MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 9824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_010117	CTAA	2	8	1802234	1802241	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9002	NC_010117	CACT	2	8	1804894	1804901	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9003	NC_010117	CTAA	2	8	1804905	1804912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9004	NC_010117	GTC	2	6	1804937	1804942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_010117	TGG	2	6	1808034	1808039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_010117	GCTA	2	8	1808053	1808060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9007	NC_010117	GCC	2	6	1808095	1808100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9008	NC_010117	ACCC	2	8	1808137	1808144	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9009	NC_010117	A	7	7	1808190	1808196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_010117	AGCGA	2	10	1809506	1809515	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9011	NC_010117	CCA	2	6	1810765	1810770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9012	NC_010117	CCTGTA	2	12	1813244	1813255	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_010117	AACT	2	8	1813262	1813269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9014	NC_010117	ATA	3	9	1813326	1813334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_010117	ATTG	2	8	1813386	1813393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_010117	CAGAAA	2	12	1813442	1813453	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9017	NC_010117	AGCA	2	8	1813460	1813467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9018	NC_010117	TGA	2	6	1813505	1813510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_010117	AAGGA	2	10	1813511	1813520	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_010117	ACA	2	6	1813526	1813531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_010117	CGGT	2	8	1813544	1813551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9022	NC_010117	TAT	3	9	1814514	1814522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_010117	TAA	2	6	1814549	1814554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_010117	TCAA	2	8	1814593	1814600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9025	NC_010117	TATT	2	8	1814646	1814653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_010117	TAG	2	6	1814751	1814756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_010117	TA	3	6	1814900	1814905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_010117	AGG	2	6	1814924	1814929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_010117	CTG	2	6	1814966	1814971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_010117	A	6	6	1814994	1814999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_010117	T	6	6	1815013	1815018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_010117	AAC	2	6	1815041	1815046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_010117	ATT	3	9	1815055	1815063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_010117	GTT	2	6	1815186	1815191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_010117	TTTA	2	8	1815192	1815199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_010117	GCC	2	6	1815220	1815225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9037	NC_010117	AAT	2	6	1815235	1815240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_010117	T	6	6	1815290	1815295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_010117	GAA	2	6	1815334	1815339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_010117	GAG	2	6	1815355	1815360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_010117	T	7	7	1815393	1815399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_010117	AAC	2	6	1815421	1815426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_010117	CAAC	2	8	1815587	1815594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9044	NC_010117	TTAT	2	8	1815615	1815622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_010117	GAA	2	6	1815639	1815644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_010117	AT	3	6	1815648	1815653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_010117	ATC	2	6	1815737	1815742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_010117	CTT	2	6	1815752	1815757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9049	NC_010117	AAT	2	6	1815780	1815785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_010117	AATTTG	2	12	1815862	1815873	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_010117	CA	3	6	1815879	1815884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9052	NC_010117	ATC	2	6	1815886	1815891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_010117	T	8	8	1815896	1815903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_010117	AATA	2	8	1815922	1815929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_010117	TGA	2	6	1815969	1815974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_010117	TGC	2	6	1816002	1816007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_010117	TTG	2	6	1816016	1816021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_010117	TAT	2	6	1816033	1816038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_010117	ATAA	2	8	1816135	1816142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_010117	CT	3	6	1816146	1816151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9061	NC_010117	ACT	2	6	1816174	1816179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_010117	ATT	2	6	1816196	1816201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_010117	TGA	2	6	1816239	1816244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_010117	A	6	6	1816244	1816249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_010117	ATT	2	6	1816276	1816281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_010117	ATG	2	6	1816295	1816300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_010117	GTTT	2	8	1816367	1816374	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_010117	TAATC	2	10	1816409	1816418	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9069	NC_010117	CCA	2	6	1816447	1816452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9070	NC_010117	ACA	2	6	1816465	1816470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9071	NC_010117	T	6	6	1816471	1816476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_010117	TCTT	2	8	1816494	1816501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9073	NC_010117	GAAGAG	2	12	1816512	1816523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_010117	TCTTT	2	10	1816526	1816535	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9075	NC_010117	CTGA	2	8	1816539	1816546	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9076	NC_010117	TGCCA	2	10	1816594	1816603	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9077	NC_010117	TAA	2	6	1816754	1816759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_010117	ATAA	2	8	1816811	1816818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_010117	AAAATG	2	12	1816846	1816857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_010117	A	6	6	1816867	1816872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_010117	TGA	2	6	1816880	1816885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_010117	TTAAA	2	10	1816892	1816901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_010117	TCCA	2	8	1817042	1817049	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9084	NC_010117	T	6	6	1817088	1817093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_010117	TGC	2	6	1817128	1817133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9086	NC_010117	T	7	7	1817147	1817153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_010117	TAA	2	6	1817187	1817192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_010117	ACTA	2	8	1817261	1817268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9089	NC_010117	ATG	2	6	1817287	1817292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_010117	GAT	2	6	1817298	1817303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9092	NC_010117	CCG	2	6	1817405	1817410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9093	NC_010117	ATA	2	6	1817477	1817482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_010117	CAAC	2	8	1817509	1817516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9095	NC_010117	T	6	6	1817523	1817528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_010117	AGC	2	6	1817561	1817566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_010117	GAA	2	6	1817570	1817575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_010117	ATCCC	2	10	1817707	1817716	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9099	NC_010117	TGG	2	6	1818719	1818724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_010117	AC	3	6	1821469	1821474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9101	NC_010117	CTTC	2	8	1823574	1823581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9102	NC_010117	AG	3	6	1823601	1823606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_010117	CTT	2	6	1823608	1823613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9104	NC_010117	AAT	2	6	1823620	1823625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9106	NC_010117	TCA	2	6	1823665	1823670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9107	NC_010117	TAG	2	6	1823679	1823684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9110	NC_010117	GAA	2	6	1828377	1828382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_010117	TCGCT	2	10	1829237	1829246	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9112	NC_010117	AAT	2	6	1829599	1829604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_010117	AAGC	2	8	1829637	1829644	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9114	NC_010117	TTAA	2	8	1829800	1829807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_010117	T	7	7	1829827	1829833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_010117	GTT	3	9	1829847	1829855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_010117	CAG	2	6	1830149	1830154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_010117	TTTG	2	8	1830172	1830179	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_010117	ATGT	2	8	1830180	1830187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_010117	CTT	2	6	1830200	1830205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9122	NC_010117	AAT	2	6	1830555	1830560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_010117	G	6	6	1830605	1830610	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_010117	T	6	6	1830656	1830661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9127	NC_010117	GGAT	2	8	1830826	1830833	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_010117	CCG	2	6	1830867	1830872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9129	NC_010117	AAT	2	6	1830884	1830889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_010117	CTA	2	6	1830895	1830900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9132	NC_010117	GCG	2	6	1830923	1830928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9261	NC_010117	CAA	2	6	1867617	1867622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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