MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 chromosome

Total Repeats: 1187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009495	GGTAA	2	10	9510	9519	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009495	TCGTG	2	10	10301	10310	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009495	TAAGT	2	10	12038	12047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009495	ATTAT	2	10	22273	22282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009495	TTTAA	2	10	23657	23666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009495	ATTAA	2	10	23677	23686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009495	TATTT	2	10	23749	23758	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009495	TTTTA	2	10	26410	26419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009495	AATTA	2	10	26491	26500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009495	ATATT	2	10	26552	26561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009495	TTAAT	2	10	26965	26974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009495	TAAAT	2	10	33647	33656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009495	ATATA	2	10	33935	33944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009495	ATATT	2	10	37532	37541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009495	AATAA	2	10	37590	37599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009495	TAATA	2	10	41142	41151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009495	ATAAA	2	10	41624	41633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009495	GGTAA	2	10	48696	48705	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009495	TCGTG	2	10	49487	49496	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009495	TAAGT	2	10	51225	51234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009495	AAAAT	2	10	53076	53085	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009495	GGTAA	2	10	55324	55333	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009495	TCGTG	2	10	56115	56124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009495	TAAGT	2	10	58006	58015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009495	AAAAT	2	10	59857	59866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009495	TTATA	2	10	60436	60445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009495	GGTAA	2	10	63422	63431	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009495	TCGTG	2	10	64213	64222	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009495	TAAGT	2	10	65951	65960	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009495	AAAAT	2	10	67802	67811	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009495	TGATT	2	10	68192	68201	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009495	TAAAT	2	10	68436	68445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009495	TTATA	2	10	69586	69595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009495	GGTAA	2	10	70481	70490	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009495	TCGTG	2	10	71272	71281	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009495	TAAGT	2	10	73009	73018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009495	AAAAT	2	10	74860	74869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009495	ATTAT	2	10	76110	76119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009495	TCGTG	2	10	77553	77562	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009495	TAAGT	2	10	79291	79300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009495	AAAAT	2	10	81142	81151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009495	ATTTT	2	10	81627	81636	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009495	TTGAA	2	10	82548	82557	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009495	GAATA	2	10	86635	86644	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009495	AATAT	2	10	89247	89256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009495	AAATT	2	10	93726	93735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009495	ATTTA	2	10	95377	95386	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009495	CAATA	2	10	95637	95646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009495	TTTAA	2	10	96043	96052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009495	AAGTT	2	10	96937	96946	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009495	TAAAT	2	10	98398	98407	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009495	TATAA	2	10	99493	99502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009495	ATTTT	2	10	100563	100572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009495	TAATA	2	10	101035	101044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009495	GTTAT	2	10	119852	119861	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009495	GAAAT	2	10	120552	120561	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009495	TAAAA	2	10	122706	122715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009495	ATTTT	2	10	141469	141478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009495	TTTAA	2	10	142961	142970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009495	ACTTA	2	10	154507	154516	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009495	ATAAA	2	10	165737	165746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009495	TAATA	2	10	173870	173879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009495	ATATA	2	10	176388	176397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009495	AAATA	2	10	184927	184936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009495	ATAAA	2	10	184940	184949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009495	ATTAT	2	10	184963	184972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009495	TAATT	2	10	186761	186770	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009495	TATTT	2	10	195947	195956	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009495	TAAAG	2	10	200473	200482	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009495	ATATG	2	10	200557	200566	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009495	TATTT	2	10	211178	211187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009495	TAATT	2	10	212610	212619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009495	TTTAT	2	10	215990	215999	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009495	GATTT	2	10	223480	223489	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009495	TAAAA	2	10	227040	227049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009495	TAAAA	2	10	227131	227140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009495	AAATT	2	10	229965	229974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009495	ATTAT	2	10	232459	232468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009495	ATTTA	2	10	232901	232910	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009495	AATAA	2	10	235514	235523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009495	TAATT	2	10	237009	237018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009495	TTTTG	2	10	241106	241115	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009495	ATTAT	2	10	241182	241191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009495	ATTAT	2	10	243497	243506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009495	TAAAT	2	10	248025	248034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009495	TAATA	2	10	251559	251568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009495	TTTAT	2	10	254030	254039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009495	TAATT	2	10	267107	267116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009495	GGTTT	2	10	268259	268268	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009495	AATTT	2	10	276392	276401	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009495	GAAAT	2	10	280793	280802	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009495	TTTTA	2	10	281100	281109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009495	ATGGA	2	10	281167	281176	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009495	ATAGT	2	10	281196	281205	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009495	TTTTA	2	10	289401	289410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009495	ATTAA	2	10	291834	291843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009495	AAATA	2	10	297023	297032	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009495	AACTA	2	10	299268	299277	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009495	AAAAT	2	10	299381	299390	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009495	TATAA	2	10	300319	300328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009495	CTTAT	2	10	304163	304172	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009495	ACTTT	2	10	304435	304444	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009495	AAGAT	2	10	305472	305481	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009495	AATAA	2	10	320018	320027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009495	ATTAT	2	10	325502	325511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009495	TAACT	2	10	328915	328924	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009495	AAAAT	2	10	329172	329181	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009495	ATATA	2	10	331557	331566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009495	AAAGG	2	10	335603	335612	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009495	ATATA	2	10	344998	345007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009495	ATTAG	2	10	347051	347060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009495	GTAAA	2	10	347181	347190	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009495	TTTAG	2	10	353523	353532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009495	ATAAA	2	10	353579	353588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009495	ATATA	2	10	353598	353607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009495	TTTAT	2	10	354820	354829	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009495	TCCTT	2	10	360446	360455	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009495	ATTTT	2	10	361828	361837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009495	ATTTT	2	10	363215	363224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009495	ATATA	2	10	369539	369548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009495	TATTT	2	10	372197	372206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009495	ACTAT	2	10	374209	374218	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009495	TTTTA	2	10	378234	378243	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009495	TTTTA	2	10	379397	379406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009495	ATATA	2	10	379625	379634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009495	AATAA	2	10	381721	381730	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009495	ATTTA	2	10	383494	383503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009495	AATTA	2	10	383540	383549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009495	AAACA	2	10	388290	388299	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009495	ATAAA	2	10	390831	390840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009495	ACATT	2	10	390978	390987	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009495	AATTT	2	10	394327	394336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009495	TTTAA	2	10	396344	396353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009495	AAATA	2	10	399214	399223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009495	ATATA	2	10	402296	402305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009495	TTAAT	2	10	409483	409492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009495	AAAAT	2	10	412363	412372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009495	TTTAG	2	10	412393	412402	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009495	TAAAA	2	10	415249	415258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009495	TATAA	2	10	426295	426304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009495	ATTTT	2	10	428608	428617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009495	TAAAA	2	10	428711	428720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009495	ATATA	2	10	438123	438132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009495	ATCAC	2	10	442732	442741	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_009495	AAAAT	2	10	445716	445725	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009495	GACAT	2	10	445768	445777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009495	AAATA	2	10	454571	454580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009495	AAAGT	2	10	459245	459254	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009495	AATTT	2	10	461598	461607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009495	TATAA	2	10	461692	461701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_009495	AAATA	2	10	837427	837436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_009495	TAAAG	2	10	841238	841247	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_009495	GATAT	2	10	850585	850594	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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