MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 plasmid pQpDG

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009726	TA	4	8	30	37	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009726	AT	3	6	61	66	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009726	CA	3	6	10426	10431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009726	TG	3	6	10437	10442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009726	GC	3	6	11566	11571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009726	TC	4	8	11640	11647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009726	TC	3	6	11743	11748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009726	TC	3	6	11919	11924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009726	TG	3	6	12164	12169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009726	TG	3	6	18051	18056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009726	TG	3	6	18524	18529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009726	AT	3	6	20424	20429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009726	GT	3	6	21156	21161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009726	AT	3	6	26185	26190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009726	GA	3	6	27310	27315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009726	TC	3	6	27760	27765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009726	TA	3	6	28046	28051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009726	GC	3	6	28255	28260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009726	GC	3	6	28752	28757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009726	TG	3	6	29774	29779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009726	TA	3	6	30833	30838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009726	AG	3	6	30907	30912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009726	TG	3	6	33638	33643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009726	TA	3	6	35219	35224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009726	AG	3	6	35514	35519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009726	AG	4	8	36083	36090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009726	TC	3	6	40457	40462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009726	CA	3	6	40604	40609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009726	AT	3	6	40775	40780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009726	TA	3	6	40807	40812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009726	TC	3	6	48244	48249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009726	AT	3	6	48269	48274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009726	AT	4	8	54170	54177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.