MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009480	CCG	2	6	976044	976049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_009480	CTC	2	6	976092	976097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_009480	CGT	2	6	976103	976108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_009480	CT	3	6	976111	976116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_009480	CAC	3	9	978687	978695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_009480	CGT	2	6	978703	978708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_009480	GCG	2	6	978721	978726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_009480	TCC	2	6	978757	978762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_009480	GGATG	2	10	978795	978804	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_009480	CGCGC	2	10	980718	980727	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3511	NC_009480	GTC	2	6	980781	980786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_009480	CCT	2	6	980905	980910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_009480	TG	3	6	980929	980934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_009480	CGA	2	6	981558	981563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_009480	ACACC	2	10	981565	981574	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3516	NC_009480	CAC	2	6	981981	981986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_009480	CGT	2	6	982032	982037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_009480	GGC	2	6	982049	982054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_009480	CGGG	2	8	983697	983704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_009480	CGAGG	2	10	983748	983757	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3521	NC_009480	ACCC	2	8	984296	984303	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3522	NC_009480	CATC	2	8	984309	984316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_009480	CGCAC	2	10	984317	984326	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3524	NC_009480	AGG	2	6	984342	984347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_009480	CG	3	6	985594	985599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_009480	CCCG	2	8	985625	985632	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3527	NC_009480	CTCC	2	8	986660	986667	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3528	NC_009480	TCG	2	6	986686	986691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_009480	CG	3	6	986699	986704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_009480	GAT	2	6	986743	986748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_009480	CGC	2	6	986780	986785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_009480	A	7	7	986872	986878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_009480	ACGC	2	8	986910	986917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_009480	CGG	2	6	986927	986932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_009480	CCG	2	6	988353	988358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_009480	CG	3	6	988420	988425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_009480	CCCGG	2	10	990444	990453	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3538	NC_009480	CG	3	6	990463	990468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_009480	GGC	2	6	990469	990474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_009480	CGT	3	9	990480	990488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_009480	GA	3	6	990510	990515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_009480	CCGC	3	12	992446	992457	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3543	NC_009480	CGG	2	6	992460	992465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_009480	CTG	2	6	994015	994020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_009480	CCGGC	2	10	994042	994051	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3546	NC_009480	GGAC	2	8	994054	994061	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_009480	CGGG	2	8	994121	994128	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_009480	CCG	2	6	995537	995542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_009480	GCCCG	2	10	995543	995552	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3550	NC_009480	CG	3	6	995551	995556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_009480	CACC	2	8	995559	995566	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3552	NC_009480	AG	3	6	995568	995573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_009480	CGC	2	6	996768	996773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_009480	GCG	2	6	996782	996787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_009480	GGT	2	6	997561	997566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_009480	TCG	2	6	997572	997577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_009480	GAC	2	6	997582	997587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_009480	GCC	2	6	997618	997623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_009480	CGGA	2	8	997719	997726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_009480	GCC	2	6	998767	998772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_009480	CTC	2	6	998780	998785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_009480	GCC	2	6	998790	998795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_009480	GGCGT	2	10	998814	998823	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3564	NC_009480	GT	3	6	998850	998855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_009480	GC	3	6	1002904	1002909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_009480	CAG	3	9	1002914	1002922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3569	NC_009480	CCGG	2	8	1004099	1004106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_009480	ACGC	2	8	1004110	1004117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_009480	GCCG	2	8	1004142	1004149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_009480	CGGC	2	8	1004157	1004164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_009480	GCG	2	6	1004175	1004180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_009480	CCG	2	6	1004186	1004191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3577	NC_009480	CAC	2	6	1004219	1004224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_009480	CA	3	6	1004229	1004234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_009480	AGGC	2	8	1004239	1004246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3582	NC_009480	TCG	2	6	1007073	1007078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_009480	TCCG	2	8	1007092	1007099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_009480	TCG	2	6	1007145	1007150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_009480	GC	3	6	1007178	1007183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3588	NC_009480	TCGTG	2	10	1007299	1007308	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3593	NC_009480	CG	3	6	1008661	1008666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_009480	CCG	2	6	1008676	1008681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_009480	GCC	2	6	1010785	1010790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_009480	GCGCG	2	10	1010791	1010800	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3597	NC_009480	TCC	2	6	1011254	1011259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_009480	AGC	2	6	1011322	1011327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_009480	CGCA	2	8	1011343	1011350	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_009480	GC	3	6	1011355	1011360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_009480	GCGT	2	8	1011365	1011372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_009480	TCC	2	6	1011721	1011726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_009480	GGA	2	6	1011777	1011782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_009480	CG	4	8	1011809	1011816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_009480	GGA	2	6	1011830	1011835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_009480	ATGC	2	8	1012823	1012830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_009480	CG	3	6	1013941	1013946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_009480	GC	4	8	1013975	1013982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_009480	GCACGC	2	12	1014003	1014014	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_009480	TCC	2	6	1014021	1014026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_009480	C	6	6	1014038	1014043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3612	NC_009480	GTC	2	6	1017976	1017981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_009480	CGT	2	6	1017988	1017993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_009480	CGT	2	6	1018003	1018008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_009480	CG	3	6	1018018	1018023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_009480	GGC	2	6	1018036	1018041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_009480	GCGG	2	8	1018052	1018059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_009480	GAC	2	6	1018060	1018065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_009480	CGG	2	6	1018092	1018097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_009480	GGGC	2	8	1018161	1018168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_009480	CGA	2	6	1018204	1018209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_009480	CCG	2	6	1018215	1018220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_009480	GGA	2	6	1018254	1018259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_009480	TCC	2	6	1018332	1018337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_009480	CGG	2	6	1018365	1018370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_009480	AGT	2	6	1021313	1021318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_009480	TGCG	2	8	1021409	1021416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_009480	ACG	2	6	1021429	1021434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_009480	CAG	2	6	1021487	1021492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_009480	GAG	2	6	1021522	1021527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_009480	GCC	2	6	1021531	1021536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3632	NC_009480	CG	4	8	1021546	1021553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3633	NC_009480	CG	3	6	1021555	1021560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3634	NC_009480	GCC	2	6	1022229	1022234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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