MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 plasmid pESA3

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009780	AAG	2	6	50	55	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009780	CTG	2	6	172	177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009780	GCC	2	6	249	254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009780	AGC	2	6	350	355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009780	AGA	2	6	543	548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009780	GCT	2	6	555	560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009780	AAT	2	6	757	762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009780	CGC	2	6	1589	1594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009780	TTC	2	6	2442	2447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009780	CTT	2	6	2448	2453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009780	CGC	2	6	2466	2471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009780	AAT	2	6	4270	4275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009780	CGA	2	6	4307	4312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009780	CGC	2	6	4393	4398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009780	CCT	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009780	TTA	2	6	5714	5719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009780	AAT	2	6	5727	5732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009780	TAC	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009780	CGG	2	6	6938	6943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009780	GAA	2	6	7036	7041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009780	CAT	2	6	7079	7084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009780	CAG	2	6	9413	9418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009780	TGC	2	6	10358	10363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009780	GCG	2	6	13365	13370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009780	CAG	2	6	18415	18420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009780	CGC	2	6	18471	18476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_009780	GCC	2	6	19086	19091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009780	GGC	2	6	19098	19103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009780	TTA	2	6	20903	20908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009780	TTA	2	6	20912	20917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009780	GCG	2	6	24010	24015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009780	TAA	2	6	25116	25121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009780	CGC	2	6	25455	25460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009780	ATG	2	6	26254	26259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009780	AGA	2	6	26262	26267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009780	AGG	2	6	26268	26273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009780	CTT	2	6	27018	27023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009780	ATC	2	6	27099	27104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009780	ATA	2	6	27488	27493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009780	TTA	2	6	27559	27564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009780	ATT	2	6	27687	27692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009780	GCT	2	6	27746	27751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009780	GCA	2	6	29084	29089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009780	ATT	2	6	29148	29153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009780	TTG	2	6	30030	30035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009780	GCT	2	6	31975	31980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009780	CAT	2	6	31981	31986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009780	CGC	2	6	32007	32012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009780	TTA	2	6	32097	32102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009780	ATA	2	6	32237	32242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009780	TGG	2	6	32269	32274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009780	TTA	2	6	32280	32285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009780	GCG	2	6	35791	35796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009780	TGT	3	9	37190	37198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009780	GCG	2	6	39411	39416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009780	AAT	2	6	39903	39908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009780	ATT	2	6	40389	40394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009780	GCC	2	6	40428	40433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009780	ACG	2	6	42096	42101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009780	ATT	2	6	43087	43092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009780	GCG	2	6	44964	44969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009780	CGG	3	9	44998	45006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009780	ATT	2	6	45088	45093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009780	GCT	2	6	45529	45534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009780	ACA	2	6	45556	45561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009780	TAA	2	6	45582	45587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009780	TGC	2	6	45711	45716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009780	ACG	2	6	48935	48940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009780	ATT	2	6	48952	48957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009780	CAA	2	6	49368	49373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009780	TTA	2	6	50302	50307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009780	GGC	2	6	52633	52638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009780	CTG	2	6	52639	52644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009780	TTG	2	6	52654	52659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009780	ATA	2	6	52677	52682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009780	ATT	2	6	52745	52750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009780	ATT	2	6	52752	52757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009780	AAT	2	6	52778	52783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009780	GTT	2	6	52806	52811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009780	GAA	2	6	52821	52826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009780	AAT	2	6	53073	53078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009780	GTT	2	6	53147	53152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009780	TGG	2	6	53248	53253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009780	TTA	2	6	53824	53829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009780	CAC	2	6	59680	59685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009780	GGT	2	6	62445	62450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009780	GCT	2	6	62456	62461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009780	AAT	2	6	62474	62479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009780	GCA	2	6	62573	62578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009780	AAC	2	6	62965	62970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009780	TGA	2	6	63057	63062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009780	AGC	2	6	63076	63081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009780	TCC	2	6	63228	63233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009780	TAA	2	6	63258	63263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009780	TTG	2	6	63269	63274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009780	TGT	2	6	63321	63326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009780	ATA	2	6	63341	63346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009780	AAT	2	6	63416	63421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009780	ACG	2	6	63437	63442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009780	TAA	2	6	68085	68090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009780	GAA	2	6	68388	68393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009780	TGT	2	6	68397	68402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009780	CAT	2	6	68423	68428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009780	ATT	3	9	68475	68483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009780	GCG	2	6	69212	69217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009780	AAT	2	6	72369	72374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009780	TGC	2	6	73304	73309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009780	CGC	2	6	77771	77776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009780	TAT	2	6	77820	77825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009780	AGG	2	6	77848	77853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009780	GGC	2	6	79302	79307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009780	ATC	2	6	79485	79490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009780	CAG	2	6	79614	79619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009780	AAT	2	6	79620	79625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009780	TCA	2	6	79668	79673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009780	AAT	2	6	79822	79827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009780	TAA	2	6	79836	79841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009780	CAC	2	6	79858	79863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009780	AGA	2	6	79873	79878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009780	GCC	2	6	79972	79977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_009780	GAT	2	6	80035	80040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009780	TAA	2	6	80108	80113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009780	TAT	2	6	80156	80161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009780	TAA	2	6	80186	80191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009780	GAT	2	6	80343	80348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009780	TCC	2	6	80373	80378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009780	ACC	2	6	80383	80388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_009780	TTA	2	6	80404	80409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009780	CAT	2	6	81542	81547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009780	AAT	3	9	88472	88480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009780	GGT	2	6	89079	89084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009780	GTG	2	6	89369	89374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009780	GTG	2	6	89515	89520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009780	ATT	2	6	89528	89533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009780	AAT	2	6	91386	91391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009780	CCT	2	6	93733	93738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009780	GTA	2	6	93795	93800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009780	GCC	2	6	93979	93984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_009780	ACA	2	6	93998	94003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009780	GGC	2	6	94048	94053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009780	TGT	2	6	94184	94189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.