MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland chromosome

Total Repeats: 1197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009699	GGTAA	2	10	9496	9505	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009699	TCGTG	2	10	10287	10296	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009699	TAAGT	2	10	11961	11970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009699	AAAAT	2	10	13812	13821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009699	ATTAT	2	10	22198	22207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009699	ATTAA	2	10	23602	23611	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009699	TATTT	2	10	23674	23683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009699	ATATA	2	10	29280	29289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009699	ATATT	2	10	32889	32898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009699	AATAA	2	10	32947	32956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009699	TAATA	2	10	36499	36508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009699	ATAAA	2	10	36981	36990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009699	TGGTA	2	10	44052	44061	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009699	TCGTG	2	10	44844	44853	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009699	TAAGT	2	10	46582	46591	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009699	AAAAT	2	10	48433	48442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009699	GGTAA	2	10	50571	50580	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009699	TCGTG	2	10	51362	51371	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009699	TAAGT	2	10	53036	53045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009699	AAAAT	2	10	54887	54896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009699	TTATA	2	10	55385	55394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009699	GGTAA	2	10	58371	58380	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009699	TCGTG	2	10	59162	59171	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009699	TAAGT	2	10	60900	60909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009699	AAAAT	2	10	62751	62760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009699	TAAAT	2	10	63331	63340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009699	AAGAA	2	10	63830	63839	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009699	TTATA	2	10	64481	64490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009699	GGTAA	2	10	65376	65385	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009699	TCGTG	2	10	66167	66176	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009699	TAAGT	2	10	67841	67850	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009699	ATTAT	2	10	70938	70947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009699	GGTAA	2	10	71590	71599	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009699	TCGTG	2	10	72381	72390	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009699	TAAGT	2	10	74055	74064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009699	TTGAA	2	10	77242	77251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009699	GAATA	2	10	81329	81338	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009699	AAATT	2	10	88421	88430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009699	ATTTA	2	10	90072	90081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009699	TACAA	2	10	90330	90339	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009699	TTTAA	2	10	90737	90746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009699	AAGTT	2	10	91631	91640	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009699	TATAA	2	10	94187	94196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009699	ATTTT	2	10	95257	95266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009699	TAATA	2	10	95729	95738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009699	TTATG	2	10	114658	114667	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009699	GAAAT	2	10	115357	115366	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009699	TTCTA	2	10	120684	120693	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009699	ATTTT	2	10	136278	136287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009699	TTTAA	2	10	137770	137779	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009699	ACTTA	2	10	149313	149322	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009699	ATAAA	2	10	160677	160686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009699	TAATA	2	10	168862	168871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009699	ATATA	2	10	171380	171389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009699	AAATA	2	10	179917	179926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009699	ATAAA	2	10	179930	179939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009699	ATTAT	2	10	179953	179962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009699	TAATT	2	10	181751	181760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009699	GTCTA	2	10	190874	190883	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009699	TATTT	2	10	190994	191003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009699	AAATA	2	10	194927	194936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009699	TAAAG	2	10	195521	195530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009699	TATTT	2	10	206229	206238	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009699	TAATT	2	10	207793	207802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009699	TTTAT	2	10	211173	211182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009699	GATTT	2	10	218663	218672	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009699	TAAAA	2	10	222224	222233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009699	TAAAA	2	10	222315	222324	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009699	AAATT	2	10	225149	225158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009699	ATTAT	2	10	227668	227677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009699	ATTTA	2	10	228110	228119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009699	TAATT	2	10	232218	232227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009699	TTTTG	2	10	236496	236505	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009699	ATTAT	2	10	238882	238891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009699	TAAAT	2	10	243591	243600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009699	ATTTT	2	10	249578	249587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009699	TTTAT	2	10	249595	249604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009699	AATTT	2	10	251073	251082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009699	TAATT	2	10	262680	262689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009699	GGTTT	2	10	263831	263840	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009699	AATTT	2	10	271966	271975	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009699	ATTTT	2	10	275468	275477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009699	TATAT	2	10	275930	275939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009699	ATATT	2	10	277365	277374	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009699	TTTTA	2	10	278002	278011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009699	ATAGT	2	10	278098	278107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009699	GAAAA	2	10	280020	280029	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009699	TATAA	2	10	280127	280136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009699	TTAAT	2	10	282204	282213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009699	TTAAA	2	10	295752	295761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009699	ATTAA	2	10	297328	297337	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009699	AAATA	2	10	302574	302583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009699	AACTA	2	10	304820	304829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009699	AAAAT	2	10	304933	304942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009699	ATATA	2	10	305870	305879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009699	CTTAT	2	10	310430	310439	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009699	ACTTT	2	10	310702	310711	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009699	TTATA	2	10	321102	321111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009699	AATAA	2	10	326215	326224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009699	ATTAT	2	10	331698	331707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009699	ATACC	2	10	332869	332878	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009699	TAACT	2	10	335103	335112	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009699	AAAAT	2	10	335360	335369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009699	ATATA	2	10	337637	337646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009699	ATGTA	2	10	351087	351096	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009699	ATATA	2	10	351151	351160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009699	ATTAG	2	10	353203	353212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009699	GTAAA	2	10	353333	353342	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009699	TTTAG	2	10	359792	359801	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009699	ATAAA	2	10	359848	359857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009699	ATATA	2	10	359867	359876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009699	TTATT	2	10	361090	361099	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009699	TATTT	2	10	376437	376446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009699	ATTAT	2	10	376486	376495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009699	ACTAT	2	10	378449	378458	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009699	TTATT	2	10	383106	383115	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009699	TTTTA	2	10	383225	383234	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009699	TTTTA	2	10	384388	384397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009699	TCAAT	2	10	384527	384536	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009699	ATATA	2	10	384616	384625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009699	AATAA	2	10	386683	386692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009699	ATTTA	2	10	388456	388465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009699	AAACA	2	10	393238	393247	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009699	AATTT	2	10	399237	399246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009699	TTTAA	2	10	401256	401265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009699	CAGTT	2	10	404167	404176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009699	AAATA	2	10	404233	404242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009699	AATAT	2	10	407314	407323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009699	TTAAT	2	10	414502	414511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009699	TAAAA	2	10	420552	420561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009699	AAAAT	2	10	427424	427433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009699	TATAA	2	10	431676	431685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009699	ATTTT	2	10	433995	434004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009699	TAAAA	2	10	434098	434107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009699	ATATA	2	10	443468	443477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009699	AAAAC	2	10	448034	448043	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009699	AAAAT	2	10	451361	451370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009699	AATAA	2	10	464706	464715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009699	ATTTT	2	10	464815	464824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009699	TGAAA	2	10	464878	464887	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009699	AAAGT	2	10	469674	469683	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009699	AATTT	2	10	472000	472009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009699	TATAA	2	10	472094	472103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009699	TAAAA	2	10	478324	478333	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009699	ATATA	2	10	480619	480628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009699	ATTAA	2	10	490477	490486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009699	TTAAT	2	10	494676	494685	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_009699	TAATT	2	10	496150	496159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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