MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 9824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010117	T	7	7	239046	239052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010117	CTG	2	6	239135	239140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010117	AAT	2	6	239180	239185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010117	TGAT	2	8	239192	239199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010117	T	6	6	239199	239204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010117	AGC	2	6	239423	239428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_010117	TG	3	6	239443	239448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010117	AC	3	6	239485	239490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_010117	T	6	6	239523	239528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010117	T	6	6	239534	239539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010117	GGC	2	6	239652	239657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_010117	TTG	2	6	239807	239812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010117	CGA	2	6	239835	239840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_010117	GCA	2	6	239909	239914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_010117	GT	3	6	239962	239967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010117	GAA	2	6	239968	239973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010117	GAA	2	6	240005	240010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010117	AGA	2	6	240051	240056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010117	CAG	2	6	240077	240082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_010117	AG	3	6	240095	240100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010117	GC	3	6	240133	240138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_010117	CTT	2	6	240403	240408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_010117	TACC	2	8	240539	240546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_010117	GAT	2	6	240572	240577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010117	TGC	2	6	240606	240611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_010117	GTC	2	6	240618	240623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_010117	TCGTG	2	10	240627	240636	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_010117	GGA	2	6	240732	240737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010117	GAT	2	6	240745	240750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010117	TCA	2	6	240757	240762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010117	AC	3	6	240783	240788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_010117	CA	3	6	241132	241137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_010117	CCA	2	6	241279	241284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_010117	CGG	2	6	241336	241341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010117	CCA	2	6	241359	241364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_010117	CAA	2	6	241406	241411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_010117	TTG	2	6	241438	241443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010117	GCT	2	6	241461	241466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_010117	GTAAA	2	10	241487	241496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010117	TGG	2	6	241582	241587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010117	GTA	2	6	241618	241623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010117	GAT	2	6	241659	241664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010117	GCG	2	6	241801	241806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_010117	ATT	2	6	241838	241843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010117	AAT	2	6	241909	241914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010117	G	6	6	241963	241968	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010117	TCC	2	6	241973	241978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_010117	TTC	2	6	242100	242105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_010117	ACTT	2	8	242145	242152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_010117	ATCT	2	8	242244	242251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_010117	ACTG	2	8	242277	242284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_010117	AAG	2	6	242481	242486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010117	AC	3	6	242501	242506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_010117	GTG	2	6	242524	242529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010117	AGG	2	6	242612	242617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010117	AGC	2	6	242628	242633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_010117	AAAG	2	8	242642	242649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010117	GTC	2	6	242670	242675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_010117	AGA	2	6	242727	242732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_010117	TCT	2	6	243151	243156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_010117	TCT	2	6	243165	243170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_010117	GGA	2	6	243411	243416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010117	TGG	2	6	243449	243454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010117	GT	3	6	243460	243465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010117	ATG	2	6	243508	243513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010117	TGAT	2	8	243541	243548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_010117	GA	3	6	243643	243648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010117	CGG	2	6	243897	243902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_010117	TAAA	2	8	243934	243941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010117	TCC	2	6	243970	243975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_010117	GTA	2	6	244001	244006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010117	CAG	2	6	244030	244035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_010117	A	6	6	244093	244098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010117	TGA	2	6	244112	244117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_010117	A	6	6	244234	244239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010117	CCT	2	6	244294	244299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_010117	TG	3	6	244378	244383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010117	CTT	2	6	244395	244400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_010117	AAG	2	6	244419	244424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010117	TGAAAT	2	12	245013	245024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010117	TAC	2	6	245078	245083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_010117	ACC	2	6	245175	245180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_010117	TGG	2	6	245235	245240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010117	TCC	2	6	245261	245266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_010117	GGA	2	6	245278	245283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010117	TG	3	6	245322	245327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_010117	GGT	2	6	245398	245403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010117	ACC	2	6	245463	245468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_010117	GGT	2	6	245486	245491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010117	TCA	2	6	245513	245518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_010117	CGT	2	6	245593	245598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_010117	GAG	2	6	245642	245647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010117	ACGG	2	8	245731	245738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_010117	C	6	6	245769	245774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1095	NC_010117	GAC	2	6	245823	245828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_010117	TAAT	2	8	245882	245889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010117	GGC	2	6	245955	245960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_010117	AGCG	2	8	245964	245971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_010117	ATTCC	2	10	245983	245992	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1100	NC_010117	GAT	2	6	246021	246026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010117	T	6	6	246105	246110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010117	AT	3	6	246156	246161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010117	ATA	2	6	246165	246170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010117	TAT	2	6	246178	246183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_010117	TTA	2	6	246562	246567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_010117	TTAT	2	8	246583	246590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010117	T	6	6	246590	246595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010117	ATA	2	6	246689	246694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_010117	TAAATT	2	12	246757	246768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_010117	A	7	7	246875	246881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010117	GAT	2	6	246882	246887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_010117	CCTA	2	8	246949	246956	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_010117	T	6	6	246997	247002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010117	TAA	2	6	247045	247050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010117	ATT	2	6	247099	247104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_010117	TAA	2	6	247107	247112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_010117	T	6	6	247115	247120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010117	TAA	2	6	247126	247131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010117	ATT	2	6	247162	247167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010117	TAA	2	6	247200	247205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010117	ATT	2	6	247315	247320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010117	TAT	2	6	247375	247380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010117	AGT	2	6	247447	247452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010117	ATC	2	6	247513	247518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_010117	TTTTG	2	10	247540	247549	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010117	T	6	6	247553	247558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010117	CT	3	6	247571	247576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_010117	A	6	6	247620	247625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010117	AAT	2	6	247654	247659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010117	T	6	6	247665	247670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_010117	TCT	2	6	247688	247693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_010117	TAA	2	6	247701	247706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_010117	A	7	7	247711	247717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010117	AAC	2	6	247728	247733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_010117	GAT	2	6	247811	247816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_010117	ATTTA	2	10	247860	247869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_010117	TGT	2	6	247942	247947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_010117	ACC	2	6	247986	247991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1149	NC_010117	A	6	6	248369	248374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1151	NC_010117	TTG	2	6	248504	248509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_010117	ATA	2	6	264071	264076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_010117	ATA	2	6	264083	264088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_010117	TGA	2	6	264123	264128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1269	NC_010117	T	6	6	264201	264206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_010117	CAC	2	6	264209	264214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1272	NC_010117	ACG	2	6	264266	264271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1411	NC_010117	TTG	2	6	273844	273849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_010117	AAT	2	6	273884	273889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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