MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 22296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010001	CAA	2	6	291846	291851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_010001	TGT	2	6	291875	291880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010001	T	6	6	291916	291921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010001	ACAA	2	8	291931	291938	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_010001	AGG	2	6	292049	292054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010001	TA	3	6	292595	292600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_010001	GCCAT	2	10	292605	292614	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1508	NC_010001	CA	3	6	292616	292621	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_010001	GGA	2	6	292725	292730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_010001	TG	3	6	292752	292757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010001	AGG	2	6	292830	292835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010001	TTC	2	6	294996	295001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_010001	ATATAA	2	12	295007	295018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_010001	T	7	7	295029	295035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010001	AG	3	6	295100	295105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010001	AT	4	8	295107	295114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010001	ATG	2	6	295166	295171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_010001	AGG	2	6	295184	295189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_010001	AATT	2	8	296408	296415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_010001	ATT	2	6	296442	296447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010001	T	8	8	296461	296468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_010001	ATA	2	6	296510	296515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_010001	AAG	2	6	296541	296546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010001	CTT	2	6	296589	296594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_010001	T	8	8	296593	296600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010001	GGT	2	6	296617	296622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010001	TAA	2	6	297487	297492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_010001	AGG	2	6	297505	297510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_010001	ATG	2	6	297559	297564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_010001	CAA	2	6	297613	297618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_010001	ATT	2	6	297632	297637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010001	AAT	2	6	297649	297654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_010001	TAAT	2	8	297695	297702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010001	ATA	2	6	297709	297714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_010001	TA	4	8	297750	297757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010001	ATAA	2	8	297759	297766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_010001	ATC	2	6	297776	297781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_010001	AGT	2	6	300471	300476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_010001	A	9	9	300485	300493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010001	AT	3	6	300499	300504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_010001	A	7	7	300517	300523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_010001	TA	3	6	300570	300575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010001	A	6	6	300591	300596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_010001	TAA	2	6	300597	300602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010001	TGA	2	6	300670	300675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_010001	TATAA	2	10	300726	300735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_010001	TGG	2	6	300791	300796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_010001	AGAAT	2	10	301813	301822	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_010001	T	6	6	301822	301827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_010001	A	7	7	301848	301854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_010001	GAG	2	6	301919	301924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_010001	GATAA	2	10	302735	302744	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010001	CTG	2	6	302770	302775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_010001	GGA	2	6	302806	302811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_010001	TTA	2	6	303682	303687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_010001	GAA	2	6	303727	303732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_010001	AAT	2	6	304092	304097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_010001	AC	3	6	304179	304184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_010001	CA	3	6	304223	304228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_010001	A	6	6	306560	306565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_010001	GTG	2	6	306566	306571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_010001	TAA	2	6	306594	306599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_010001	TTA	2	6	306659	306664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_010001	CAT	2	6	306677	306682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_010001	TTG	2	6	306693	306698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_010001	TAT	2	6	306722	306727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010001	AGG	2	6	306731	306736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_010001	TAGA	2	8	307668	307675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_010001	AAG	2	6	308916	308921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_010001	AAT	2	6	308929	308934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010001	GCT	2	6	308965	308970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_010001	ATT	2	6	308978	308983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_010001	A	6	6	309027	309032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_010001	GCC	2	6	309040	309045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_010001	GA	3	6	309072	309077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010001	AAG	2	6	309099	309104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_010001	A	7	7	309127	309133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_010001	AC	3	6	309156	309161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_010001	ATT	2	6	310775	310780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_010001	TTC	2	6	310796	310801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_010001	AGTG	2	8	310921	310928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_010001	TAA	2	6	310980	310985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_010001	A	6	6	310984	310989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_010001	AGG	2	6	311039	311044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_010001	ACC	2	6	312423	312428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_010001	TTA	2	6	312493	312498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_010001	TA	3	6	312497	312502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_010001	A	6	6	313474	313479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_010001	TAT	2	6	313538	313543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_010001	ATTTT	2	10	313550	313559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_010001	AAG	2	6	313570	313575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_010001	AC	3	6	313597	313602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_010001	TAT	2	6	313612	313617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_010001	T	6	6	313748	313753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_010001	ATAG	2	8	313772	313779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_010001	TTA	2	6	313785	313790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_010001	AAATA	2	10	313902	313911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_010001	AAGA	2	8	313933	313940	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_010001	TAA	2	6	313978	313983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_010001	A	7	7	314006	314012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_010001	A	7	7	314118	314124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_010001	AAT	2	6	314262	314267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_010001	TA	3	6	314283	314288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_010001	GAA	2	6	314361	314366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_010001	ATT	2	6	314376	314381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_010001	CAT	2	6	314431	314436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_010001	AAAG	2	8	314437	314444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_010001	AGTATT	2	12	314451	314462	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_010001	TAT	2	6	314469	314474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_010001	AAAAG	2	10	315073	315082	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_010001	TGT	2	6	315156	315161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_010001	TTG	2	6	315207	315212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_010001	GAA	2	6	315218	315223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_010001	AC	3	6	315228	315233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_010001	TTG	2	6	315249	315254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_010001	TAG	2	6	315257	315262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_010001	TCA	2	6	315327	315332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_010001	CTT	2	6	315359	315364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_010001	CAC	2	6	318012	318017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_010001	AGG	2	6	318077	318082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_010001	GTG	2	6	318112	318117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_010001	GGT	2	6	318148	318153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_010001	TAA	2	6	318241	318246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_010001	GAA	2	6	318260	318265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_010001	TG	3	6	319285	319290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_010001	TAA	2	6	319421	319426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010001	ATG	2	6	319428	319433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_010001	GTA	2	6	320004	320009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_010001	TAA	2	6	320038	320043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_010001	GGT	2	6	320059	320064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_010001	T	7	7	320084	320090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_010001	AACA	2	8	320117	320124	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_010001	TAA	2	6	320168	320173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_010001	AAG	2	6	325679	325684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_010001	AATA	2	8	325686	325693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_010001	GTA	2	6	325770	325775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_010001	ATAA	2	8	326959	326966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1956	NC_010001	ATT	2	6	395073	395078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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