MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 9824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010117	TTA	2	6	1201303	1201308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_010117	TAT	2	6	1201311	1201316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_010117	A	8	8	1201376	1201383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_010117	GC	3	6	1201396	1201401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_010117	TCG	2	6	1201431	1201436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_010117	T	6	6	1201504	1201509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_010117	CAA	2	6	1201585	1201590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_010117	GCTG	2	8	1201613	1201620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_010117	CGC	2	6	1201630	1201635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_010117	A	6	6	1201673	1201678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_010117	AT	3	6	1201696	1201701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_010117	ACA	2	6	1201770	1201775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_010117	ATC	2	6	1201830	1201835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_010117	CAAAG	2	10	1201837	1201846	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6015	NC_010117	CTT	2	6	1201893	1201898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_010117	GC	3	6	1201923	1201928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_010117	GC	3	6	1201934	1201939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_010117	GC	3	6	1201968	1201973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_010117	AG	3	6	1201989	1201994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_010117	AT	3	6	1202010	1202015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_010117	AGT	2	6	1202017	1202022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_010117	A	6	6	1202025	1202030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_010117	TCC	2	6	1202166	1202171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_010117	TAC	2	6	1202204	1202209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_010117	GAC	2	6	1202230	1202235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_010117	CT	3	6	1202275	1202280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_010117	AAAC	2	8	1202304	1202311	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6028	NC_010117	AAT	2	6	1202324	1202329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_010117	TAA	2	6	1202352	1202357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_010117	CTA	2	6	1202362	1202367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_010117	TAAT	2	8	1202373	1202380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_010117	ACA	2	6	1202413	1202418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_010117	ACC	2	6	1202419	1202424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_010117	ATT	2	6	1202437	1202442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_010117	CAA	2	6	1202459	1202464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_010117	AAC	2	6	1204868	1204873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_010117	T	9	9	1204884	1204892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_010117	CGT	2	6	1204939	1204944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_010117	GCC	2	6	1204968	1204973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_010117	TC	3	6	1207423	1207428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_010117	CAT	2	6	1207455	1207460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_010117	T	6	6	1207491	1207496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_010117	CCTTC	2	10	1207545	1207554	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6044	NC_010117	ATTTCT	2	12	1207584	1207595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6045	NC_010117	CAA	2	6	1207959	1207964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_010117	CTC	2	6	1207980	1207985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_010117	AAT	2	6	1208775	1208780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_010117	TA	3	6	1210882	1210887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_010117	GAG	2	6	1210895	1210900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_010117	GCCTA	2	10	1210904	1210913	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6051	NC_010117	GAT	2	6	1210975	1210980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_010117	A	6	6	1211052	1211057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_010117	GC	3	6	1211072	1211077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_010117	GCC	2	6	1211144	1211149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_010117	ACCC	2	8	1211186	1211193	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6056	NC_010117	A	7	7	1211239	1211245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_010117	AGCGA	2	10	1212555	1212564	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6058	NC_010117	ATG	2	6	1212579	1212584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_010117	TCGCT	2	10	1212605	1212614	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6060	NC_010117	TTG	2	6	1212628	1212633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_010117	TTG	2	6	1212874	1212879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_010117	AGA	2	6	1212885	1212890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_010117	TTGT	2	8	1212900	1212907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_010117	ATA	2	6	1212917	1212922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_010117	ACTA	2	8	1212933	1212940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_010117	A	6	6	1212946	1212951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_010117	CTT	2	6	1214871	1214876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_010117	T	6	6	1214875	1214880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_010117	T	6	6	1216888	1216893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_010117	ACGC	2	8	1219262	1219269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_010117	TGA	2	6	1219293	1219298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_010117	TAT	2	6	1219318	1219323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_010117	GCT	2	6	1220336	1220341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_010117	CTA	2	6	1221796	1221801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_010117	CAT	2	6	1221809	1221814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_010117	TTA	2	6	1221822	1221827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_010117	T	6	6	1222104	1222109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_010117	CTC	2	6	1224428	1224433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_010117	GTT	2	6	1224440	1224445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_010117	CCT	2	6	1224505	1224510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_010117	TC	3	6	1224536	1224541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_010117	GTA	2	6	1224554	1224559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_010117	CTT	2	6	1224610	1224615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_010117	AAT	2	6	1224643	1224648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_010117	A	6	6	1224733	1224738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_010117	GTAGT	2	10	1224817	1224826	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_010117	GTT	2	6	1224839	1224844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_010117	A	6	6	1225323	1225328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_010117	TCC	2	6	1225343	1225348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_010117	GC	3	6	1225360	1225365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_010117	ATC	2	6	1227902	1227907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_010117	TTA	2	6	1228802	1228807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_010117	GAT	2	6	1228821	1228826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_010117	ACGA	2	8	1230512	1230519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6095	NC_010117	CAA	2	6	1230570	1230575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_010117	ATT	2	6	1230585	1230590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_010117	ATG	2	6	1230592	1230597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_010117	GTG	2	6	1230643	1230648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_010117	TCG	2	6	1230656	1230661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_010117	A	6	6	1230680	1230685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_010117	ATT	2	6	1230778	1230783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_010117	A	7	7	1230837	1230843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_010117	GCG	2	6	1230865	1230870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_010117	CAT	2	6	1230881	1230886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_010117	TGC	2	6	1230923	1230928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_010117	GCT	2	6	1230952	1230957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_010117	ATA	2	6	1231033	1231038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_010117	AGCG	2	8	1231070	1231077	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_010117	TGC	2	6	1231150	1231155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_010117	A	7	7	1231168	1231174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_010117	CGG	2	6	1231189	1231194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_010117	ATG	2	6	1231197	1231202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_010117	GCC	2	6	1231292	1231297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_010117	ATT	2	6	1231307	1231312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_010117	ATG	2	6	1231326	1231331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_010117	A	7	7	1231387	1231393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_010117	TAC	2	6	1231520	1231525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_010117	C	6	6	1231525	1231530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6119	NC_010117	CGGG	2	8	1231550	1231557	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_010117	TAA	2	6	1231642	1231647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_010117	A	6	6	1231701	1231706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_010117	ATA	2	6	1231743	1231748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_010117	GGC	2	6	1231816	1231821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_010117	TTCG	2	8	1231830	1231837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6125	NC_010117	GGT	2	6	1231855	1231860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_010117	T	6	6	1231891	1231896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_010117	TATT	2	8	1231952	1231959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_010117	AG	3	6	1231960	1231965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_010117	CA	3	6	1233357	1233362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_010117	A	6	6	1233519	1233524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_010117	AGCGA	2	10	1233538	1233547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6132	NC_010117	A	6	6	1233641	1233646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_010117	AAT	2	6	1233685	1233690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6172	NC_010117	AAATT	2	10	1236505	1236514	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6251	NC_010117	ACT	2	6	1265531	1265536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6261	NC_010117	TGT	2	6	1269747	1269752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6262	NC_010117	A	6	6	1269838	1269843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6263	NC_010117	TTA	2	6	1271094	1271099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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