MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 11674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010001	TGC	2	6	1	6	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010001	ATT	2	6	1508	1513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010001	ATG	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010001	TAA	2	6	1655	1660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010001	TAA	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010001	CTA	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010001	TAA	2	6	1792	1797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010001	TAA	2	6	2982	2987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010001	ATG	2	6	3055	3060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010001	ATC	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010001	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010001	AAT	2	6	3615	3620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010001	AGG	2	6	4974	4979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010001	GGA	2	6	6920	6925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010001	ATT	2	6	9742	9747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010001	AAG	2	6	9822	9827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010001	GTT	2	6	9870	9875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010001	GTT	2	6	10767	10772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010001	ATA	2	6	11360	11365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010001	ATT	2	6	11400	11405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010001	AGT	2	6	12038	12043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010001	ATT	2	6	12046	12051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010001	TAT	2	6	12071	12076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010001	ATA	2	6	12212	12217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010001	ATT	3	9	12262	12270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010001	ATA	2	6	12314	12319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010001	TAT	2	6	12335	12340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010001	AAT	2	6	13649	13654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010001	TTA	2	6	14623	14628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010001	AGA	2	6	14890	14895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010001	AAG	2	6	15003	15008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010001	AGT	2	6	15058	15063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010001	GAG	2	6	15144	15149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010001	GTC	2	6	15381	15386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010001	ACA	2	6	15396	15401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010001	AAC	2	6	15524	15529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010001	GGC	2	6	15784	15789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010001	TGG	2	6	16012	16017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010001	CGA	2	6	16036	16041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010001	GCA	2	6	16110	16115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010001	CGC	2	6	16157	16162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010001	CAG	2	6	16199	16204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010001	AAG	2	6	16229	16234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010001	CAG	2	6	16253	16258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010001	GGT	2	6	16318	16323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010001	AGG	2	6	16443	16448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010001	GGC	2	6	16464	16469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010001	GAA	2	6	16707	16712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010001	GGT	2	6	16781	16786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010001	GTC	2	6	16795	16800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010001	TAG	2	6	16856	16861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010001	CAG	2	6	16863	16868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010001	GGA	2	6	16908	16913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010001	ATC	2	6	16932	16937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010001	AGG	2	6	17187	17192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010001	CCT	2	6	17269	17274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010001	TAA	2	6	17340	17345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010001	TGG	2	6	17450	17455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010001	AAC	2	6	17585	17590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010001	ATA	2	6	17591	17596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010001	ATA	2	6	17606	17611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010001	TAA	2	6	17641	17646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010001	AGT	2	6	17842	17847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010001	CAC	2	6	17848	17853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010001	TGA	2	6	17860	17865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010001	TAA	2	6	17918	17923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010001	TGG	2	6	17931	17936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010001	GAG	2	6	17992	17997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010001	GGA	2	6	18120	18125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010001	GCG	2	6	18154	18159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010001	AGA	2	6	18232	18237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010001	TTG	2	6	18335	18340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010001	ACC	2	6	18353	18358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010001	TAC	2	6	18372	18377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010001	GGT	2	6	18679	18684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010001	GGA	2	6	18685	18690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010001	GTG	2	6	18715	18720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010001	GAT	3	9	18886	18894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010001	ACC	2	6	18948	18953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010001	AGC	2	6	19028	19033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010001	GAA	2	6	19165	19170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010001	AAG	2	6	19199	19204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010001	TCT	2	6	19243	19248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010001	ACA	2	6	19337	19342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010001	GAG	2	6	19579	19584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010001	CGG	2	6	19828	19833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010001	TGC	2	6	20028	20033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010001	AAG	2	6	20057	20062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010001	ACC	2	6	20099	20104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_010001	GTA	2	6	20108	20113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010001	GGT	2	6	20322	20327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010001	GTA	2	6	20455	20460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010001	CGT	2	6	20517	20522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010001	GAG	2	6	20566	20571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010001	GTT	2	6	20620	20625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010001	GCC	2	6	20981	20986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010001	CGG	2	6	20993	20998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010001	GGT	2	6	21170	21175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010001	AGC	2	6	21211	21216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010001	CAG	2	6	21228	21233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010001	TCG	2	6	21253	21258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010001	ATA	2	6	21407	21412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010001	TCG	2	6	21438	21443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010001	TAA	2	6	21727	21732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010001	AAT	2	6	21746	21751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010001	ATT	2	6	21762	21767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010001	ATA	2	6	21792	21797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010001	CTT	2	6	21947	21952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010001	ATA	2	6	21963	21968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010001	AGT	2	6	21978	21983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010001	AGT	2	6	22023	22028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010001	CAT	2	6	22032	22037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010001	TTA	2	6	22097	22102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010001	TCT	2	6	22168	22173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010001	GAT	2	6	22328	22333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010001	TTA	2	6	23181	23186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010001	ATA	2	6	23249	23254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010001	AAT	2	6	23264	23269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010001	AGG	2	6	23315	23320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010001	ATT	2	6	24058	24063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010001	AGG	2	6	24173	24178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010001	TAA	2	6	26176	26181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010001	TAA	2	6	26338	26343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010001	TTA	2	6	26495	26500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010001	AGG	2	6	26518	26523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010001	AAT	2	6	28764	28769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010001	ATC	2	6	28843	28848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010001	ATG	2	6	28944	28949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010001	ATC	2	6	29015	29020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010001	CCT	2	6	29047	29052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_010001	CAG	2	6	30957	30962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010001	ATA	3	9	32937	32945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010001	ATT	2	6	33006	33011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010001	ATT	2	6	33049	33054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010001	ATT	2	6	33179	33184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010001	ATT	2	6	33285	33290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010001	TAA	2	6	33299	33304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010001	TAA	2	6	33363	33368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010001	TAC	2	6	34822	34827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010001	ATT	2	6	35982	35987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010001	ATT	2	6	36849	36854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_010001	TAA	2	6	136424	136429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_010001	TCC	2	6	141035	141040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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434	NC_010001	TTA	2	6	145545	145550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_010001	TAT	2	6	146368	146373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_010001	TAA	2	6	148542	148547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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