MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 9824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010117	AGA	2	6	279865	279870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_010117	TGA	2	6	279879	279884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010117	AAG	2	6	279885	279890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010117	T	6	6	280193	280198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_010117	AGA	2	6	281418	281423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010117	TCT	2	6	281517	281522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_010117	TCT	2	6	281524	281529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_010117	AGC	2	6	281556	281561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_010117	CCT	2	6	281595	281600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_010117	CT	3	6	281621	281626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_010117	GAA	2	6	282050	282055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010117	TTG	2	6	282065	282070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010117	GAG	2	6	282088	282093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_010117	TTA	2	6	282095	282100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010117	T	6	6	282683	282688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010117	GAT	2	6	282719	282724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010117	TGC	2	6	284041	284046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_010117	GGT	2	6	284057	284062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_010117	TAA	3	9	284115	284123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_010117	ATA	2	6	284691	284696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010117	CGG	2	6	285109	285114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_010117	GCC	2	6	285130	285135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_010117	GT	3	6	285222	285227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010117	ATA	2	6	289581	289586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010117	TGA	2	6	289591	289596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010117	TAA	2	6	289604	289609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010117	AGCGA	2	10	293984	293993	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1528	NC_010117	CATT	2	8	294013	294020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_010117	TCGCT	2	10	294035	294044	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1530	NC_010117	T	7	7	295354	295360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_010117	GGGT	2	8	295406	295413	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010117	TTG	2	6	295431	295436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_010117	TTAA	2	8	295468	295475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010117	AAC	2	6	295488	295493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_010117	TTTA	2	8	295495	295502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010117	ATT	2	6	295525	295530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_010117	TGCG	2	8	295547	295554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_010117	T	6	6	295566	295571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_010117	AGA	2	6	299877	299882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010117	TCT	2	6	299976	299981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_010117	TCT	2	6	299983	299988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_010117	T	6	6	300015	300020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010117	ATTA	2	8	300039	300046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_010117	TA	3	6	305801	305806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010117	GAG	2	6	307128	307133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_010117	GGC	2	6	309183	309188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_010117	CCTT	2	8	310672	310679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_010117	GTGC	2	8	310686	310693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_010117	GTC	2	6	310754	310759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_010117	GAC	2	6	310777	310782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_010117	T	6	6	310858	310863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_010117	TAA	2	6	310874	310879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010117	T	7	7	314936	314942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_010117	TGA	2	6	315144	315149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_010117	GAA	2	6	316315	316320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_010117	AGT	2	6	316357	316362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_010117	GAT	2	6	316422	316427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_010117	CT	3	6	319597	319602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_010117	GCC	2	6	319607	319612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_010117	CTG	2	6	319631	319636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_010117	CCT	2	6	320404	320409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_010117	ATA	2	6	320450	320455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_010117	AAT	2	6	320524	320529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_010117	TTTCG	2	10	320542	320551	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1565	NC_010117	CA	3	6	320908	320913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_010117	ATTC	2	8	320920	320927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_010117	T	6	6	320978	320983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_010117	CAA	2	6	321058	321063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_010117	CCT	2	6	321066	321071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_010117	TGT	2	6	321086	321091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010117	TGA	2	6	321140	321145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_010117	ACCC	2	8	321187	321194	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1573	NC_010117	TCC	2	6	321251	321256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_010117	CAA	2	6	321286	321291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_010117	ACAA	2	8	321300	321307	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_010117	TCGC	2	8	321346	321353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_010117	CAC	2	6	321389	321394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_010117	CAA	2	6	321420	321425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_010117	TTG	2	6	321501	321506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_010117	TGC	2	6	321616	321621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_010117	CTC	2	6	321680	321685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_010117	CAC	2	6	321699	321704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_010117	ATAC	2	8	321734	321741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_010117	TCA	2	6	321784	321789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_010117	CA	3	6	321794	321799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_010117	T	7	7	321863	321869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_010117	GGGT	2	8	321915	321922	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_010117	CGAAA	2	10	324897	324906	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1589	NC_010117	AGG	2	6	324939	324944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_010117	CCAG	2	8	325148	325155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_010117	A	7	7	327619	327625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_010117	GTTT	2	8	329157	329164	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_010117	TTC	2	6	330331	330336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_010117	TGC	3	9	331205	331213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_010117	AAG	2	6	331229	331234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_010117	CATTA	2	10	331244	331253	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1597	NC_010117	ACT	2	6	331294	331299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_010117	GTA	2	6	331307	331312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_010117	TTA	2	6	331322	331327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_010117	GTA	2	6	331337	331342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_010117	ATTG	2	8	331363	331370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_010117	T	6	6	331379	331384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_010117	TTA	2	6	332096	332101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_010117	TAT	2	6	332263	332268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_010117	AGC	2	6	335494	335499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_010117	ATA	3	9	335536	335544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010117	AGC	2	6	335551	335556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_010117	CTT	2	6	335579	335584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_010117	GGC	2	6	335598	335603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_010117	GGT	2	6	335639	335644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_010117	CGA	2	6	335651	335656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_010117	TAT	2	6	335669	335674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_010117	ATG	2	6	335741	335746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_010117	ATG	2	6	335791	335796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_010117	TGAC	2	8	335863	335870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_010117	CGG	2	6	335892	335897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_010117	GAT	2	6	335991	335996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_010117	GAT	2	6	336048	336053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_010117	TCT	2	6	336091	336096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_010117	CGCT	2	8	336114	336121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_010117	GAA	2	6	336146	336151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_010117	A	6	6	336172	336177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_010117	AGA	2	6	336208	336213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_010117	AGA	2	6	336215	336220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_010117	TG	3	6	336269	336274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_010117	AGG	2	6	336411	336416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010117	T	6	6	338405	338410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_010117	TTC	2	6	338425	338430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_010117	T	7	7	338473	338479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_010117	CGG	2	6	338507	338512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_010117	AAG	2	6	338529	338534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_010117	AG	4	8	338581	338588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_010117	AAT	2	6	338609	338614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_010117	GTA	2	6	338656	338661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_010117	TCT	2	6	338665	338670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_010117	CGT	2	6	338693	338698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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