MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 chromosome

Total Repeats: 948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009706	AGGAG	2	10	9980	9989	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009706	TCGTG	2	10	10389	10398	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009706	GGGAG	2	10	11937	11946	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009706	TAAGT	2	10	12463	12472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009706	AGGAT	2	10	12881	12890	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009706	CAAGA	2	10	14187	14196	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009706	TTCTT	2	10	14676	14685	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009706	AAAAT	2	10	20569	20578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009706	ATAAA	2	10	28035	28044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009706	TAGGT	2	10	28416	28425	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009706	AGAAA	2	10	29845	29854	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009706	CTACC	2	10	33850	33859	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_009706	ATTAT	2	10	34410	34419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009706	AAGTA	2	10	34437	34446	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009706	AAAAG	2	10	35143	35152	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009706	TTTTA	2	10	55023	55032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009706	TATTT	2	10	55033	55042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009706	TTTAG	2	10	55863	55872	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009706	ACTTT	2	10	56819	56828	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009706	GTCAA	2	10	56833	56842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009706	TAAAA	2	10	57430	57439	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009706	AATAT	2	10	57770	57779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009706	AGAAA	2	10	59061	59070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009706	TTGGA	2	10	59130	59139	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009706	ACACA	2	10	59772	59781	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009706	TTGTA	2	10	66920	66929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009706	TATAT	2	10	67146	67155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009706	GCAGA	2	10	67233	67242	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009706	AAGTT	2	10	71663	71672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009706	ATATA	2	10	73755	73764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009706	GTTAA	2	10	80411	80420	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009706	ATTTA	2	10	81750	81759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009706	AAAAG	2	10	87245	87254	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009706	GAGTT	2	10	98484	98493	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009706	TAAAT	2	10	99908	99917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009706	GATAA	2	10	106955	106964	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009706	ATTTA	2	10	117790	117799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009706	AATTT	2	10	121142	121151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009706	TATAT	2	10	121372	121381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009706	TCTAA	2	10	122965	122974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009706	ATTTT	2	10	148666	148675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009706	ATTAA	2	10	152110	152119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009706	ATTTA	2	10	152134	152143	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009706	TATAG	2	10	152164	152173	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009706	ATTAT	2	10	154175	154184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009706	TATAT	2	10	161939	161948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009706	ATTTT	2	10	161981	161990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009706	AAATG	2	10	162051	162060	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009706	ATTTT	2	10	167646	167655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009706	ATTAA	2	10	169640	169649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009706	AGGAG	2	10	172611	172620	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009706	TCGTG	2	10	173020	173029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009706	GGGAG	2	10	174782	174791	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009706	TAAGT	2	10	175308	175317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009706	AGGAT	2	10	175726	175735	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009706	CAAGA	2	10	177032	177041	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009706	TATAA	2	10	177232	177241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009706	TAAAT	2	10	180116	180125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009706	TTAAA	2	10	180489	180498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009706	ATATT	2	10	181816	181825	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009706	TAAAG	2	10	199568	199577	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009706	TAAAT	2	10	208616	208625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009706	TTAAA	2	10	209184	209193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009706	TGGCT	2	10	236699	236708	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009706	TAATG	2	10	242103	242112	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009706	CAATT	2	10	243944	243953	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009706	AGGTC	2	10	244089	244098	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009706	AGCGA	2	10	245952	245961	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009706	GGGGC	2	10	249268	249277	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009706	ATTTT	2	10	263453	263462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009706	ATAAA	2	10	264800	264809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009706	AGATA	2	10	265775	265784	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009706	AAAAT	2	10	267473	267482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009706	AATTT	2	10	272410	272419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009706	TAATT	2	10	274907	274916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009706	TAAAA	2	10	279076	279085	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009706	TAACT	2	10	283087	283096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009706	TATAA	2	10	283199	283208	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009706	TAATA	4	20	283421	283440	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009706	AAAAT	2	10	285071	285080	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009706	ATTAT	2	10	292073	292082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009706	ATTTT	2	10	297277	297286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009706	TATAA	2	10	298575	298584	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009706	ATTTT	2	10	298629	298638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009706	ACTTG	2	10	302049	302058	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009706	AAAGG	2	10	305357	305366	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009706	ATGAG	2	10	305895	305904	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009706	AATAA	2	10	311807	311816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009706	TATAA	2	10	312853	312862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009706	TATAT	2	10	320434	320443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009706	ATTTT	2	10	322370	322379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009706	TGAGT	2	10	326485	326494	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009706	TGTTA	2	10	331638	331647	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009706	ATATT	2	10	335620	335629	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009706	GTAAA	2	10	339888	339897	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009706	AATAG	2	10	344835	344844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009706	AAAAG	2	10	366117	366126	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009706	AAATT	2	10	370635	370644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009706	TTTAA	2	10	372288	372297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009706	AAAAG	2	10	374723	374732	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009706	ATTTT	2	10	379690	379699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009706	ATAAA	2	10	380872	380881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009706	ATATA	2	10	383295	383304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009706	AAAAT	2	10	389725	389734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009706	ATATA	2	10	390161	390170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009706	ATTAT	2	10	390425	390434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009706	TAACA	2	10	390863	390872	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009706	AATAA	2	10	394262	394271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009706	ATATT	2	10	397104	397113	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009706	GAGTG	2	10	400811	400820	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009706	ATAGA	2	10	408286	408295	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009706	TAAAT	2	10	409318	409327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009706	TATTT	2	10	418930	418939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009706	TAAAT	2	10	420853	420862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009706	ATATA	2	10	420895	420904	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009706	TATAA	2	10	429405	429414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009706	TTTTA	2	10	437192	437201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009706	ATATA	2	10	438266	438275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009706	ATTCA	2	10	445128	445137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009706	AATAA	2	10	448482	448491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009706	ATAAA	2	10	453868	453877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009706	CTTAA	2	10	460098	460107	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009706	ATATA	2	10	460192	460201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009706	GAAAG	2	10	460672	460681	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009706	ATGAA	2	10	460981	460990	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009706	AGGAA	2	10	461400	461409	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009706	TATTT	2	10	462934	462943	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009706	AATTT	2	10	465024	465033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009706	TAGGG	2	10	467263	467272	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009706	TCTTT	2	10	468821	468830	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009706	AATGG	2	10	469360	469369	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009706	GAAGA	2	10	469696	469705	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009706	TCATA	2	10	470078	470087	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009706	TGAAA	2	10	477121	477130	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009706	TATTG	2	10	481267	481276	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009706	GGGGA	2	10	486770	486779	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009706	TTGTT	2	10	503204	503213	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009706	TAATT	2	10	504040	504049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009706	AGTAA	2	10	506295	506304	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009706	GAAAA	2	10	506308	506317	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009706	ATTTT	2	10	509360	509369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009706	ATGTA	2	10	511396	511405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009706	ATAAA	2	10	511877	511886	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009706	TTTAA	2	10	512278	512287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009706	TATAA	2	10	512441	512450	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009706	ATAGT	2	10	518690	518699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009706	TAAGA	2	10	525058	525067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009706	TTATA	2	10	526447	526456	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009706	TGATG	2	10	527442	527451	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_009706	CAAGA	2	10	974835	974844	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_009706	TATAT	2	10	1011421	1011430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_009706	ATTAA	2	10	1021615	1021624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009706	TAAAA	2	10	1026111	1026120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009706	GTAAG	2	10	1038544	1038553	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009706	TAATT	2	10	1039698	1039707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_009706	TATTT	2	10	1050847	1050856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_009706	AAATT	2	10	1051879	1051888	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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