MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 8741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009727	AAT	2	6	127948	127953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009727	T	7	7	127974	127980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009727	A	6	6	128042	128047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009727	T	6	6	130536	130541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009727	AAT	2	6	130563	130568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009727	T	6	6	130659	130664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009727	AAGA	2	8	130681	130688	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009727	ATAAA	2	10	130693	130702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009727	AGC	2	6	130750	130755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_009727	TAT	2	6	132095	132100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009727	GCC	2	6	132146	132151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_009727	ATT	2	6	132412	132417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_009727	GCC	2	6	132431	132436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_009727	GCACA	2	10	132632	132641	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
515	NC_009727	GAGC	2	8	132668	132675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
516	NC_009727	GAG	2	6	132721	132726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009727	GAC	2	6	132750	132755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_009727	GCGCTT	2	12	132762	132773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_009727	TAAA	2	8	133464	133471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009727	T	6	6	133539	133544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009727	TGT	2	6	133555	133560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009727	CCG	2	6	134533	134538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_009727	ATG	3	9	134606	134614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009727	GCC	2	6	134624	134629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_009727	TG	3	6	134646	134651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009727	T	6	6	134657	134662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009727	AAT	2	6	134671	134676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009727	T	7	7	134691	134697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009727	A	9	9	134701	134709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009727	TAA	2	6	134740	134745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_009727	ATTTT	2	10	134785	134794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009727	CCGC	2	8	134798	134805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
533	NC_009727	T	6	6	134838	134843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_009727	TGA	2	6	134848	134853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009727	CGC	2	6	134996	135001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_009727	T	7	7	135029	135035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009727	AC	3	6	135085	135090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_009727	AAGAT	2	10	135120	135129	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009727	CAT	2	6	135219	135224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_009727	GTT	2	6	135233	135238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009727	ATA	2	6	135352	135357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009727	ATAA	2	8	135379	135386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009727	AAG	2	6	135407	135412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009727	ACCG	3	12	135510	135521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
545	NC_009727	ACC	2	6	135534	135539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_009727	AAT	2	6	135636	135641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009727	AAT	2	6	135653	135658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009727	CGA	2	6	135743	135748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_009727	CCG	2	6	135757	135762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_009727	TAA	2	6	135804	135809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009727	GGT	2	6	135825	135830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009727	ACA	2	6	135841	135846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_009727	CGG	2	6	135852	135857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009727	GT	3	6	135913	135918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009727	TGC	2	6	135976	135981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_009727	A	6	6	135982	135987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009727	T	6	6	136070	136075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009727	GTT	2	6	136115	136120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009727	C	6	6	136130	136135	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
560	NC_009727	CCA	2	6	136140	136145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_009727	ATC	2	6	136187	136192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_009727	CAA	2	6	136238	136243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_009727	AGG	2	6	136261	136266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009727	GGAC	2	8	136335	136342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_009727	T	6	6	136366	136371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009727	AGC	2	6	136427	136432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_009727	T	6	6	136436	136441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009727	GATA	2	8	136483	136490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009727	T	9	9	136502	136510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009727	GCC	2	6	136529	136534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_009727	TCG	2	6	136617	136622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_009727	A	7	7	136626	136632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009727	CGC	2	6	136641	136646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_009727	CCGC	2	8	136758	136765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
575	NC_009727	CAT	2	6	137962	137967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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578	NC_009727	TAT	2	6	139012	139017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_009727	TCT	2	6	139053	139058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_009727	TAA	2	6	139127	139132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009727	CTTT	2	8	139147	139154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_009727	CT	3	6	139174	139179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_009727	A	7	7	139521	139527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009727	T	6	6	139558	139563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009727	GC	3	6	143020	143025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_009727	TAT	2	6	144116	144121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009727	CTC	2	6	144133	144138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_009727	ACCC	2	8	146269	146276	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
589	NC_009727	A	7	7	146322	146328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009727	TG	3	6	146392	146397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009727	TGA	2	6	146402	146407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009727	GTAT	2	8	146449	146456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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594	NC_009727	GGA	2	6	146504	146509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009727	GCA	2	6	146569	146574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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598	NC_009727	GTG	2	6	146796	146801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_009727	AGCG	2	8	146836	146843	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
600	NC_009727	TTGT	2	8	146884	146891	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_009727	GAG	2	6	146933	146938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009727	GGGT	2	8	146997	147004	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
604	NC_009727	GTG	2	6	147035	147040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009727	TCA	2	6	147045	147050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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607	NC_009727	AGG	2	6	147119	147124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009727	TGT	2	6	147125	147130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009727	A	6	6	147207	147212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009727	GAAT	2	8	147263	147270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009727	TG	3	6	147277	147282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009727	GAAGC	2	10	147635	147644	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
613	NC_009727	ATG	2	6	147661	147666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009727	TCGCT	2	10	147687	147696	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
615	NC_009727	GAG	2	6	147717	147722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009727	TAT	2	6	147749	147754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_009727	ATT	2	6	147807	147812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009727	TTTA	2	8	147853	147860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009727	TGG	2	6	147880	147885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009727	A	10	10	147903	147912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009727	AAG	2	6	147938	147943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_009727	GTC	2	6	147957	147962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_009727	A	6	6	148001	148006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009727	TAA	2	6	148061	148066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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628	NC_009727	TAC	2	6	148486	148491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_009727	CTTC	2	8	148492	148499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_009727	ATCC	2	8	148535	148542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_009727	TTC	2	6	148543	148548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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633	NC_009727	GTA	2	6	148567	148572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_009727	ATT	2	6	148667	148672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_009727	TA	3	6	148695	148700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_009727	T	7	7	148703	148709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_009727	GAT	2	6	148750	148755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_009727	A	6	6	148778	148783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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