MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 22296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010001	AAATG	2	10	1316660	1316669	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_010001	TAT	2	6	1316679	1316684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_010001	AGA	2	6	1316685	1316690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_010001	A	6	6	1316694	1316699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_010001	ATA	2	6	1316713	1316718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_010001	ACA	2	6	1316726	1316731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_010001	A	6	6	1316765	1316770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_010001	ATA	2	6	1316802	1316807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_010001	AT	3	6	1316810	1316815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_010001	T	6	6	1316815	1316820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_010001	AAG	2	6	1316855	1316860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_010001	AAG	2	6	1316893	1316898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_010001	TTAT	2	8	1316899	1316906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_010001	CTC	2	6	1318343	1318348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_010001	ATATG	2	10	1318349	1318358	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_010001	ATT	2	6	1318403	1318408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_010001	G	6	6	1318420	1318425	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_010001	ATGG	2	8	1318677	1318684	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_010001	T	7	7	1318723	1318729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_010001	AGCAA	2	10	1318809	1318818	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6021	NC_010001	TAG	2	6	1318840	1318845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_010001	ATTGA	2	10	1318883	1318892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_010001	ATAA	2	8	1318923	1318930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_010001	AGA	2	6	1318971	1318976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_010001	TTA	2	6	1322212	1322217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_010001	AAG	2	6	1322354	1322359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_010001	TCT	2	6	1322367	1322372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_010001	ATA	2	6	1323762	1323767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_010001	CTA	2	6	1323780	1323785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_010001	ATA	3	9	1323822	1323830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_010001	AAT	2	6	1323832	1323837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_010001	CAA	2	6	1323838	1323843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_010001	A	7	7	1323842	1323848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_010001	A	6	6	1323854	1323859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_010001	A	7	7	1323863	1323869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_010001	GAA	2	6	1323871	1323876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_010001	TATAA	2	10	1323897	1323906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_010001	GAAA	2	8	1323935	1323942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_010001	AGA	2	6	1324962	1324967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_010001	AAT	2	6	1325007	1325012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_010001	AGA	2	6	1325016	1325021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_010001	AGG	2	6	1325064	1325069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_010001	AGT	2	6	1326368	1326373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_010001	T	7	7	1326435	1326441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_010001	AATA	2	8	1326464	1326471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_010001	GC	3	6	1326495	1326500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_010001	CAT	2	6	1326525	1326530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6049	NC_010001	A	7	7	1327784	1327790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_010001	AT	3	6	1331126	1331131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_010001	TA	3	6	1331142	1331147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_010001	TAC	2	6	1331151	1331156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_010001	A	6	6	1331209	1331214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_010001	TGT	2	6	1331237	1331242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_010001	TTTG	2	8	1333581	1333588	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_010001	T	6	6	1335040	1335045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_010001	A	7	7	1335065	1335071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_010001	TAACGT	2	12	1335072	1335083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6059	NC_010001	TTAA	2	8	1335143	1335150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_010001	AAG	2	6	1335152	1335157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_010001	GCT	2	6	1335178	1335183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_010001	TATG	2	8	1335189	1335196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_010001	TAAATA	2	12	1335210	1335221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_010001	TTA	2	6	1335232	1335237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_010001	TAC	2	6	1335243	1335248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_010001	AAT	2	6	1336359	1336364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_010001	AT	3	6	1336400	1336405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_010001	A	7	7	1336414	1336420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_010001	TTA	2	6	1336451	1336456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_010001	AGAT	2	8	1339192	1339199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_010001	A	7	7	1339229	1339235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_010001	TAA	3	9	1339249	1339257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_010001	AAG	2	6	1339271	1339276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_010001	T	6	6	1339305	1339310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_010001	CTT	2	6	1339319	1339324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_010001	T	6	6	1339323	1339328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_010001	T	6	6	1339338	1339343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_010001	A	6	6	1339369	1339374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_010001	GGA	2	6	1339375	1339380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6081	NC_010001	ATA	2	6	1339423	1339428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_010001	TAA	2	6	1339441	1339446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_010001	A	6	6	1339494	1339499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_010001	A	7	7	1339525	1339531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_010001	GA	3	6	1339597	1339602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_010001	TCTTT	2	10	1343436	1343445	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6088	NC_010001	CA	3	6	1344647	1344652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_010001	TCTA	2	8	1344667	1344674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_010001	TTAA	2	8	1344713	1344720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_010001	A	8	8	1344722	1344729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_010001	ATA	2	6	1344736	1344741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_010001	AT	3	6	1344746	1344751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_010001	AAT	2	6	1344767	1344772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_010001	TTTG	2	8	1344788	1344795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_010001	TAT	2	6	1344806	1344811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_010001	TAA	2	6	1344818	1344823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_010001	AGG	2	6	1344832	1344837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_010001	AG	3	6	1345087	1345092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_010001	TAA	2	6	1345130	1345135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_010001	TAT	2	6	1345166	1345171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_010001	CAA	2	6	1345222	1345227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_010001	GAT	2	6	1345259	1345264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_010001	TGC	2	6	1345276	1345281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_010001	CTG	2	6	1345314	1345319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_010001	CTTG	2	8	1345379	1345386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6107	NC_010001	AGC	2	6	1345469	1345474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6109	NC_010001	AGG	2	6	1345508	1345513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_010001	TTC	2	6	1347291	1347296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_010001	GA	3	6	1347326	1347331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_010001	AT	3	6	1347416	1347421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_010001	CAA	2	6	1347453	1347458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_010001	AT	3	6	1347467	1347472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_010001	GAGT	2	8	1347485	1347492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_010001	T	6	6	1347503	1347508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_010001	TAT	2	6	1347521	1347526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6119	NC_010001	GGA	2	6	1347574	1347579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6121	NC_010001	CTA	2	6	1347655	1347660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_010001	ATT	2	6	1347691	1347696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_010001	TTTTC	2	10	1347701	1347710	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6124	NC_010001	GGTT	2	8	1347780	1347787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_010001	GTT	2	6	1347819	1347824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6127	NC_010001	A	6	6	1347887	1347892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_010001	AGAA	2	8	1347922	1347929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_010001	CAT	2	6	1347932	1347937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6131	NC_010001	A	6	6	1348057	1348062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_010001	AT	3	6	1349495	1349500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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