	79358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010118	AATTA	2	10	85708	85717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010118	AAATA	2	10	115670	115679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010118	ATATA	2	10	137664	137673	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010118	AATAT	2	10	137674	137683	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010118	AATAT	2	10	137696	137705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010118	TAAAG	2	10	146781	146790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010118	ATAAA	2	10	160530	160539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010118	GAAAA	2	10	161492	161501	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010118	TATAT	3	15	161995	162009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010118	TTTCA	2	10	162063	162072	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010118	TAATT	2	10	162220	162229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010118	ATTAA	2	10	162392	162401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010118	GATAA	2	10	169230	169239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010118	TATAA	2	10	172854	172863	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010118	ATATT	3	15	185536	185550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010118	TTTAA	2	10	185556	185565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010118	TAAAA	2	10	186001	186010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010118	TTTAA	2	10	186016	186025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010118	CAAAG	2	10	186040	186049	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010118	AAGCA	2	10	186068	186077	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010118	GTATG	2	10	186120	186129	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010118	AATAG	2	10	188271	188280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010118	CTTAA	2	10	200879	200888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010118	AAATT	2	10	203615	203624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010118	AATTA	2	10	206424	206433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010118	TTTTA	2	10	228913	228922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010118	ATTTA	2	10	230167	230176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.