MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome

Total Repeats: 5535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009954	GTG	2	6	164120	164125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009954	TTAT	2	8	164127	164134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009954	TAA	2	6	164789	164794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009954	AC	3	6	164797	164802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_009954	AAC	2	6	167282	167287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_009954	AT	3	6	167291	167296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009954	ACC	2	6	167320	167325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_009954	AAGGC	2	10	167428	167437	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
509	NC_009954	TCC	2	6	168362	168367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_009954	ATT	2	6	168448	168453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009954	TTA	2	6	168479	168484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009954	ATT	2	6	169455	169460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_009954	ATT	2	6	172138	172143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_009954	AGTTT	2	10	172153	172162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
515	NC_009954	ACC	2	6	174044	174049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_009954	CAG	2	6	174063	174068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_009954	AATT	2	8	176258	176265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009954	AT	3	6	176341	176346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009954	TAAATA	2	12	176357	176368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009954	AT	3	6	176381	176386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009954	ATTA	2	8	176422	176429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009954	TAA	2	6	176858	176863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009954	TGA	2	6	176864	176869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009954	TCCT	2	8	176877	176884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_009954	TTAA	2	8	176901	176908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009954	TA	3	6	176955	176960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009954	TAAT	2	8	176964	176971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009954	TAAA	2	8	177977	177984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009954	AAT	2	6	177994	177999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009954	CAATA	2	10	179772	179781	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
531	NC_009954	TTAT	2	8	179820	179827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009954	ATCT	2	8	179943	179950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_009954	ATA	2	6	180020	180025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_009954	AGA	2	6	180086	180091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009954	TTC	2	6	180118	180123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_009954	AAAT	2	8	180129	180136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009954	TTA	2	6	180166	180171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_009954	CCTTAA	2	12	180230	180241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_009954	ATA	2	6	180332	180337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009954	GTA	2	6	180464	180469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009954	A	7	7	182782	182788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009954	CAT	2	6	182793	182798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_009954	ATA	2	6	182808	182813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009954	ATC	2	6	182825	182830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_009954	CTT	2	6	182839	182844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_009954	GAGT	2	8	182884	182891	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009954	CCT	2	6	182905	182910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_009954	GA	3	6	183040	183045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009954	ATG	2	6	183097	183102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009954	ACC	2	6	183120	183125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_009954	CCCA	2	8	183137	183144	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
552	NC_009954	TATG	2	8	183154	183161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009954	TTA	2	6	183232	183237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_009954	TTAT	2	8	183251	183258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009954	TA	4	8	183297	183304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009954	ACT	2	6	183320	183325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_009954	TCACA	2	10	183335	183344	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
558	NC_009954	TGCT	2	8	183426	183433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
559	NC_009954	TAA	2	6	183501	183506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009954	GGC	2	6	184948	184953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_009954	CAATC	2	10	184962	184971	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
562	NC_009954	T	6	6	185064	185069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009954	TAA	2	6	185132	185137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009954	AAT	2	6	185139	185144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009954	GAA	2	6	185145	185150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009954	ATT	2	6	187782	187787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009954	GGT	2	6	191248	191253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009954	T	6	6	191275	191280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009954	ATG	2	6	191444	191449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009954	GA	3	6	191533	191538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009954	AAT	2	6	193052	193057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009954	TCA	2	6	193073	193078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_009954	AAT	3	9	196710	196718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009954	AAT	2	6	196811	196816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009954	ATTA	2	8	196846	196853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009954	ATG	2	6	196894	196899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009954	AATTA	2	10	196921	196930	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009954	CT	3	6	196955	196960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_009954	TTAA	2	8	196978	196985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009954	ACC	2	6	199976	199981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_009954	TTA	2	6	200008	200013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009954	TAA	3	9	200024	200032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_009954	TAG	2	6	200058	200063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009954	AGG	2	6	200122	200127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009954	ATGC	2	8	200142	200149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_009954	GAG	2	6	200227	200232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009954	TGA	2	6	200233	200238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009954	GA	3	6	200237	200242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009954	CGGA	2	8	200243	200250	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
590	NC_009954	AAT	2	6	200282	200287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009954	ATG	2	6	200326	200331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009954	TC	3	6	200403	200408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_009954	TTA	2	6	200421	200426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009954	AGT	2	6	200452	200457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009954	CTA	2	6	200488	200493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_009954	TAA	2	6	200500	200505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009954	TAA	2	6	200507	200512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_009954	CAG	2	6	200599	200604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_009954	AAT	2	6	201096	201101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009954	ACC	2	6	201144	201149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_009954	TTA	2	6	205248	205253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_009954	GCC	2	6	205320	205325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_009954	TTA	2	6	209557	209562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009954	AC	3	6	209564	209569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_009954	ACA	2	6	211397	211402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_009954	CAT	2	6	211423	211428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_009954	TAAT	2	8	211440	211447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009954	TACCGG	2	12	211491	211502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_009954	CCA	2	6	218613	218618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_009954	TAAC	2	8	218636	218643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
613	NC_009954	AGG	2	6	218692	218697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009954	TGA	2	6	219340	219345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009954	ATT	2	6	220322	220327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_009954	CTA	2	6	220386	220391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_009954	AGG	2	6	220439	220444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009954	ATTAA	2	10	224418	224427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009954	AT	3	6	224456	224461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009954	TTA	2	6	224469	224474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_009954	ATT	2	6	224503	224508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009954	AAAT	2	8	224522	224529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009954	TTA	2	6	224531	224536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_009954	GTT	2	6	228232	228237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_009954	CTC	2	6	228261	228266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_009954	GAG	2	6	228337	228342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_009954	TA	3	6	228371	228376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_009954	ACC	2	6	228390	228395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_009954	CAT	2	6	228462	228467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_009954	GTA	2	6	229212	229217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_009954	CTA	2	6	229244	229249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_009954	CCCT	2	8	229257	229264	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
634	NC_009954	CAT	2	6	229297	229302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_009954	GTA	2	6	229325	229330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_009954	TTA	2	6	229359	229364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_009954	ATT	2	6	231171	231176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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