MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 chromosome

Total Repeats: 36715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009617	TG	3	6	13	18	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009617	TTTATT	2	12	40	51	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009617	TTTA	2	8	76	83	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009617	TAA	2	6	107	112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009617	TTA	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009617	AT	3	6	142	147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009617	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009617	AT	3	6	170	175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009617	TA	3	6	177	182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009617	AT	3	6	197	202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009617	TTG	2	6	217	222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009617	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009617	T	7	7	250	256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009617	GGA	2	6	268	273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009617	TAA	2	6	1644	1649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009617	ATA	2	6	1654	1659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009617	ATA	2	6	1668	1673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009617	T	7	7	1674	1680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009617	TAT	2	6	1686	1691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009617	TTG	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009617	CAA	2	6	1789	1794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009617	CTA	3	9	1806	1814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009617	TTA	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009617	ACT	2	6	1840	1845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009617	ATC	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009617	AATAA	2	10	1869	1878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009617	GGA	2	6	1879	1884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009617	ATT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009617	TA	3	6	3016	3021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009617	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009617	TAA	2	6	4667	4672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009617	TTA	2	6	4676	4681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009617	AGG	2	6	4687	4692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009617	TAA	2	6	9128	9133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009617	T	7	7	9187	9193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009617	TAT	2	6	9199	9204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009617	AT	3	6	9203	9208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009617	AT	3	6	9224	9229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009617	AT	3	6	9232	9237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009617	ATA	2	6	9250	9255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009617	AT	3	6	9258	9263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009617	TAT	2	6	9268	9273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009617	ATT	2	6	9340	9345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009617	A	6	6	9356	9361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009617	TTAA	2	8	9385	9392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009617	A	8	8	9422	9429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009617	GTT	2	6	9438	9443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009617	TGA	2	6	9489	9494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009617	TAA	2	6	9499	9504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009617	GAAA	2	8	9523	9530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009617	GGC	2	6	9653	9658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009617	GCG	2	6	9709	9714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009617	CGA	2	6	9889	9894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009617	GCA	2	6	9963	9968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009617	GCA	2	6	10003	10008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009617	CGC	2	6	10010	10015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009617	GTGA	2	8	10016	10023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009617	GAG	2	6	10078	10083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009617	CAG	2	6	10106	10111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009617	TGC	2	6	10216	10221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009617	GAA	2	6	10298	10303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009617	GCC	2	6	10442	10447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_009617	AGC	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009617	GAA	2	6	10560	10565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009617	GGT	2	6	10632	10637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009617	GTC	2	6	10646	10651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009617	TCGTG	2	10	10655	10664	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009617	GGA	2	6	10758	10763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009617	ATC	2	6	10782	10787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009617	AC	3	6	10809	10814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009617	AG	3	6	10834	10839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009617	AC	3	6	10977	10982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009617	CCT	2	6	11120	11125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009617	ATG	2	6	11150	11155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009617	ATT	2	6	11174	11179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009617	TGTTC	2	10	11225	11234	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009617	TA	3	6	11291	11296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009617	ACA	2	6	11301	11306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009617	AATA	2	8	11315	11322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009617	TAA	2	6	11339	11344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009617	GGA	2	6	11558	11563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009617	AGAA	2	8	11566	11573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009617	TAG	2	6	11587	11592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009617	GCGA	2	8	11595	11602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009617	ACC	2	6	11793	11798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009617	TAC	2	6	11812	11817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009617	TGA	2	6	11819	11824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009617	GGGAG	2	10	11869	11878	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009617	TG	4	8	11927	11934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009617	ATG	2	6	11935	11940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009617	GGA	2	6	12108	12113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009617	AGT	2	6	12235	12240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009617	TAAGT	2	10	12398	12407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009617	AGC	2	6	12454	12459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009617	ACC	2	6	12533	12538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009617	CGT	2	6	12578	12583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009617	TAG	2	6	12645	12650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009617	TCT	2	6	12709	12714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009617	TTA	2	6	12796	12801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009617	AGGAT	2	10	12820	12829	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009617	GCTA	2	8	12832	12839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009617	CAA	2	6	12889	12894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009617	AG	4	8	12965	12972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009617	AGT	2	6	12974	12979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009617	GAG	2	6	13009	13014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009617	GAA	2	6	13033	13038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009617	CGG	2	6	13258	13263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009617	TGG	2	6	13508	13513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009617	GTT	2	6	13518	13523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009617	ACC	2	6	13529	13534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009617	CCT	2	6	13617	13622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009617	GGT	2	6	13753	13758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009617	TCG	2	6	13868	13873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009617	CGT	2	6	13948	13953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009617	GAG	2	6	13997	14002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009617	GTT	2	6	14051	14056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009617	CTGA	2	8	14223	14230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009617	TG	3	6	14288	14293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009617	AAT	2	6	14306	14311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009617	ATA	2	6	14329	14334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009617	TTGT	2	8	14354	14361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009617	TGA	2	6	14372	14377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009617	TG	3	6	14456	14461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009617	AGTTA	2	10	14502	14511	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009617	AAG	2	6	14512	14517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009617	CCA	2	6	14599	14604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009617	CCA	2	6	14676	14681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_009617	AAG	2	6	14684	14689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009617	T	7	7	14709	14715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009617	ATT	2	6	14724	14729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009617	TATG	2	8	14734	14741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009617	AGG	2	6	15286	15291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009617	TAT	2	6	17483	17488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009617	AAT	2	6	17489	17494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009617	TAA	2	6	17501	17506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009617	ATAAGT	2	12	17527	17538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009617	ATA	3	9	17546	17554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009617	GCGT	2	8	17614	17621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009617	T	7	7	17661	17667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009617	GGA	2	6	17691	17696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009617	TCC	2	6	17772	17777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_009617	TAAT	2	8	17814	17821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009617	AT	3	6	17837	17842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009617	TTG	2	6	17848	17853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009617	TA	3	6	17860	17865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009617	AATA	2	8	17875	17882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009617	ATT	2	6	17899	17904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009617	A	6	6	17948	17953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009617	AATA	2	8	17967	17974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009617	ATAA	2	8	17982	17989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009617	TGT	2	6	18012	18017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_009617	GGA	2	6	18134	18139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009617	TCC	2	6	18215	18220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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157	NC_009617	TAAA	2	8	18278	18285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009617	TAAT	2	8	18298	18305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_009617	GA	3	6	22421	22426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_009617	ATT	2	6	29377	29382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_009617	AAT	2	6	46641	46646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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