MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 1435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009480	CGGC	3	12	1562	1573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009480	CTCG	2	8	11536	11543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009480	CTGG	2	8	16155	16162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009480	GGGC	2	8	18058	18065	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009480	GAGT	2	8	38755	38762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009480	TCGA	2	8	39033	39040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009480	TGGT	2	8	39552	39559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009480	GCCG	2	8	39862	39869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009480	GAAG	2	8	43969	43976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009480	CACG	2	8	44632	44639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009480	GGAC	2	8	45114	45121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009480	TGAT	2	8	45965	45972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009480	TGGC	2	8	46571	46578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009480	ATAG	2	8	46666	46673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009480	CGAT	2	8	46802	46809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009480	GCCG	2	8	47613	47620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009480	CGGG	2	8	47665	47672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009480	GCGT	2	8	48452	48459	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009480	CATG	2	8	51379	51386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009480	CCGC	2	8	52623	52630	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_009480	CGGC	2	8	53785	53792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009480	CTTC	2	8	54902	54909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009480	CGGG	2	8	55648	55655	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009480	GGGC	2	8	56019	56026	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009480	GCCG	2	8	56674	56681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009480	GACA	2	8	56709	56716	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009480	ATGA	2	8	57563	57570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009480	GGAA	2	8	58082	58089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009480	AGTC	2	8	58153	58160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009480	AGGC	2	8	58170	58177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009480	AGGT	2	8	58619	58626	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009480	GTTC	2	8	58750	58757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009480	GCTC	2	8	58889	58896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009480	ATAG	2	8	58937	58944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009480	TTTG	2	8	58948	58955	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009480	CGGG	2	8	59051	59058	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009480	GACA	2	8	59078	59085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009480	CGGC	2	8	59344	59351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009480	CTCC	2	8	59694	59701	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_009480	CTCG	2	8	59795	59802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009480	TGCG	2	8	60679	60686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009480	GCAC	2	8	60885	60892	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009480	GCGT	2	8	61362	61369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009480	GGTC	2	8	62770	62777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009480	TCGA	2	8	63151	63158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009480	CGAA	2	8	63328	63335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009480	GACG	2	8	64382	64389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009480	CGCT	2	8	64437	64444	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009480	CGGC	2	8	65008	65015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009480	GCCC	2	8	65100	65107	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_009480	CGGC	2	8	65450	65457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009480	CTCG	2	8	67494	67501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009480	GAGC	2	8	68959	68966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009480	CCAC	2	8	69000	69007	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_009480	CCGA	2	8	70483	70490	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009480	CGGC	2	8	70602	70609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009480	TTTG	2	8	71773	71780	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009480	GGGC	2	8	71890	71897	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009480	CCGG	2	8	72441	72448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009480	CGGC	2	8	72742	72749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009480	TGAT	2	8	72792	72799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009480	GGTC	2	8	73082	73089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009480	CGAC	2	8	73189	73196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009480	TAAG	2	8	73850	73857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009480	CCGG	2	8	73959	73966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009480	TACC	2	8	74095	74102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009480	AGTC	2	8	74498	74505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009480	ACGC	2	8	74515	74522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009480	GAAG	2	8	76009	76016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009480	AAGG	2	8	76281	76288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009480	GCTG	2	8	78648	78655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009480	CCGC	2	8	78803	78810	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_009480	CGAG	2	8	79796	79803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009480	GTCG	2	8	79909	79916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009480	GCCG	2	8	81467	81474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009480	AGGA	2	8	81680	81687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009480	CGGC	2	8	81998	82005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009480	CCCG	2	8	82277	82284	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_009480	CGAG	2	8	84225	84232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009480	CGGC	2	8	84403	84410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009480	GCGG	2	8	84509	84516	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009480	AGCG	2	8	85012	85019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009480	GGCG	2	8	87006	87013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009480	CGCC	2	8	87787	87794	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_009480	TGAA	2	8	89698	89705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009480	GCGT	2	8	89968	89975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009480	CCCT	2	8	90350	90357	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_009480	CCGT	2	8	90541	90548	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009480	GCTA	2	8	95661	95668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009480	AGCA	2	8	95675	95682	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009480	TGGC	2	8	95705	95712	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009480	TGCA	2	8	95958	95965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009480	GCCC	2	8	95995	96002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_009480	TGTC	2	8	96049	96056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009480	CGGC	2	8	102767	102774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009480	CCGG	2	8	102812	102819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009480	CGAG	2	8	103049	103056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009480	GCGG	2	8	104410	104417	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009480	CAGC	2	8	104548	104555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009480	ATGA	2	8	104780	104787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009480	CCGT	2	8	104942	104949	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009480	GGCC	2	8	105422	105429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009480	GCCG	2	8	105489	105496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009480	CGGA	2	8	105578	105585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009480	ACGG	2	8	105729	105736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009480	GCGT	2	8	107044	107051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009480	TGCC	2	8	108872	108879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009480	CGCC	2	8	109746	109753	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_009480	CTAG	2	8	110392	110399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009480	GTCC	2	8	110981	110988	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009480	TTGC	2	8	111897	111904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009480	CGGC	2	8	112085	112092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009480	ACCG	2	8	112093	112100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009480	CGGC	2	8	112401	112408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009480	CGAG	2	8	114638	114645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009480	CCGT	2	8	114757	114764	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009480	GCAC	2	8	114778	114785	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009480	CCAT	2	8	115336	115343	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009480	AGCC	2	8	116031	116038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009480	GGGC	2	8	116238	116245	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009480	GACC	2	8	116256	116263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009480	GCGG	2	8	130861	130868	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009480	TGCG	2	8	133820	133827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009480	TGAG	2	8	133918	133925	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009480	CGAT	2	8	149848	149855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009480	CCCG	2	8	158807	158814	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_009480	TGCG	2	8	159208	159215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009480	GCTC	2	8	159240	159247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009480	AACC	2	8	165090	165097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009480	ACCC	2	8	170358	170365	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_009480	ACCC	2	8	170373	170380	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_009480	ACCC	2	8	170388	170395	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_009480	TATC	2	8	182011	182018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009480	AGCG	2	8	186428	186435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009480	TCGG	2	8	187939	187946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009480	GGGA	2	8	187950	187957	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009480	CGCC	2	8	188008	188015	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_009480	GCCC	2	8	188048	188055	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_009480	TCCT	2	8	191414	191421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009480	ACCG	2	8	193718	193725	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009480	GCCC	2	8	197773	197780	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_009480	CCGC	2	8	203501	203508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_009480	GGGT	2	8	203628	203635	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009480	GATC	2	8	204330	204337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009480	GTCG	2	8	207435	207442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009480	GGTC	2	8	207444	207451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009480	CGAG	2	8	211222	211229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009480	CACC	2	8	213859	213866	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_009480	CGGC	2	8	217159	217166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009480	CCGG	3	12	218669	218680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_009480	CCGC	2	8	223431	223438	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
152	NC_009480	GATG	2	8	229740	229747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009480	CGCT	2	8	231491	231498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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159	NC_009480	TGCG	2	8	261752	261759	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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297	NC_009480	CGTG	2	8	603808	603815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
298	NC_009480	GACA	2	8	603936	603943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
299	NC_009480	GCCC	2	8	603992	603999	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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