MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97 chromosome

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009707	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009707	AATTTA	2	12	21406	21417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009707	TTGGAA	2	12	42626	42637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009707	TTTATT	2	12	46862	46873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009707	TTAAAT	2	12	47068	47079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009707	AGATAA	2	12	53720	53731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009707	TGCGTT	2	12	58057	58068	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009707	AATTAA	2	12	71658	71669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009707	ATGCTA	2	12	101374	101385	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009707	TTTAAA	2	12	106626	106637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009707	TAATAT	2	12	126831	126842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009707	ATGCTA	2	12	127306	127317	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009707	TACAAG	2	12	127349	127360	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009707	ATTTTT	2	12	171315	171326	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009707	AGCTTT	2	12	171611	171622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009707	ATATTA	2	12	178334	178345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009707	ATATTT	2	12	178364	178375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009707	GTGAAC	2	12	197004	197015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009707	AAACTA	2	12	204624	204635	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009707	AGGCAA	2	12	205197	205208	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009707	GTTTAT	2	12	205459	205470	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009707	AAATTT	2	12	206205	206216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009707	TCAAAA	2	12	207921	207932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009707	TTTGAA	2	12	208099	208110	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009707	TATTTT	2	12	208199	208210	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009707	TTAATT	2	12	223077	223088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009707	AAAAAT	2	12	225057	225068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009707	TGGTTT	2	12	226716	226727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009707	TCCATA	2	12	236869	236880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009707	TTCTTT	2	12	238972	238983	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009707	TTCATT	2	12	238987	238998	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009707	AAGTCC	2	12	239472	239483	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009707	AAAGTA	2	12	239597	239608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009707	AACTTA	2	12	281205	281216	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009707	CTAAAA	2	12	310509	310520	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009707	TTAAGA	2	12	313895	313906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009707	ATTTTC	2	12	333427	333438	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009707	CATTTT	2	12	333591	333602	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009707	TTCGCT	2	12	340430	340441	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009707	TTAATT	2	12	357702	357713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009707	ATAAAG	2	12	363937	363948	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009707	TTTCTT	2	12	365334	365345	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009707	AGAAAG	2	12	369466	369477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009707	TATTTA	2	12	369933	369944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009707	GAAATT	2	12	385661	385672	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009707	TAAAAT	2	12	447414	447425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009707	TTTTAT	2	12	448152	448163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009707	ATCTTC	2	12	450038	450049	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009707	GGATAT	2	12	463461	463472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009707	TTCTTT	2	12	464224	464235	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009707	TTAAAT	2	12	464340	464351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009707	TAAAAA	2	12	464523	464534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009707	AATTTA	2	12	469861	469872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009707	ATAATT	2	12	484401	484412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009707	TTATGA	2	12	504580	504591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009707	GAGCTA	2	12	506962	506973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009707	AATTAC	2	12	512423	512434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009707	AATTTT	2	12	512510	512521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009707	TATCTT	2	12	518837	518848	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009707	CGAAAA	2	12	567782	567793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009707	TTTAAA	2	12	568046	568057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009707	CTAAAA	2	12	577181	577192	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009707	AATATT	2	12	577637	577648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009707	TTTTAG	2	12	578957	578968	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009707	ATGGCT	2	12	579415	579426	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009707	ATTTTT	2	12	605672	605683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009707	ATTAAA	2	12	606160	606171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009707	GATTTG	2	12	611151	611162	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009707	AAGCTT	2	12	612376	612387	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009707	CAAAAT	2	12	621952	621963	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009707	TTAAAT	2	12	622818	622829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009707	CTAATT	2	12	631554	631565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009707	GTGCTT	3	18	681630	681647	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009707	TTTTTC	2	12	735763	735774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009707	TAAAAT	2	12	736950	736961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009707	AAACAA	2	12	749566	749577	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009707	AAAAAT	2	12	760461	760472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009707	AATTTG	2	12	762040	762051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009707	CAAATT	2	12	762178	762189	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009707	ACTACA	2	12	767893	767904	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009707	AAATAC	2	12	771331	771342	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009707	AAATAT	2	12	774700	774711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009707	CATTTT	2	12	776570	776581	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009707	TATCGC	2	12	777289	777300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009707	TTTATT	2	12	778117	778128	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009707	AAAACT	2	12	791620	791631	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009707	ATCAAA	2	12	803680	803691	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009707	AATTTT	2	12	803829	803840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009707	ATAAAA	2	12	804043	804054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009707	CTTATG	2	12	807265	807276	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009707	TAAAAA	2	12	824317	824328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009707	ATAATT	2	12	827304	827315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009707	ATTAAA	2	12	837384	837395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009707	ATGCCC	2	12	857196	857207	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009707	CATATA	2	12	857866	857877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009707	TTTTTA	2	12	859760	859771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009707	AATTTT	2	12	864879	864890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009707	AGCTGG	2	12	888520	888531	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009707	AAATTA	2	12	893015	893026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009707	CAAAGA	2	12	905421	905432	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009707	TAGCGA	2	12	908383	908394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009707	ATGAAA	2	12	909107	909118	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009707	TAAATA	2	12	925637	925648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009707	TTCTTT	2	12	925664	925675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009707	TCTTTT	2	12	954539	954550	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_009707	TATAAA	2	12	954994	955005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009707	TAAAAA	2	12	955174	955185	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009707	ATCAAA	2	12	962405	962416	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_009707	CTTTTA	2	12	972640	972651	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009707	AATATT	2	12	979601	979612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009707	TAAGAT	2	12	981367	981378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009707	TTAAAA	2	12	983960	983971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009707	AGCAAA	2	12	992639	992650	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009707	GCTTTA	2	12	1004113	1004124	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009707	TAGCAT	2	12	1010189	1010200	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_009707	TTTTTG	2	12	1018986	1018997	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009707	ATTTTT	2	12	1024071	1024082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009707	TTCATT	2	12	1024308	1024319	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009707	TTTGTC	2	12	1026304	1026315	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_009707	TAAGCG	2	12	1027002	1027013	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_009707	CATTTG	2	12	1028826	1028837	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009707	TGGTTG	2	12	1029153	1029164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009707	AAAATT	2	12	1033025	1033036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009707	GGTGCA	2	12	1047233	1047244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009707	ATTAAT	2	12	1047462	1047473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009707	CATAAG	2	12	1075898	1075909	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_009707	AATGCG	2	12	1100410	1100421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_009707	TATAAA	2	12	1104400	1104411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009707	AAAAAT	2	12	1107005	1107016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009707	GTTTTT	2	12	1109973	1109984	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.