MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81116

Total Repeats: 352

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009839	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009839	ATTT	3	12	8037	8048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009839	AAAT	2	8	15742	15749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009839	TTTA	2	8	18070	18077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009839	TGAT	2	8	25647	25654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009839	AAGG	2	8	27991	27998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009839	TATT	2	8	35861	35868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009839	TTTA	2	8	37153	37160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009839	CTAT	2	8	37554	37561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009839	ATTT	2	8	39428	39435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009839	CAAG	2	8	39584	39591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009839	TAGC	2	8	40249	40256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009839	CTTA	2	8	40911	40918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009839	AAAG	2	8	40982	40989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009839	AGTA	2	8	41042	41049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009839	TAAT	2	8	41208	41215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009839	GGAT	2	8	41478	41485	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009839	GGTG	2	8	41563	41570	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009839	TCCC	2	8	41705	41712	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_009839	TCGT	2	8	42253	42260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009839	ATAA	2	8	42874	42881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009839	TAAA	2	8	42997	43004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009839	TTAC	2	8	43234	43241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009839	TAAA	2	8	43455	43462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009839	ATTA	2	8	43507	43514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009839	TTAA	2	8	43521	43528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009839	TATT	2	8	43587	43594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009839	TTTA	2	8	43619	43626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009839	TAAA	2	8	65676	65683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009839	TAAA	2	8	70559	70566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009839	TAAA	2	8	75765	75772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009839	ATTT	2	8	76039	76046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009839	AGAA	2	8	76126	76133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009839	TCTT	2	8	76816	76823	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009839	AATT	2	8	77635	77642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009839	ATTT	2	8	85602	85609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009839	AAAT	2	8	85635	85642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009839	TTTA	2	8	87804	87811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009839	TTTA	2	8	89110	89117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009839	ATTA	2	8	95306	95313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009839	TAAA	2	8	95344	95351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009839	AATT	2	8	101495	101502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009839	ATTT	2	8	101542	101549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009839	TAAA	3	12	101551	101562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009839	TAAA	2	8	102376	102383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009839	AGGA	2	8	107184	107191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009839	TTTA	2	8	111243	111250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009839	ATTA	2	8	125173	125180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009839	AAGG	2	8	140062	140069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009839	ATTA	2	8	149324	149331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009839	TAAA	2	8	152407	152414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009839	AATT	2	8	152428	152435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009839	CCTT	2	8	158946	158953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009839	ATAA	2	8	158965	158972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009839	CTTT	2	8	160576	160583	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009839	CAAA	2	8	174169	174176	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009839	TTAA	2	8	174204	174211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009839	AAAT	2	8	174220	174227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009839	TAAA	2	8	174827	174834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009839	TAAA	2	8	180653	180660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009839	TTGC	2	8	192201	192208	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009839	ATTT	2	8	196350	196357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009839	TTTA	2	8	198753	198760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009839	TTTA	2	8	210414	210421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009839	TAAA	2	8	216337	216344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009839	TAAA	2	8	216390	216397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009839	TAAA	2	8	221329	221336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009839	TAAA	2	8	222150	222157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009839	GGTT	2	8	222236	222243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009839	ATTA	3	12	227594	227605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009839	GTTA	2	8	231684	231691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009839	TAAA	2	8	234638	234645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009839	TTTG	2	8	234671	234678	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009839	GTTT	2	8	248098	248105	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009839	TCCC	2	8	248182	248189	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_009839	TTGA	2	8	248232	248239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009839	AAAT	2	8	257793	257800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009839	ATTT	2	8	257838	257845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009839	CTTT	2	8	267742	267749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009839	TTAA	2	8	276624	276631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009839	ATTG	2	8	277455	277462	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009839	GCAA	2	8	277550	277557	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009839	ATGA	2	8	283228	283235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009839	AAGT	2	8	283238	283245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009839	AATA	2	8	303975	303982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009839	AAAG	2	8	311888	311895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009839	TTTA	2	8	313134	313141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009839	TAAA	2	8	324194	324201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009839	ATTT	2	8	325421	325428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009839	TAAA	2	8	334153	334160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009839	ATAA	2	8	335936	335943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009839	ATTA	2	8	335974	335981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009839	ATTT	2	8	336004	336011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009839	TAAA	2	8	340848	340855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009839	TATT	2	8	349386	349393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009839	TTTA	2	8	380724	380731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009839	TAAA	2	8	389935	389942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009839	TTTA	2	8	392996	393003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009839	ATTA	2	8	396204	396211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009839	TTTA	2	8	403025	403032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009839	CTAT	2	8	403426	403433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009839	ATTT	2	8	405300	405307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009839	CAAG	2	8	405456	405463	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009839	TAGC	2	8	406121	406128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009839	CTTA	2	8	406783	406790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009839	AAAG	2	8	406854	406861	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009839	AGTA	2	8	406914	406921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009839	TAAT	2	8	407080	407087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009839	GGAT	2	8	407350	407357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009839	GGTG	2	8	407435	407442	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009839	TCCC	2	8	407577	407584	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_009839	TCGT	2	8	408125	408132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009839	ATAA	2	8	408746	408753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009839	TAAA	2	8	408869	408876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009839	TTAC	2	8	409106	409113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009839	GATA	2	8	413162	413169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009839	TTAA	2	8	414358	414365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009839	TTAA	2	8	414379	414386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009839	ATTT	2	8	414475	414482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009839	ATCT	2	8	414493	414500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009839	GTTT	2	8	414581	414588	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009839	TTAA	2	8	421598	421605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009839	ATAA	2	8	423810	423817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009839	ATTT	2	8	443256	443263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009839	ATTT	2	8	443696	443703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009839	AAAG	2	8	457092	457099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009839	TCAT	2	8	457495	457502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009839	TTTA	2	8	465166	465173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009839	TATT	2	8	465218	465225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009839	TACT	2	8	465702	465709	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009839	AACA	2	8	469837	469844	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009839	AATC	2	8	469878	469885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009839	AGAA	2	8	469925	469932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009839	TAAA	2	8	474738	474745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009839	TTTA	2	8	482447	482454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009839	CTTT	2	8	482848	482855	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009839	GTTT	2	8	499182	499189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009839	AAAC	2	8	499198	499205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009839	ATTT	2	8	515246	515253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009839	CAAA	2	8	518406	518413	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009839	TTTC	2	8	518549	518556	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009839	ATCA	2	8	518726	518733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009839	ATTT	2	8	519396	519403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009839	TTTA	2	8	526691	526698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009839	TTTA	2	8	527782	527789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009839	TGTT	2	8	530189	530196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009839	AATT	2	8	530299	530306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009839	CTTT	2	8	531773	531780	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009839	ATTT	2	8	537801	537808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009839	AATA	2	8	538005	538012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009839	ATTT	2	8	538044	538051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.