MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 1149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010001	GAAAG	2	10	11413	11422	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010001	CTATA	2	10	15085	15094	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010001	AAATT	2	10	15129	15138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010001	TCGTG	2	10	16804	16813	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010001	TAAAA	2	10	17566	17575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010001	AATAC	2	10	17743	17752	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010001	GGGAG	2	10	18428	18437	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010001	CCGTA	2	10	19552	19561	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_010001	CGGGA	2	10	20655	20664	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010001	AAGAT	2	10	20701	20710	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010001	TCCAA	2	10	21489	21498	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010001	TAAAA	2	10	21998	22007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010001	GAAAT	2	10	22190	22199	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010001	AATTT	2	10	22215	22224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010001	GATAA	2	10	24145	24154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010001	TAAGT	2	10	26321	26330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010001	TAAAT	2	10	28890	28899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010001	ATTAT	2	10	36867	36876	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010001	ATTAT	2	10	36890	36899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010001	AGAAT	2	10	37744	37753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010001	TACAG	2	10	39617	39626	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010001	TTATT	2	10	39689	39698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010001	AATTT	2	10	39795	39804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010001	ATGAA	2	10	39856	39865	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010001	TTATA	2	10	42991	43000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010001	AATTT	2	10	43123	43132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010001	TAAAA	2	10	45777	45786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010001	AAAAC	2	10	47386	47395	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010001	TTTTG	2	10	65846	65855	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010001	TTTTA	2	10	66139	66148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010001	TTGGC	2	10	70380	70389	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010001	TTATA	2	10	73944	73953	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010001	GGTTC	2	10	75561	75570	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010001	TCGTG	2	10	77070	77079	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010001	GGGAG	2	10	78831	78840	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010001	CCGTA	2	10	79955	79964	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_010001	CGGGA	2	10	81058	81067	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010001	AAGAT	2	10	81104	81113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010001	ATAGT	2	10	83457	83466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010001	AATAA	2	10	98208	98217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010001	GATAA	2	10	99085	99094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010001	GATAA	2	10	108623	108632	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010001	TTAAA	2	10	112538	112547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010001	ATAAA	2	10	113983	113992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010001	ATTTA	2	10	119723	119732	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010001	ATTAT	2	10	119890	119899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010001	TTTTA	2	10	125754	125763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010001	GTTTT	2	10	128423	128432	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010001	TACTC	2	10	128613	128622	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010001	ATAAA	2	10	136335	136344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010001	AAAAT	2	10	136432	136441	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010001	ATTGT	2	10	146269	146278	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010001	TAAAA	2	10	166285	166294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010001	TATCC	2	10	168670	168679	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_010001	TTTAG	2	10	169045	169054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010001	AAAAT	2	10	170716	170725	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010001	AAAAC	2	10	179616	179625	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010001	TCATA	2	10	186225	186234	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010001	ATTTT	2	10	190962	190971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010001	TGATT	2	10	197372	197381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010001	TAGAA	2	10	204893	204902	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010001	GATTT	2	10	211811	211820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010001	TAAGG	2	10	211933	211942	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010001	TAATC	2	10	226356	226365	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010001	ATTAT	2	10	228739	228748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010001	TACTT	2	10	228890	228899	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010001	CTTAT	2	10	228981	228990	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010001	GAAAT	2	10	230684	230693	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010001	TAGAA	2	10	235129	235138	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010001	TGCTT	2	10	253576	253585	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_010001	TATTT	2	10	259707	259716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010001	CACTA	2	10	276277	276286	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_010001	CTTAT	2	10	280053	280062	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010001	AAAAG	2	10	283652	283661	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010001	AAGCG	2	10	288672	288681	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010001	GCCAT	2	10	292605	292614	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_010001	TATAA	2	10	300726	300735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010001	AGAAT	2	10	301813	301822	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010001	GATAA	2	10	302735	302744	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010001	ATTTT	2	10	313550	313559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010001	AAATA	2	10	313902	313911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010001	AAAAG	2	10	315073	315082	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010001	TTAAA	2	10	327337	327346	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010001	AATTA	2	10	332144	332153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010001	ATTGA	2	10	340624	340633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010001	GATAA	2	10	344224	344233	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010001	ATAGA	2	10	345781	345790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010001	TAAAT	2	10	351496	351505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010001	AGTTT	2	10	354199	354208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010001	GGATA	2	10	358060	358069	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010001	AACAA	2	10	362668	362677	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010001	AAAAT	2	10	377434	377443	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010001	ATAAA	2	10	380849	380858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010001	TGTTT	2	10	399130	399139	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010001	AATAA	2	10	403925	403934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010001	AATAA	2	10	406865	406874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010001	CTTGT	2	10	422229	422238	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010001	ATAAA	2	10	425573	425582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010001	ATAGT	2	10	432213	432222	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010001	TTTAA	2	10	432271	432280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010001	TATGG	2	10	437734	437743	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010001	AGCTT	2	10	443382	443391	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_010001	GAAAA	2	10	445707	445716	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010001	TCGTG	2	10	447293	447302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010001	TAAAT	2	10	447824	447833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010001	GGGAG	2	10	448837	448846	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010001	CCGTA	2	10	449961	449970	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_010001	CGGGA	2	10	451064	451073	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010001	AAGAT	2	10	451110	451119	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010001	AATTA	2	10	451424	451433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010001	TGTGG	2	10	452402	452411	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010001	TGTCT	2	10	452556	452565	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010001	ATATA	2	10	452903	452912	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010001	AAAAC	2	10	461471	461480	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010001	TAGAA	2	10	470309	470318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010001	ATAAC	2	10	476353	476362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010001	ATATA	2	10	478716	478725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010001	GAAAG	2	10	480253	480262	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010001	TTTAA	2	10	494387	494396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010001	ATATT	2	10	494508	494517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010001	TGAAA	2	10	507912	507921	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010001	ACATA	2	10	513553	513562	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010001	CTTTT	2	10	520416	520425	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010001	TACTT	2	10	533818	533827	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010001	ATTAT	2	10	533953	533962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010001	TTTAC	2	10	534040	534049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010001	AATAA	2	10	537764	537773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010001	AATAA	2	10	542480	542489	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010001	AAACA	2	10	544431	544440	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010001	TATCT	2	10	546117	546126	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010001	TGCAT	2	10	546214	546223	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010001	GCAAG	2	10	549777	549786	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010001	AAATT	2	10	549903	549912	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010001	TATTT	2	10	558523	558532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010001	AGAAA	2	10	570151	570160	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010001	ATATT	2	10	576686	576695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010001	TTAGG	2	10	580434	580443	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010001	TAATA	2	10	581472	581481	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010001	ATATG	2	10	592336	592345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010001	AGGGG	2	10	592347	592356	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010001	TTTTC	2	10	593778	593787	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010001	AAAGT	2	10	595848	595857	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010001	TATAC	2	10	617201	617210	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010001	AGGTT	2	10	623036	623045	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010001	TGATT	2	10	627784	627793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010001	ATGAT	2	10	630208	630217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010001	GTTTT	2	10	635514	635523	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010001	TTAAA	2	10	642446	642455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010001	TAAAT	2	10	648063	648072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010001	TTATA	2	10	650429	650438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_010001	TAAAA	2	10	725662	725671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010001	TAAAT	2	10	725957	725966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010001	ATAAA	2	10	728375	728384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010001	CATAT	2	10	731483	731492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_010001	TTTAC	2	10	732696	732705	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_010001	TAAAA	2	10	823313	823322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_010001	AAAAT	2	10	829903	829912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_010001	TAAAA	2	10	835764	835773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_010001	ATAAA	2	10	846683	846692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_010001	TTAAT	2	10	1262491	1262500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_010001	TAAAT	2	10	1878298	1878307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_010001	GGCTG	2	10	1879808	1879817	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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449	NC_010001	TATAA	2	10	1990101	1990110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_010001	TAAAT	2	10	2004195	2004204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_010001	GTTAG	2	10	2035127	2035136	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
466	NC_010001	AATTA	2	10	2035416	2035425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_010001	AGTGA	2	10	2038315	2038324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_010001	ATGAC	2	10	2077048	2077057	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
477	NC_010001	AGAAA	2	10	2083518	2083527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_010001	AACTC	2	10	2091608	2091617	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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482	NC_010001	CTAAA	2	10	2157998	2158007	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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485	NC_010001	TGTAT	2	10	2163642	2163651	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_010001	ATCTA	2	10	2197877	2197886	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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495	NC_010001	TTCCT	2	10	2213636	2213645	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
496	NC_010001	AATAC	2	10	2214342	2214351	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
497	NC_010001	AATAA	2	10	2221641	2221650	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_010001	TGGAG	2	10	2221732	2221741	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
499	NC_010001	CTCCA	2	10	2221762	2221771	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
500	NC_010001	TATAT	2	10	2225624	2225633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

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