MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 9824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_010117	CGT	2	6	1922782	1922787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9502	NC_010117	C	6	6	1922914	1922919	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9503	NC_010117	AAT	2	6	1922949	1922954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9504	NC_010117	G	6	6	1922972	1922977	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_010117	ACG	2	6	1922978	1922983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9506	NC_010117	CAC	2	6	1923005	1923010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9507	NC_010117	GGGT	2	8	1923011	1923018	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9508	NC_010117	AG	3	6	1923067	1923072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9509	NC_010117	T	6	6	1923153	1923158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9510	NC_010117	TCA	2	6	1927989	1927994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9511	NC_010117	AGC	2	6	1928044	1928049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9512	NC_010117	CGA	2	6	1928059	1928064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9513	NC_010117	TTTA	2	8	1928106	1928113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9514	NC_010117	CTG	2	6	1928121	1928126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9515	NC_010117	A	8	8	1928190	1928197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9516	NC_010117	TA	3	6	1928216	1928221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_010117	A	6	6	1928225	1928230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9518	NC_010117	TAA	2	6	1928243	1928248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9519	NC_010117	TAA	2	6	1928255	1928260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9520	NC_010117	TTAAT	2	10	1928275	1928284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9521	NC_010117	TAGT	2	8	1928292	1928299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9522	NC_010117	GCGAA	2	10	1928323	1928332	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9523	NC_010117	TTG	2	6	1928344	1928349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9524	NC_010117	ACA	2	6	1931056	1931061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9525	NC_010117	TGG	2	6	1931070	1931075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9526	NC_010117	TAG	2	6	1931082	1931087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9527	NC_010117	CAG	2	6	1931126	1931131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9528	NC_010117	TGT	2	6	1931134	1931139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9529	NC_010117	GGA	2	6	1931168	1931173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9530	NC_010117	TAT	2	6	1931293	1931298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9531	NC_010117	ATC	2	6	1931320	1931325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9532	NC_010117	AATTC	2	10	1932755	1932764	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9533	NC_010117	A	6	6	1932826	1932831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9534	NC_010117	TAT	2	6	1932835	1932840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9535	NC_010117	T	8	8	1932842	1932849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9536	NC_010117	A	7	7	1932858	1932864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_010117	GTT	2	6	1932888	1932893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9538	NC_010117	ATT	2	6	1932937	1932942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9539	NC_010117	TTG	2	6	1932958	1932963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9540	NC_010117	CGA	2	6	1932974	1932979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9541	NC_010117	CAG	2	6	1932996	1933001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9542	NC_010117	GAAA	2	8	1933002	1933009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9543	NC_010117	AATCG	2	10	1937231	1937240	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9544	NC_010117	CGC	2	6	1937291	1937296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9545	NC_010117	TC	3	6	1937307	1937312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9546	NC_010117	ATT	2	6	1937363	1937368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9547	NC_010117	TCT	2	6	1937411	1937416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9548	NC_010117	TGT	2	6	1937441	1937446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9549	NC_010117	GA	3	6	1940020	1940025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9550	NC_010117	A	7	7	1940025	1940031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9551	NC_010117	CGCTT	2	10	1940042	1940051	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9552	NC_010117	A	6	6	1940067	1940072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9553	NC_010117	A	8	8	1941697	1941704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9554	NC_010117	T	7	7	1941720	1941726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9555	NC_010117	GTT	2	6	1941806	1941811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9556	NC_010117	CTG	2	6	1941869	1941874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9557	NC_010117	ATT	2	6	1941879	1941884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9558	NC_010117	AT	3	6	1941900	1941905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9559	NC_010117	AAAAC	2	10	1941948	1941957	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9560	NC_010117	T	6	6	1942399	1942404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9561	NC_010117	A	6	6	1942405	1942410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_010117	GAA	2	6	1942450	1942455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9564	NC_010117	CTATC	2	10	1945770	1945779	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9565	NC_010117	CACC	2	8	1945782	1945789	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9566	NC_010117	GTG	2	6	1945791	1945796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9567	NC_010117	CGT	2	6	1945818	1945823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9568	NC_010117	CCT	2	6	1945824	1945829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9569	NC_010117	CTG	2	6	1945840	1945845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9570	NC_010117	GAA	2	6	1945853	1945858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9571	NC_010117	GGA	2	6	1945883	1945888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9572	NC_010117	TTG	2	6	1947616	1947621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9576	NC_010117	A	6	6	1947820	1947825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9581	NC_010117	GA	3	6	1947971	1947976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9582	NC_010117	TTA	2	6	1948091	1948096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9584	NC_010117	TAA	2	6	1948146	1948151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9593	NC_010117	ATCA	2	8	1948570	1948577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9594	NC_010117	GCTT	2	8	1948649	1948656	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9595	NC_010117	ATCA	2	8	1948657	1948664	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9596	NC_010117	GAT	2	6	1948726	1948731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9601	NC_010117	CTT	2	6	1948859	1948864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9602	NC_010117	T	6	6	1948883	1948888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9603	NC_010117	T	8	8	1948917	1948924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9604	NC_010117	TC	3	6	1948929	1948934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9605	NC_010117	C	6	6	1948966	1948971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9606	NC_010117	TA	3	6	1948981	1948986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9611	NC_010117	ATA	2	6	1950652	1950657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9612	NC_010117	GC	3	6	1953298	1953303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9613	NC_010117	GC	3	6	1953307	1953312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9614	NC_010117	TTC	2	6	1953318	1953323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9615	NC_010117	GAT	2	6	1953334	1953339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9621	NC_010117	GC	3	6	1957846	1957851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9622	NC_010117	GC	3	6	1957857	1957862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9623	NC_010117	GTG	2	6	1957955	1957960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9629	NC_010117	ACT	2	6	1958196	1958201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.