MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 22296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010001	TGATT	2	10	627784	627793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010001	GCT	2	6	627796	627801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_010001	AAAT	2	8	627830	627837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_010001	AGG	2	6	627923	627928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010001	TTTA	2	8	630147	630154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010001	A	6	6	630161	630166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010001	A	6	6	630171	630176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_010001	ATTT	2	8	630200	630207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010001	ATGAT	2	10	630208	630217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010001	T	6	6	630255	630260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_010001	TTTC	2	8	630270	630277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_010001	T	7	7	631800	631806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_010001	TAG	2	6	631842	631847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_010001	AAAT	2	8	633716	633723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010001	GTA	2	6	633792	633797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_010001	T	6	6	635480	635485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_010001	GTTTT	2	10	635514	635523	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_010001	GAT	2	6	635533	635538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010001	TGA	2	6	635555	635560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010001	CCT	2	6	638298	638303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_010001	AG	3	6	638310	638315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_010001	TAC	2	6	638326	638331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_010001	AAC	2	6	638374	638379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_010001	GCT	2	6	638407	638412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_010001	TTAG	2	8	638445	638452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010001	A	7	7	638501	638507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_010001	TAAC	2	8	638565	638572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_010001	CCT	2	6	641351	641356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_010001	GCT	2	6	641364	641369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_010001	A	7	7	641370	641376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_010001	TAA	2	6	641401	641406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_010001	TAT	2	6	641463	641468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010001	TTA	2	6	642246	642251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_010001	ACAA	2	8	642298	642305	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_010001	AAT	2	6	642314	642319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_010001	CAT	2	6	642320	642325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_010001	TTA	2	6	642427	642432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_010001	TAT	2	6	642440	642445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_010001	TTAAA	2	10	642446	642455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_010001	AAG	2	6	642458	642463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_010001	GAAA	2	8	643308	643315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_010001	CA	3	6	643358	643363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_010001	ACT	2	6	643365	643370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_010001	GAAA	2	8	643393	643400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_010001	ATA	3	9	644790	644798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010001	TAG	2	6	644810	644815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010001	GAA	2	6	644836	644841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_010001	AAT	2	6	645293	645298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_010001	T	6	6	645335	645340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_010001	TG	3	6	645380	645385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_010001	CTTA	2	8	645393	645400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3052	NC_010001	CTC	2	6	645415	645420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_010001	TTC	2	6	645427	645432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_010001	TTA	2	6	645458	645463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_010001	T	6	6	645491	645496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_010001	TTAA	2	8	645568	645575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_010001	TAC	2	6	645583	645588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_010001	GGA	2	6	645675	645680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_010001	CTT	2	6	645694	645699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_010001	TTG	2	6	645705	645710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_010001	AC	3	6	645857	645862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_010001	AC	4	8	645876	645883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_010001	TAA	2	6	646406	646411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010001	T	8	8	646451	646458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_010001	ATTA	2	8	646459	646466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_010001	TGA	2	6	646499	646504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_010001	T	7	7	647589	647595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_010001	ATA	2	6	647606	647611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_010001	AAT	2	6	647650	647655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_010001	TAA	3	9	647666	647674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_010001	AGAA	2	8	647701	647708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010001	AAGA	2	8	647709	647716	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_010001	AT	3	6	647731	647736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_010001	CCT	2	6	647741	647746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_010001	AT	3	6	647748	647753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_010001	TTG	2	6	647802	647807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_010001	CTT	2	6	647819	647824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_010001	ATT	2	6	647872	647877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_010001	TAA	2	6	647920	647925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_010001	ATG	2	6	647955	647960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_010001	TTA	2	6	648051	648056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_010001	TAAAT	2	10	648063	648072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_010001	GAA	2	6	648102	648107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_010001	A	6	6	648168	648173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_010001	GATAAT	2	12	648180	648191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_010001	TAAACT	2	12	648199	648210	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3087	NC_010001	A	6	6	648263	648268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_010001	GAT	2	6	648656	648661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_010001	AT	3	6	648678	648683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_010001	AGC	2	6	648773	648778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_010001	TAG	2	6	648801	648806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_010001	ATA	2	6	648807	648812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_010001	AGG	2	6	648820	648825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_010001	ATT	2	6	648849	648854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_010001	G	6	6	648910	648915	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_010001	CTAA	2	8	648963	648970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_010001	GAA	2	6	648981	648986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_010001	CTA	2	6	649010	649015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_010001	GAG	2	6	649024	649029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_010001	A	6	6	649127	649132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_010001	TAA	2	6	649147	649152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_010001	TAA	2	6	649175	649180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_010001	ATTT	2	8	649957	649964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010001	TGG	2	6	649968	649973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_010001	A	6	6	649986	649991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_010001	TTATA	2	10	650429	650438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_010001	ACA	2	6	650446	650451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_010001	TAA	2	6	650515	650520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010001	TTA	2	6	650521	650526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_010001	CAC	2	6	650576	650581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_010001	A	6	6	650584	650589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_010001	T	6	6	650624	650629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3115	NC_010001	AT	3	6	651139	651144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_010001	T	6	6	651168	651173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_010001	AAC	2	6	653816	653821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_010001	A	7	7	653846	653852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_010001	TTAA	2	8	653882	653889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010001	ATT	2	6	655551	655556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_010001	TAT	2	6	655633	655638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_010001	AGG	2	6	655652	655657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_010001	TCC	2	6	656676	656681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_010001	GTC	2	6	656719	656724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_010001	TTC	2	6	656732	656737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_010001	GTA	2	6	656757	656762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_010001	TC	3	6	656813	656818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_010001	TAT	2	6	656875	656880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_010001	TTAA	2	8	656895	656902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010001	AGGTT	2	10	656920	656929	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010001	GGA	2	6	657941	657946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_010001	TA	4	8	662432	662439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_010001	TTG	2	6	662463	662468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_010001	TATT	2	8	664465	664472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_010001	T	7	7	664471	664477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_010001	ATA	2	6	664497	664502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3138	NC_010001	TAA	2	6	664612	664617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3424	NC_010001	TAT	2	6	737474	737479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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