MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter curvus 525.92 chromosome

Total Repeats: 293

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009715	CAAAG	2	10	32011	32020	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009715	TTTCA	2	10	32170	32179	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009715	TTCTT	2	10	32256	32265	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009715	CTTTG	2	10	32276	32285	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009715	ATTAA	2	10	35831	35840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009715	AAATT	2	10	51838	51847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009715	AAATT	2	10	51883	51892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009715	TAAAT	2	10	54364	54373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009715	AAATA	2	10	64557	64566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009715	ATTAT	2	10	64573	64582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009715	ACTTT	2	10	68565	68574	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009715	GGGGC	2	10	69257	69266	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009715	GCTCA	2	10	69462	69471	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009715	AAAAC	2	10	69882	69891	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009715	AAAAT	2	10	74211	74220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009715	TGAAC	2	10	85617	85626	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009715	ATTTG	2	10	86045	86054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009715	AAGAT	2	10	86236	86245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009715	TAAAA	2	10	111173	111182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009715	ATTTA	2	10	114545	114554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009715	ATCGT	2	10	114643	114652	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009715	CTACG	2	10	114657	114666	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009715	TAAAA	3	15	126201	126215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009715	ATTAT	2	10	126388	126397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009715	ATGTA	2	10	183550	183559	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009715	AGCGT	2	10	188520	188529	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009715	AAAAT	2	10	189272	189281	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009715	CTTTT	2	10	191699	191708	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009715	TTTAC	2	10	193324	193333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009715	GTTTT	2	10	232443	232452	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009715	CTTAT	2	10	250164	250173	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009715	TATGT	2	10	252872	252881	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009715	CTAAA	2	10	275657	275666	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009715	TATTT	2	10	276225	276234	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009715	TTAAT	2	10	276369	276378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009715	AAAAG	2	10	280855	280864	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009715	GGCTT	2	10	293501	293510	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009715	CGAAA	2	10	294407	294416	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009715	CTTTA	2	10	294510	294519	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009715	CCACG	2	10	295795	295804	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_009715	GCTTC	2	10	301372	301381	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009715	TTTAG	2	10	303512	303521	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009715	CTAAA	2	10	305076	305085	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009715	TCGCT	2	10	305152	305161	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009715	GAAAA	2	10	313486	313495	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009715	TACTT	2	10	328432	328441	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009715	TATAG	2	10	337854	337863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009715	TAAAA	2	10	337906	337915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009715	TAATA	2	10	366833	366842	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009715	AATTT	2	10	377102	377111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009715	TCAGC	2	10	377758	377767	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009715	ATCAC	2	10	378253	378262	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_009715	ACTAC	2	10	378535	378544	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_009715	AATAA	2	10	402349	402358	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009715	TTATT	2	10	461631	461640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009715	TAAAA	2	10	461675	461684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009715	GCAAA	2	10	461880	461889	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009715	CGGCA	2	10	462491	462500	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009715	TCAGC	2	10	474901	474910	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_009715	TGATC	2	10	497857	497866	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009715	AGATC	2	10	503568	503577	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009715	AATCT	2	10	535925	535934	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009715	TAAAT	2	10	559444	559453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009715	AAATT	2	10	562622	562631	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009715	TTTAG	2	10	576149	576158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009715	CTTTC	2	10	590072	590081	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009715	GAAGC	2	10	601115	601124	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009715	ATATC	2	10	606577	606586	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009715	AAATG	2	10	607138	607147	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009715	CGTCA	2	10	608334	608343	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009715	CAAAG	2	10	608744	608753	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009715	GTGAG	2	10	619706	619715	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009715	TCGCT	2	10	619731	619740	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009715	AAATG	2	10	624683	624692	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009715	TCTTG	2	10	630249	630258	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009715	AAAAT	2	10	631592	631601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009715	CAGCT	2	10	634018	634027	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_009715	GCTTC	2	10	645047	645056	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_009715	CCTGC	2	10	645363	645372	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_009715	TTTAG	2	10	651498	651507	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009715	AGTGA	2	10	660860	660869	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009715	TTACT	2	10	661726	661735	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009715	ATTTC	2	10	667518	667527	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009715	ATTTT	2	10	669438	669447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009715	CGCTT	2	10	684116	684125	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_009715	TCACG	2	10	705562	705571	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_009715	ATAAA	2	10	717531	717540	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009715	ACTTT	2	10	729998	730007	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009715	CTACG	2	10	731233	731242	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_009715	GCTAC	2	10	745905	745914	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_009715	ATTTA	2	10	747727	747736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009715	ATTAT	2	10	755643	755652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009715	AAATA	2	10	755661	755670	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009715	CAGGC	2	10	762328	762337	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_009715	AAAAG	2	10	763033	763042	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009715	GATAG	2	10	763528	763537	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009715	CGAAT	2	10	768516	768525	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009715	GGAGT	2	10	768540	768549	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009715	ATTTG	2	10	769432	769441	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009715	TTTTA	2	10	775695	775704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009715	TTAAA	2	10	775752	775761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009715	TTTAT	2	10	790949	790958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009715	TGCTT	2	10	791036	791045	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009715	AGGAG	2	10	791179	791188	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009715	AAAAG	2	10	793134	793143	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009715	TTTAT	2	10	797221	797230	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009715	TTTGT	2	10	797943	797952	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009715	CAATT	2	10	828319	828328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009715	TCGTG	2	10	829950	829959	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009715	CCGTA	2	10	833404	833413	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009715	TGCTA	2	10	835398	835407	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009715	TCAAA	2	10	835423	835432	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009715	TCGCT	2	10	835974	835983	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_009715	TAAAA	2	10	836259	836268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009715	ATTTA	2	10	836333	836342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009715	TAGGA	2	10	839547	839556	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009715	ATTTT	2	10	840028	840037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009715	TACGC	2	10	844637	844646	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_009715	GAAGC	2	10	844854	844863	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009715	AATAG	2	10	861247	861256	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009715	GAAGT	2	10	867891	867900	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009715	AGCCT	2	10	867904	867913	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_009715	AATCA	2	10	871403	871412	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009715	TGCTT	2	10	876632	876641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009715	GTTAT	2	10	886488	886497	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009715	TTTAA	2	10	892318	892327	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009715	AGCCA	2	10	897462	897471	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_009715	CCTTA	2	10	897485	897494	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_009715	TTTGC	2	10	897580	897589	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009715	CAAAG	2	10	898101	898110	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009715	TTTAT	2	10	898678	898687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009715	GCTTC	2	10	931791	931800	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_009715	ATTTG	2	10	935309	935318	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009715	AAAAC	2	10	937319	937328	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009715	TAGTT	2	10	937757	937766	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009715	TCGCT	2	10	946356	946365	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_009715	CTAAA	2	10	968653	968662	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009715	TTTGC	2	10	974206	974215	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009715	TATAT	2	10	981770	981779	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009715	CGTGG	2	10	982595	982604	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009715	CATCT	2	10	984706	984715	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_009715	CCGAG	2	10	984784	984793	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_009715	TTTTA	2	10	991917	991926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009715	TAAAA	2	10	999737	999746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009715	TTATT	2	10	999763	999772	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009715	AGCCA	2	10	1003267	1003276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_009715	TAAAA	2	10	1005243	1005252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_009715	TATTT	2	10	1933548	1933557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009715	CGGTA	2	10	1937836	1937845	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
289	NC_009715	ATTTT	2	10	1938016	1938025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009715	TATTT	2	10	1938259	1938268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_009715	ACTCT	2	10	1941711	1941720	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
292	NC_009715	AATTT	2	10	1941869	1941878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_009715	ATCTC	2	10	1953182	1953191	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.