MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 1323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010117	ACCC	2	8	6709	6716	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_010117	CCCA	2	8	8183	8190	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_010117	CCCT	2	8	11857	11864	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_010117	AAAT	2	8	12467	12474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010117	TTAG	2	8	13110	13117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010117	GTGG	2	8	19006	19013	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010117	GATC	2	8	19388	19395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010117	TCTT	2	8	19458	19465	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010117	ACCC	2	8	19758	19765	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_010117	ATAA	2	8	19863	19870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010117	TTGT	2	8	20108	20115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010117	ATTC	2	8	20374	20381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010117	GGGT	2	8	23404	23411	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010117	ATGA	2	8	23568	23575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010117	ATCC	2	8	23666	23673	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010117	GGCT	2	8	25036	25043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010117	GCTT	2	8	25243	25250	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010117	GCAG	2	8	28599	28606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010117	AATT	2	8	30044	30051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010117	GCTT	2	8	30078	30085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010117	AAAC	2	8	34833	34840	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010117	CCCG	2	8	35928	35935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_010117	AAGA	2	8	38308	38315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010117	TAAT	2	8	38871	38878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010117	CTTT	2	8	39234	39241	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010117	AGAT	2	8	39743	39750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010117	TGCC	2	8	41866	41873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010117	GGGA	2	8	41926	41933	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010117	TGAC	2	8	42322	42329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010117	CCAC	2	8	42872	42879	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_010117	ATTT	2	8	43628	43635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010117	TGAG	2	8	47151	47158	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010117	TCCC	2	8	47171	47178	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_010117	TAAT	2	8	48247	48254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010117	ATAA	2	8	48306	48313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010117	AAGG	2	8	55909	55916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010117	ATTA	2	8	56089	56096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010117	TCGC	2	8	57090	57097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010117	TGTC	2	8	60348	60355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010117	ATTG	2	8	64123	64130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010117	TATT	2	8	64333	64340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010117	TGGG	2	8	64497	64504	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010117	GTTG	2	8	65029	65036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010117	ATTA	2	8	65724	65731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010117	CTTT	2	8	69570	69577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010117	AGGT	2	8	69950	69957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010117	AGCG	2	8	77853	77860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010117	ATGG	2	8	89335	89342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010117	GTTG	2	8	96070	96077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010117	TTTA	2	8	98772	98779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010117	CGGT	2	8	98864	98871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010117	ACCC	2	8	107708	107715	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_010117	TCAA	2	8	110060	110067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010117	TTAA	2	8	111046	111053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010117	TAAA	2	8	118194	118201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010117	CATG	2	8	122929	122936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010117	AATT	2	8	127725	127732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010117	GCAT	2	8	127962	127969	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010117	TTTA	2	8	128065	128072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010117	ATTA	2	8	128209	128216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010117	CGAG	2	8	128236	128243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010117	TTAT	2	8	128369	128376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010117	TCCT	2	8	128665	128672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010117	AGCG	2	8	130962	130969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010117	AGTC	2	8	132181	132188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010117	AAGC	2	8	132466	132473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010117	CAAC	2	8	132522	132529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010117	CTGC	2	8	133136	133143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010117	CGCC	2	8	133148	133155	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_010117	ATGG	2	8	133195	133202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010117	GCAA	2	8	133654	133661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010117	TTTA	2	8	133806	133813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010117	TGGT	2	8	133875	133882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010117	GAAG	2	8	133946	133953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010117	GGGT	2	8	135698	135705	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010117	CAGG	2	8	137652	137659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010117	GCCA	2	8	137884	137891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010117	AAAT	2	8	143998	144005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010117	AAGA	2	8	145184	145191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010117	AAGT	2	8	145197	145204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010117	AAAG	2	8	145225	145232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010117	AGAA	2	8	145245	145252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010117	AGAT	2	8	145389	145396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010117	GAAA	2	8	145525	145532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010117	TTTC	2	8	147757	147764	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010117	GTGG	2	8	154898	154905	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010117	AAAC	2	8	158433	158440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010117	ATGA	2	8	163833	163840	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010117	TAAT	2	8	163877	163884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010117	CCAT	2	8	166137	166144	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010117	TAAA	2	8	171544	171551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010117	AATA	2	8	171806	171813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010117	AAGA	2	8	172159	172166	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010117	AATA	2	8	172378	172385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010117	TAGT	2	8	175377	175384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010117	AGCC	2	8	175520	175527	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010117	AGAA	2	8	175625	175632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010117	AGAT	2	8	175810	175817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010117	GGCT	2	8	175846	175853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010117	CTGT	2	8	179172	179179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010117	AATA	2	8	183840	183847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010117	ATCA	2	8	190466	190473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010117	TATT	2	8	192974	192981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010117	TAAG	2	8	204638	204645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010117	GTAA	2	8	204646	204653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010117	GTTT	2	8	204930	204937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010117	TGTC	2	8	210004	210011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010117	ATTC	2	8	216997	217004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010117	TGGG	2	8	220707	220714	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010117	ATTT	2	8	220947	220954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010117	TTTC	2	8	221040	221047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010117	ACTT	2	8	222002	222009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010117	TGTT	2	8	222082	222089	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010117	CGCC	2	8	222550	222557	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_010117	TTAA	2	8	223923	223930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010117	CCTG	2	8	224985	224992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010117	TAAG	2	8	225370	225377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010117	GTAA	2	8	225380	225387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010117	TATT	2	8	226832	226839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010117	ATGA	2	8	226965	226972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010117	AATT	2	8	227504	227511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010117	AAAT	2	8	229213	229220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010117	AATT	2	8	230150	230157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010117	TGAT	2	8	239192	239199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010117	TACC	2	8	240539	240546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_010117	ACTT	2	8	242145	242152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010117	ATCT	2	8	242244	242251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010117	ACTG	2	8	242277	242284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010117	AAAG	2	8	242642	242649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010117	TGAT	2	8	243541	243548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010117	TAAA	2	8	243934	243941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010117	ACGG	2	8	245731	245738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010117	TAAT	2	8	245882	245889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010117	AGCG	2	8	245964	245971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010117	TTAT	2	8	246583	246590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010117	CCTA	2	8	246949	246956	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010117	CAAA	2	8	248025	248032	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010117	AATT	2	8	248156	248163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010117	AAAG	2	8	249212	249219	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010117	GGCA	2	8	249506	249513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010117	GCCA	2	8	249641	249648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010117	ATAA	2	8	250639	250646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010117	TAAA	2	8	251335	251342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010117	TATT	2	8	252403	252410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010117	ACTG	2	8	252513	252520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010117	CATT	2	8	252577	252584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010117	CATA	2	8	256935	256942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010117	TGGA	2	8	263522	263529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010117	AACC	2	8	264226	264233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_010117	CGGG	2	8	264749	264756	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010117	AGGC	2	8	264764	264771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010117	AGTA	2	8	266847	266854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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