MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 9824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010117	ATTA	2	8	1130783	1130790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_010117	A	7	7	1130846	1130852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_010117	TTAG	2	8	1131201	1131208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_010117	TTA	2	6	1131252	1131257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_010117	TTA	2	6	1131264	1131269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_010117	T	7	7	1131287	1131293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_010117	T	6	6	1131331	1131336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_010117	GAT	2	6	1131366	1131371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_010117	T	6	6	1131383	1131388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_010117	TAAA	2	8	1131418	1131425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_010117	T	7	7	1131436	1131442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_010117	TCT	2	6	1131446	1131451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_010117	CT	3	6	1131476	1131481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_010117	ATT	2	6	1131491	1131496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_010117	T	6	6	1131516	1131521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_010117	AAT	2	6	1132083	1132088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_010117	CAT	2	6	1132089	1132094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_010117	GAC	2	6	1132104	1132109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_010117	CTT	2	6	1132171	1132176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_010117	TTA	2	6	1132976	1132981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_010117	TAA	2	6	1133002	1133007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_010117	GA	3	6	1133047	1133052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_010117	CACAGC	2	12	1133085	1133096	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_010117	TGAG	2	8	1133707	1133714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_010117	TC	3	6	1135300	1135305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_010117	TTAAT	2	10	1135417	1135426	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_010117	TAA	2	6	1135450	1135455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_010117	C	6	6	1135515	1135520	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5529	NC_010117	AATA	2	8	1135521	1135528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_010117	ACA	2	6	1135538	1135543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_010117	CCG	2	6	1135556	1135561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_010117	GTA	2	6	1135628	1135633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_010117	T	6	6	1135707	1135712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_010117	ATT	2	6	1135732	1135737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_010117	AAG	2	6	1135758	1135763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_010117	GAT	2	6	1135797	1135802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_010117	AAG	2	6	1135804	1135809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_010117	CTT	3	9	1135836	1135844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_010117	TAAT	3	12	1135913	1135924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_010117	AAAGA	2	10	1135975	1135984	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_010117	ACCAA	2	10	1136001	1136010	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5542	NC_010117	ACT	2	6	1136020	1136025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_010117	T	7	7	1136083	1136089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_010117	TTAA	2	8	1136148	1136155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_010117	T	7	7	1136198	1136204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_010117	ATA	2	6	1136228	1136233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_010117	ATT	2	6	1136261	1136266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_010117	AATAG	2	10	1136270	1136279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_010117	TTA	2	6	1136337	1136342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_010117	AAG	2	6	1136503	1136508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_010117	TAATA	2	10	1136547	1136556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_010117	GTG	2	6	1136942	1136947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_010117	T	8	8	1137033	1137040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_010117	T	7	7	1138428	1138434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_010117	GGGT	2	8	1138480	1138487	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_010117	GCT	2	6	1138563	1138568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_010117	C	6	6	1138612	1138617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5558	NC_010117	AAGA	2	8	1138633	1138640	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_010117	CGC	2	6	1138657	1138662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_010117	GCC	2	6	1138724	1138729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_010117	TAA	2	6	1138771	1138776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_010117	TAA	2	6	1138779	1138784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_010117	A	6	6	1138821	1138826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_010117	ATT	2	6	1138862	1138867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_010117	T	7	7	1138866	1138872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_010117	ACC	2	6	1138883	1138888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_010117	TA	3	6	1138909	1138914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_010117	CAGT	2	8	1139008	1139015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5569	NC_010117	CTC	2	6	1139027	1139032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_010117	GGA	2	6	1139040	1139045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_010117	T	7	7	1139113	1139119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_010117	T	6	6	1139160	1139165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_010117	A	6	6	1139225	1139230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_010117	CAA	2	6	1139244	1139249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_010117	CGA	2	6	1139295	1139300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_010117	ATC	3	9	1139308	1139316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_010117	TAA	4	12	1139353	1139364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_010117	TTC	2	6	1139386	1139391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_010117	GAA	2	6	1139436	1139441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_010117	AAG	2	6	1139474	1139479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_010117	TAG	2	6	1139514	1139519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_010117	AAT	2	6	1139575	1139580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_010117	ATC	2	6	1139584	1139589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_010117	CCT	2	6	1139590	1139595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5585	NC_010117	AT	3	6	1139637	1139642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_010117	AGA	2	6	1139647	1139652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_010117	T	6	6	1139679	1139684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_010117	CTT	2	6	1139688	1139693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_010117	GTG	2	6	1139713	1139718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_010117	CCT	2	6	1139736	1139741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_010117	TAA	2	6	1139759	1139764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5593	NC_010117	A	6	6	1139794	1139799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_010117	GGCTT	2	10	1139803	1139812	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5595	NC_010117	T	6	6	1139815	1139820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_010117	CTGCC	2	10	1139847	1139856	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5597	NC_010117	CAA	2	6	1139871	1139876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_010117	TAA	3	9	1139889	1139897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_010117	AG	3	6	1139899	1139904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_010117	AAC	2	6	1143757	1143762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_010117	CG	3	6	1143779	1143784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_010117	TCT	2	6	1143796	1143801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_010117	ATT	2	6	1145655	1145660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_010117	ACA	2	6	1146424	1146429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_010117	GCC	2	6	1146461	1146466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_010117	GAAGC	2	10	1146497	1146506	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5607	NC_010117	AAT	2	6	1146519	1146524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_010117	TTTCG	2	10	1146537	1146546	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5609	NC_010117	CA	3	6	1146903	1146908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_010117	ATTC	2	8	1146915	1146922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_010117	T	6	6	1146973	1146978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_010117	CAA	2	6	1147053	1147058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_010117	CCT	2	6	1147061	1147066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_010117	TGT	2	6	1147081	1147086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_010117	TGA	2	6	1147135	1147140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5617	NC_010117	TCC	2	6	1147246	1147251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5618	NC_010117	CAA	2	6	1147281	1147286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_010117	ACAA	2	8	1147295	1147302	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_010117	TCGC	2	8	1147342	1147349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5622	NC_010117	CAA	2	6	1147416	1147421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_010117	TTG	2	6	1147497	1147502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_010117	TGC	2	6	1147612	1147617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_010117	CTC	2	6	1147676	1147681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_010117	CAC	2	6	1147695	1147700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_010117	ATAC	2	8	1147730	1147737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5628	NC_010117	ATC	2	6	1147763	1147768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_010117	CA	3	6	1147774	1147779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_010117	T	7	7	1147843	1147849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_010117	GGGT	2	8	1147895	1147902	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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