MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 3204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010001	TCTT	2	8	1439	1446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010001	TTCT	2	8	1718	1725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010001	ATTA	2	8	1802	1809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010001	TATG	2	8	3367	3374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010001	AAAT	2	8	3548	3555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010001	ATTT	2	8	3632	3639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010001	TGTT	2	8	3656	3663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010001	CAGA	2	8	11962	11969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010001	ACAT	2	8	12104	12111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010001	AACT	2	8	14762	14769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010001	AGTT	2	8	14799	14806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010001	AGTT	2	8	14814	14821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010001	TAAA	2	8	15312	15319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010001	GTGA	2	8	16163	16170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010001	CTTC	2	8	16758	16765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010001	AAGC	2	8	16990	16997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010001	ATTA	2	8	17366	17373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010001	AAAC	2	8	17828	17835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010001	AGAA	2	8	18128	18135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010001	AGCC	2	8	18251	18258	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010001	TCAG	2	8	18613	18620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010001	GTTT	2	8	20830	20837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010001	TCAA	2	8	20893	20900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010001	ATGG	2	8	21269	21276	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010001	TCCA	2	8	21345	21352	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010001	AACA	2	8	21803	21810	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010001	GAAA	2	8	21914	21921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010001	AAAT	2	8	23122	23129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010001	TTGA	2	8	26505	26512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010001	TAAA	2	8	28798	28805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010001	AAAG	2	8	32787	32794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010001	CATT	2	8	32922	32929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010001	AATT	2	8	32978	32985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010001	CTTT	2	8	33041	33048	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010001	ATTA	2	8	33406	33413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010001	TAAA	2	8	34761	34768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010001	ATTT	2	8	35870	35877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010001	ACTT	2	8	35973	35980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010001	TTTC	2	8	37833	37840	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010001	AATA	2	8	38067	38074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010001	AAGG	2	8	39460	39467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010001	AGAA	2	8	39912	39919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010001	ACTA	2	8	40514	40521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010001	TATT	2	8	43043	43050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010001	AGAT	2	8	43664	43671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010001	ATCT	2	8	43799	43806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010001	GTTG	2	8	44176	44183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010001	ATCT	2	8	45972	45979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010001	ATCT	2	8	46106	46113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010001	GAAT	2	8	56240	56247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010001	AAAT	2	8	58120	58127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010001	AGGA	2	8	63776	63783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010001	ATGA	2	8	65817	65824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010001	ATTA	2	8	65905	65912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010001	TTAA	2	8	65917	65924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010001	TTAA	2	8	65928	65935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010001	AATA	2	8	66020	66027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010001	TAGA	2	8	66170	66177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010001	AAGA	2	8	70514	70521	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010001	GAAT	2	8	73609	73616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010001	AAAT	2	8	73880	73887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010001	AGAT	2	8	75390	75397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010001	CTAA	2	8	75434	75441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010001	TAAA	2	8	75464	75471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010001	AACA	2	8	75714	75721	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010001	GTGA	2	8	76428	76435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010001	CTTC	2	8	77024	77031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010001	AAGC	2	8	77256	77263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010001	ATTA	2	8	77631	77638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010001	AAAC	2	8	78231	78238	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010001	AGAA	2	8	78531	78538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010001	AGCC	2	8	78654	78661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010001	TCAG	2	8	79016	79023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010001	GTTT	2	8	81233	81240	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010001	TTAA	2	8	81387	81394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010001	CAAA	2	8	81648	81655	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010001	TAAA	2	8	81910	81917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010001	TTTG	2	8	82875	82882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010001	TTTG	2	8	83054	83061	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010001	TAAT	2	8	83114	83121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010001	ATCA	2	8	83259	83266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010001	GATA	2	8	83441	83448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010001	GTAT	2	8	87231	87238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010001	GTTT	2	8	87399	87406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010001	CTTT	2	8	88636	88643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010001	CATT	2	8	88790	88797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010001	TAAT	2	8	90749	90756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010001	TTAG	2	8	91784	91791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010001	GCAC	2	8	91869	91876	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010001	TAAA	2	8	92156	92163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010001	TATT	2	8	96205	96212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010001	TAGG	2	8	96483	96490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010001	TTTA	2	8	105111	105118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010001	TTTC	2	8	110690	110697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010001	AACT	2	8	112480	112487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010001	ACAA	2	8	112744	112751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010001	TAAT	2	8	112787	112794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010001	AAAT	2	8	112819	112826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010001	AGGA	2	8	112878	112885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010001	TTTC	2	8	113939	113946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010001	AGGA	2	8	113996	114003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010001	CTTA	2	8	115111	115118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010001	CTCC	2	8	115134	115141	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_010001	TTAA	2	8	119768	119775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010001	TCAT	2	8	125711	125718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010001	ATGT	2	8	127762	127769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010001	TGTT	2	8	128605	128612	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010001	AAAG	2	8	128761	128768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010001	TTAG	2	8	131172	131179	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010001	TATT	2	8	131391	131398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010001	AGGT	2	8	135011	135018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010001	AGTA	2	8	145325	145332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010001	TAGA	2	8	145578	145585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010001	ATTA	2	8	145935	145942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010001	GGTG	2	8	145955	145962	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010001	TATG	2	8	147122	147129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010001	GTAG	2	8	147166	147173	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010001	AGGA	2	8	147339	147346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010001	ATCG	2	8	148471	148478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010001	TAGA	2	8	148763	148770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010001	GAAT	2	8	153017	153024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010001	GTAG	2	8	156272	156279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010001	ATTG	2	8	156311	156318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010001	AAGC	2	8	156341	156348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010001	TATT	2	8	157720	157727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010001	TTCT	2	8	157900	157907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010001	AAAG	2	8	160709	160716	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010001	GCAA	2	8	160731	160738	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010001	TCTT	2	8	160754	160761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010001	TACG	2	8	163526	163533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010001	TTAA	2	8	163582	163589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010001	TCAG	2	8	163680	163687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010001	TTGT	2	8	165302	165309	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010001	TAAA	2	8	166208	166215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010001	ACAT	2	8	166233	166240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010001	ATTA	2	8	166274	166281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010001	AATG	2	8	168611	168618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010001	GAAT	2	8	168654	168661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010001	TAAA	2	8	168926	168933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010001	TAAA	2	8	169023	169030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010001	ACAA	2	8	170086	170093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010001	ACAT	2	8	172826	172833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010001	AAAT	2	8	173904	173911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010001	GTTA	2	8	174063	174070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010001	AAGG	2	8	174217	174224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010001	GTAA	2	8	174249	174256	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010001	TAGA	2	8	177256	177263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010001	AAAT	2	8	177301	177308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010001	GCAA	2	8	177788	177795	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010001	AATG	2	8	178194	178201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010001	TTAA	2	8	186137	186144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010001	AGTC	2	8	186236	186243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_010001	AATC	2	8	187246	187253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_010001	ATGG	2	8	187266	187273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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